37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_6023 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_6023  acyl carrier protein  100 
 
 		 83 aa  166  9e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1477  acyl carrier protein  71.08 
 
 		 83 aa  123  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3796  acyl carrier protein  69.88 
 
 		 83 aa  118  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0022968  normal  0.531414 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4125  acyl carrier protein  68.67 
 
 		 83 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.276699  normal  0.797115 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5836  acyl carrier protein  45.78 
 
 		 83 aa  77  0.00000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0184  phosphopantetheine-binding  51.32 
 
 		 84 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2525  acyl carrier protein  45.78 
 
 		 83 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.443758  normal  0.0225016 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1576  phosphopantetheine-binding protein  47.95 
 
 		 78 aa  73.2  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0249084  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4111  acyl carrier protein  49.32 
 
 		 83 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0894098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3637  acyl carrier protein  49.32 
 
 		 83 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.347013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1719  acyl carrier protein  44.58 
 
 		 83 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1804  acyl carrier protein  49.32 
 
 		 83 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.179626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4152  acyl carrier protein  50.72 
 
 		 103 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.43157  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4214  acyl carrier protein  50.72 
 
 		 103 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.310426 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3303  acyl carrier protein  50.72 
 
 		 103 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.516345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0642  acyl carrier protein  44.74 
 
 		 83 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0656  acyl carrier protein  44.74 
 
 		 83 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0819  acyl carrier protein  44.74 
 
 		 114 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2511  acyl carrier protein  44.74 
 
 		 83 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.161811  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0043  acyl carrier protein  44.74 
 
 		 83 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2889  acyl carrier protein  44.74 
 
 		 83 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2196  acyl carrier protein  44.74 
 
 		 83 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5360  acyl carrier protein  44.58 
 
 		 83 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4391  acyl carrier protein  46.58 
 
 		 83 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0532  acyl carrier protein  43.42 
 
 		 83 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1076  acyl carrier protein  42.11 
 
 		 82 aa  68.6  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.414724  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0165  acyl carrier protein  40.26 
 
 		 79 aa  65.1  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2037  acyl carrier protein  34.94 
 
 		 86 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.571719 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1094  hypothetical protein  40.35 
 
 		 90 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3057  phosphopantetheine-binding  34.92 
 
 		 82 aa  43.9  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.245048  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7015  phosphopantetheine-binding  37.5 
 
 		 90 aa  43.9  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00543693 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0991  hypothetical protein  40.38 
 
 		 89 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.151237 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4598  hypothetical protein  47.17 
 
 		 89 aa  41.6  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.180568  normal  0.075328 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5059  hypothetical protein  47.17 
 
 		 89 aa  41.6  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.719607  normal  0.463423 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3404  hypothetical protein  42.59 
 
 		 91 aa  40.4  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.04727  normal  0.0784333 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0250  D-alanyl carrier protein  33.77 
 
 		 79 aa  40.4  0.008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.22726  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4417  hypothetical protein  41.51 
 
 		 92 aa  40.4  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>