39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2525 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2525  acyl carrier protein  100 
 
 
83 aa  160  8.000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.443758  normal  0.0225016 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1719  acyl carrier protein  95.18 
 
 
83 aa  151  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5836  acyl carrier protein  67.47 
 
 
83 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5360  acyl carrier protein  67.47 
 
 
83 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0532  acyl carrier protein  59.04 
 
 
83 aa  98.2  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0656  acyl carrier protein  57.83 
 
 
83 aa  97.4  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0642  acyl carrier protein  57.83 
 
 
83 aa  97.4  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2511  acyl carrier protein  56.63 
 
 
83 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.161811  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2196  acyl carrier protein  56.63 
 
 
83 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2889  acyl carrier protein  56.63 
 
 
83 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0043  acyl carrier protein  56.63 
 
 
83 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0819  acyl carrier protein  57.83 
 
 
114 aa  95.9  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2037  acyl carrier protein  56.63 
 
 
86 aa  92.8  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.571719 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1804  acyl carrier protein  51.81 
 
 
83 aa  87  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.179626  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4111  acyl carrier protein  50.6 
 
 
83 aa  84.7  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0894098  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3637  acyl carrier protein  50.6 
 
 
83 aa  84.7  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.347013  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3303  acyl carrier protein  49.4 
 
 
103 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.516345  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4391  acyl carrier protein  48.19 
 
 
83 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1477  acyl carrier protein  46.99 
 
 
83 aa  82.8  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4214  acyl carrier protein  49.4 
 
 
103 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.310426 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4152  acyl carrier protein  49.4 
 
 
103 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.43157  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4125  acyl carrier protein  46.99 
 
 
83 aa  78.2  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.276699  normal  0.797115 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3796  acyl carrier protein  45.78 
 
 
83 aa  77  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0022968  normal  0.531414 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0165  acyl carrier protein  51.39 
 
 
79 aa  76.3  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6023  acyl carrier protein  45.78 
 
 
83 aa  74.3  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1576  phosphopantetheine-binding protein  45.45 
 
 
78 aa  70.5  0.000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0249084  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1076  acyl carrier protein  41.67 
 
 
82 aa  67.4  0.00000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.414724  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0184  phosphopantetheine-binding  42.31 
 
 
84 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7015  phosphopantetheine-binding  40 
 
 
90 aa  45.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00543693 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4598  hypothetical protein  47.46 
 
 
89 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.180568  normal  0.075328 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5059  hypothetical protein  47.46 
 
 
89 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.719607  normal  0.463423 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3396  hypothetical protein  26.32 
 
 
93 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.225214  hitchhiker  0.000000113097 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5080  hypothetical protein  44.23 
 
 
90 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3404  hypothetical protein  44.26 
 
 
91 aa  41.6  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.04727  normal  0.0784333 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4067  acyl carrier protein  38.81 
 
 
82 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1788  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 2  39.29 
 
 
79 aa  41.2  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3057  phosphopantetheine-binding  35.48 
 
 
82 aa  41.2  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.245048  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0923  acyl-carrier protein-like protein  33.87 
 
 
94 aa  40.4  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2083  acyl carrier protein  42.86 
 
 
76 aa  40.4  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000417197  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>