28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0250 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0250  D-alanyl carrier protein  100 
 
 		 79 aa  159  1e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.22726  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0287  D-alanyl transfer protein  53.95 
 
 		 77 aa  85.9  2e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.14826  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1816  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 2  51.95 
 
 		 79 aa  77.4  0.00000000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000233784  hitchhiker  0.0000200669 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1815  D-alanyl carrier protein  48.68 
 
 		 78 aa  72.8  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0475317  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0804  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 2  43.04 
 
 		 79 aa  67  0.00000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.764285  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1788  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 2  37.97 
 
 		 79 aa  62.4  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1372  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 2  42.67 
 
 		 79 aa  60.8  0.000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.896252  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1090  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 2  40 
 
 		 79 aa  57  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0934  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 2  36.36 
 
 		 78 aa  56.6  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.506385  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0953  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 2  36.36 
 
 		 78 aa  56.6  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.798943  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1485  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 2  38.67 
 
 		 79 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1459  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 2  38.67 
 
 		 79 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3922  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 2  38.67 
 
 		 79 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.864811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1422  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 2  38.67 
 
 		 79 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1528  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 2  38.67 
 
 		 79 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1292  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 2  38.67 
 
 		 79 aa  54.3  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.133967  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1387  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 2  38.67 
 
 		 79 aa  54.3  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1259  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 2  38.67 
 
 		 79 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1257  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 2  38.67 
 
 		 79 aa  54.3  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1285  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 2  38.67 
 
 		 79 aa  54.3  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0443  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 2  32.47 
 
 		 79 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0520  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 2  33.77 
 
 		 78 aa  52.8  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1791  D-alanyl carrier protein  32.43 
 
 		 81 aa  50.1  0.000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.401624  normal  0.920733 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0167  D-alanyl carrier protein  34.78 
 
 		 77 aa  47.4  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.021153  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1719  acyl carrier protein  37.04 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6023  acyl carrier protein  33.77 
 
 		 83 aa  40.4  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2938  phosphopantetheine-binding  35.85 
 
 		 79 aa  40  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.964017  normal  0.466859 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0184  phosphopantetheine-binding  37.29 
 
 		 84 aa  40  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>