33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4417 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4417  hypothetical protein  100 
 
 		 92 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3404  hypothetical protein  75.86 
 
 		 91 aa  128  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.04727  normal  0.0784333 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5059  hypothetical protein  47.13 
 
 		 89 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.719607  normal  0.463423 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4598  hypothetical protein  46.51 
 
 		 89 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.180568  normal  0.075328 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5080  hypothetical protein  45.21 
 
 		 90 aa  72  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1094  hypothetical protein  40.74 
 
 		 90 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0991  hypothetical protein  42.47 
 
 		 89 aa  64.3  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.151237 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4391  acyl carrier protein  36.92 
 
 		 83 aa  48.1  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3460  acyl carrier protein  39.73 
 
 		 81 aa  47.4  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000712705 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0043  acyl carrier protein  41.94 
 
 		 83 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2511  acyl carrier protein  41.94 
 
 		 83 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.161811  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2196  acyl carrier protein  41.94 
 
 		 83 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2889  acyl carrier protein  41.94 
 
 		 83 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0165  acyl carrier protein  46.94 
 
 		 79 aa  46.2  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3637  acyl carrier protein  38.98 
 
 		 83 aa  45.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.347013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4111  acyl carrier protein  38.98 
 
 		 83 aa  45.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0894098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3303  acyl carrier protein  36.92 
 
 		 103 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.516345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0642  acyl carrier protein  40.32 
 
 		 83 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0656  acyl carrier protein  40.32 
 
 		 83 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4214  acyl carrier protein  36.92 
 
 		 103 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.310426 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4152  acyl carrier protein  36.92 
 
 		 103 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.43157  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0532  acyl carrier protein  39.68 
 
 		 83 aa  45.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1804  acyl carrier protein  36.92 
 
 		 83 aa  45.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.179626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0819  acyl carrier protein  40.32 
 
 		 114 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1576  phosphopantetheine-binding protein  43.4 
 
 		 78 aa  44.7  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0249084  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01924  hypothetical protein  30.77 
 
 		 89 aa  44.3  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00150472 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5836  acyl carrier protein  44 
 
 		 83 aa  44.3  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3057  phosphopantetheine-binding  32.31 
 
 		 82 aa  42  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.245048  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0044  acyl carrier protein  39.71 
 
 		 83 aa  42  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3280  hypothetical protein  37.5 
 
 		 91 aa  42  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.919266  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4125  acyl carrier protein  37.88 
 
 		 83 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.276699  normal  0.797115 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3796  acyl carrier protein  37.88 
 
 		 83 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0022968  normal  0.531414 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6023  acyl carrier protein  41.51 
 
 		 83 aa  40.4  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>