16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2938 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_2938  phosphopantetheine-binding  100 
 
 
79 aa  154  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.964017  normal  0.466859 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29828  predicted protein  31.58 
 
 
4962 aa  46.2  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1246  hypothetical protein  32.91 
 
 
84 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2955  hypothetical protein  37.66 
 
 
87 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0941  acyl carrier protein  40 
 
 
73 aa  42.7  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2909  acyl carrier protein  33.33 
 
 
73 aa  43.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1366  acyl carrier protein  33.33 
 
 
73 aa  43.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1325  acyl carrier protein  32.89 
 
 
79 aa  42.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0876  acyl carrier protein  36.36 
 
 
84 aa  41.6  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0352  hypothetical protein  37.5 
 
 
84 aa  40.8  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3379  acyl carrier protein, putative  37.5 
 
 
86 aa  40.8  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2863  hypothetical protein  37.7 
 
 
87 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.444937  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1689  phosphopantetheine-binding protein  37.29 
 
 
85 aa  40.4  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.932601  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1488  acyl carrier protein  35.59 
 
 
92 aa  40.4  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4378  acyl carrier protein  38.98 
 
 
89 aa  40.4  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00196249  normal  0.158568 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0250  D-alanyl carrier protein  35.85 
 
 
79 aa  40  0.009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.22726  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>