32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3057 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3057  phosphopantetheine-binding  100 
 
 		 82 aa  163  9e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.245048  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0682  phosphopantetheine-binding  55.13 
 
 		 80 aa  88.2  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7015  phosphopantetheine-binding  48.65 
 
 		 90 aa  68.2  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00543693 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2687  phosphopantetheine-binding  46.75 
 
 		 82 aa  57.4  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.161716  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1081  phosphopantetheine-binding protein  43.24 
 
 		 81 aa  48.9  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.431023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2776  hypothetical protein  35 
 
 		 82 aa  48.1  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0180647  decreased coverage  0.000606651 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1076  acyl carrier protein  35.62 
 
 		 82 aa  46.6  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.414724  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0275  hypothetical protein  40.3 
 
 		 83 aa  45.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0227705  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1477  acyl carrier protein  33.33 
 
 		 83 aa  45.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0184  phosphopantetheine-binding  32.79 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1617  acyl carrier protein  34.78 
 
 		 89 aa  44.3  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.250547 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6023  acyl carrier protein  34.92 
 
 		 83 aa  43.9  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0819  acyl carrier protein  41.67 
 
 		 114 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0642  acyl carrier protein  42.55 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0656  acyl carrier protein  42.55 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1037  phosphopantetheine-binding  36.23 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2776  Acyl carrier protein, AcpP  48.72 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1418  phosphopantetheine-binding  48.72 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.819274  normal  0.36565 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0165  acyl carrier protein  39.62 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0043  acyl carrier protein  40.43 
 
 		 83 aa  42  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4125  acyl carrier protein  30.14 
 
 		 83 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.276699  normal  0.797115 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4417  hypothetical protein  32.31 
 
 		 92 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2511  acyl carrier protein  40.43 
 
 		 83 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.161811  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2196  acyl carrier protein  40.43 
 
 		 83 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2889  acyl carrier protein  40.43 
 
 		 83 aa  42  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3404  hypothetical protein  38.98 
 
 		 91 aa  41.6  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.04727  normal  0.0784333 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3796  acyl carrier protein  31.08 
 
 		 83 aa  41.2  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0022968  normal  0.531414 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3122  hypothetical protein  43.48 
 
 		 94 aa  41.2  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0034  phosphopantetheine-binding  37.7 
 
 		 100 aa  41.2  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2525  acyl carrier protein  35.48 
 
 		 83 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.443758  normal  0.0225016 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0532  acyl carrier protein  40.43 
 
 		 83 aa  40.8  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80821  mitochondrial acyl carrier protein  30.77 
 
 		 128 aa  40.4  0.009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.454049  normal  0.13999 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>