39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0165 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0165  acyl carrier protein  100 
 
 		 79 aa  156  8e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1076  acyl carrier protein  50.67 
 
 		 82 aa  81.6  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.414724  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1576  phosphopantetheine-binding protein  50 
 
 		 78 aa  77  0.00000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0249084  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2525  acyl carrier protein  51.39 
 
 		 83 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.443758  normal  0.0225016 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1719  acyl carrier protein  49.33 
 
 		 83 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3796  acyl carrier protein  44.59 
 
 		 83 aa  72.8  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0022968  normal  0.531414 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4125  acyl carrier protein  44.59 
 
 		 83 aa  71.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.276699  normal  0.797115 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1477  acyl carrier protein  45.21 
 
 		 83 aa  69.7  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5836  acyl carrier protein  43.06 
 
 		 83 aa  65.9  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5360  acyl carrier protein  41.67 
 
 		 83 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6023  acyl carrier protein  40.26 
 
 		 83 aa  65.1  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0532  acyl carrier protein  42.67 
 
 		 83 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0642  acyl carrier protein  42.67 
 
 		 83 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0656  acyl carrier protein  42.67 
 
 		 83 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0819  acyl carrier protein  42.67 
 
 		 114 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2889  acyl carrier protein  42.67 
 
 		 83 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2196  acyl carrier protein  42.67 
 
 		 83 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2511  acyl carrier protein  42.67 
 
 		 83 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.161811  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0043  acyl carrier protein  42.67 
 
 		 83 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4152  acyl carrier protein  42.67 
 
 		 103 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.43157  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4214  acyl carrier protein  42.67 
 
 		 103 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.310426 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1804  acyl carrier protein  42.67 
 
 		 83 aa  62  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.179626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3303  acyl carrier protein  42.67 
 
 		 103 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.516345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3637  acyl carrier protein  58 
 
 		 83 aa  62  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.347013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4111  acyl carrier protein  58 
 
 		 83 aa  62  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0894098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4391  acyl carrier protein  41.67 
 
 		 83 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2037  acyl carrier protein  37.66 
 
 		 86 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.571719 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0184  phosphopantetheine-binding  36.99 
 
 		 84 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4417  hypothetical protein  46.94 
 
 		 92 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2687  phosphopantetheine-binding  34.18 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.161716  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3404  hypothetical protein  50 
 
 		 91 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.04727  normal  0.0784333 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0682  phosphopantetheine-binding  31.58 
 
 		 80 aa  45.1  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5080  hypothetical protein  40.38 
 
 		 90 aa  43.5  0.0009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4598  hypothetical protein  36.07 
 
 		 89 aa  42.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.180568  normal  0.075328 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3057  phosphopantetheine-binding  39.62 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.245048  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5059  hypothetical protein  36.07 
 
 		 89 aa  42.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.719607  normal  0.463423 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0275  hypothetical protein  33.77 
 
 		 83 aa  41.6  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0227705  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1094  hypothetical protein  39.58 
 
 		 90 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2776  hypothetical protein  28.21 
 
 		 82 aa  40  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0180647  decreased coverage  0.000606651 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>