36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5836 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5836  acyl carrier protein  100 
 
 		 83 aa  164  4e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5360  acyl carrier protein  74.7 
 
 		 83 aa  124  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2525  acyl carrier protein  67.47 
 
 		 83 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.443758  normal  0.0225016 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1719  acyl carrier protein  66.27 
 
 		 83 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0532  acyl carrier protein  54.22 
 
 		 83 aa  95.5  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0656  acyl carrier protein  53.01 
 
 		 83 aa  93.6  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0642  acyl carrier protein  53.01 
 
 		 83 aa  93.6  8e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0819  acyl carrier protein  53.01 
 
 		 114 aa  92.8  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0043  acyl carrier protein  51.81 
 
 		 83 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2511  acyl carrier protein  51.81 
 
 		 83 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.161811  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2889  acyl carrier protein  51.81 
 
 		 83 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2196  acyl carrier protein  51.81 
 
 		 83 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4111  acyl carrier protein  50.6 
 
 		 83 aa  90.5  7e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0894098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3637  acyl carrier protein  50.6 
 
 		 83 aa  90.5  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.347013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4391  acyl carrier protein  51.81 
 
 		 83 aa  89.7  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2037  acyl carrier protein  53.01 
 
 		 86 aa  90.1  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.571719 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1804  acyl carrier protein  50.6 
 
 		 83 aa  90.1  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.179626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4152  acyl carrier protein  49.4 
 
 		 103 aa  87.4  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.43157  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4214  acyl carrier protein  49.4 
 
 		 103 aa  87.4  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.310426 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3303  acyl carrier protein  49.4 
 
 		 103 aa  87.4  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.516345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1477  acyl carrier protein  45.78 
 
 		 83 aa  79.3  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3796  acyl carrier protein  43.37 
 
 		 83 aa  77.8  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0022968  normal  0.531414 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6023  acyl carrier protein  45.78 
 
 		 83 aa  77  0.00000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4125  acyl carrier protein  42.17 
 
 		 83 aa  74.7  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.276699  normal  0.797115 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1576  phosphopantetheine-binding protein  41.56 
 
 		 78 aa  69.7  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0249084  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0165  acyl carrier protein  43.06 
 
 		 79 aa  65.9  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1076  acyl carrier protein  41.33 
 
 		 82 aa  63.9  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.414724  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0184  phosphopantetheine-binding  38.46 
 
 		 84 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5059  hypothetical protein  46.15 
 
 		 89 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.719607  normal  0.463423 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7015  phosphopantetheine-binding  39.13 
 
 		 90 aa  44.7  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00543693 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4598  hypothetical protein  46.15 
 
 		 89 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.180568  normal  0.075328 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4417  hypothetical protein  44 
 
 		 92 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0719  hypothetical protein  36.51 
 
 		 89 aa  42.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0230669  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0732  hypothetical protein  36.51 
 
 		 89 aa  42  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000191496 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4067  acyl carrier protein  42.42 
 
 		 82 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3404  hypothetical protein  40.98 
 
 		 91 aa  40  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.04727  normal  0.0784333 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>