124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3512 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3512  acyl carrier protein  100 
 
 		 82 aa  158  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.126809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0349  acyl carrier protein  91.36 
 
 		 82 aa  144  3e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3677  acyl carrier protein  91.36 
 
 		 82 aa  144  3e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0913406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4597  acyl carrier protein  91.25 
 
 		 80 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000178054 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3889  acyl carrier protein  86.59 
 
 		 82 aa  142  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4369  acyl carrier protein  88.89 
 
 		 82 aa  141  3e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0343  acyl carrier protein  90.12 
 
 		 82 aa  141  3e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.317237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0341  acyl carrier protein  87.65 
 
 		 82 aa  140  4e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.667101  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0445  acyl carrier protein  86.42 
 
 		 82 aa  141  4e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.377393  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0346  acyl carrier protein  87.65 
 
 		 82 aa  140  4e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0349  acyl carrier protein  87.65 
 
 		 82 aa  140  4e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000321207 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0339  acyl carrier protein  86.42 
 
 		 82 aa  140  8e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0324  acyl carrier protein  87.65 
 
 		 82 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00657258 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0351  acyl carrier protein  80.49 
 
 		 82 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3380  acyl carrier protein  79.01 
 
 		 82 aa  122  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2102  acyl carrier protein  63.29 
 
 		 83 aa  101  3e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.493775  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004065  acyl carrier protein  61.25 
 
 		 85 aa  98.2  4e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0692  acyl carrier protein  56 
 
 		 85 aa  94  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0950683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3600  acyl carrier protein  53.25 
 
 		 82 aa  92.8  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0891  acyl carrier protein  59.49 
 
 		 83 aa  92.8  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.515732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4075  acyl carrier protein  53.25 
 
 		 82 aa  92.8  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00792  acyl carrier protein  56 
 
 		 81 aa  92.4  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0929  acyl carrier protein  54.67 
 
 		 83 aa  92  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3887  acyl carrier protein  54.88 
 
 		 93 aa  92  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3062  acyl carrier protein  54.67 
 
 		 83 aa  92  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.73924  normal  0.979198 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4801  acyl carrier protein  54.88 
 
 		 83 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3876  phosphopantetheine-binding  53.95 
 
 		 82 aa  92  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.508072 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4570  acyl carrier protein  53.75 
 
 		 82 aa  90.5  7e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4763  acyl carrier protein  53.33 
 
 		 81 aa  85.5  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.065062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3686  acyl carrier protein  53.33 
 
 		 81 aa  85.5  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.630716 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5094  acyl carrier protein, putative  51.85 
 
 		 86 aa  84  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0436  acyl carrier protein  52.5 
 
 		 84 aa  84  7e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3922  acyl carrier protein  48.72 
 
 		 85 aa  82.4  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0438  acyl carrier protein  50.62 
 
 		 84 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.517567 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0112  acyl carrier protein  48 
 
 		 82 aa  77  0.00000000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2174  putative diguanylate cyclase  40.85 
 
 		 81 aa  67.8  0.00000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.377661  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0550  hypothetical protein  41.77 
 
 		 82 aa  66.6  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.324262  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0969  acyl carrier protein  40.54 
 
 		 84 aa  66.2  0.0000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000264763  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4379  acyl-carrier-protein  42.31 
 
 		 85 aa  65.1  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00582273  normal  0.0972461 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1856  phosphopantetheine-binding protein  35.44 
 
 		 85 aa  61.6  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03900  acyl carrier protein  43.24 
 
 		 80 aa  59.7  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.486098  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1105  hypothetical protein  43.08 
 
 		 84 aa  56.6  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1382  acyl carrier protein  36.62 
 
 		 81 aa  54.3  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0180925  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1489  phosphopantetheine-binding  45 
 
 		 83 aa  51.2  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0616  acyl carrier protein  37.68 
 
 		 74 aa  50.4  0.000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000175358  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0908  phosphopantetheine-binding protein  35.53 
 
 		 88 aa  49.7  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09300  acyl carrier protein  35.9 
 
 		 81 aa  49.7  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.421361  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2564  acyl carrier protein  36.62 
 
 		 77 aa  48.9  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1157  acyl carrier protein  36.11 
 
 		 78 aa  49.7  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000567099  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0269  acyl carrier protein  33.77 
 
 		 81 aa  48.1  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107759  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0267  acyl carrier protein  33.77 
 
 		 81 aa  48.1  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0366533  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1996  hypothetical protein  40.3 
 
 		 88 aa  47.8  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.889305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10300  acyl carrier protein  37.14 
 
 		 78 aa  47  0.00009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00141848  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10270  acyl carrier protein  34.25 
 
 		 81 aa  46.6  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.167244 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3365  acyl carrier protein  32.47 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257859  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0876  acyl carrier protein  35.21 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3427  acyl carrier protein  32.47 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3376  acyl carrier protein  32.47 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2778  acyl carrier protein  32.47 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.961024 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0944  acyl carrier protein  33.8 
 
 		 79 aa  45.8  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000174331  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1537  phosphopantetheine-binding  30.38 
 
 		 84 aa  45.1  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.157391  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1639  phosphopantetheine-binding protein  32.89 
 
 		 87 aa  45.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0535915  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0643  acyl carrier protein  34.29 
 
 		 77 aa  45.4  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000166271  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1011  acyl carrier protein  29.58 
 
 		 85 aa  44.7  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000000303772  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12010  acyl carrier protein  30.26 
 
 		 82 aa  44.3  0.0006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.114572  normal  0.0939277 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1527  acyl carrier protein  31.94 
 
 		 79 aa  44.3  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0798  acyl carrier protein  34.57 
 
 		 77 aa  43.9  0.0007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3755  acyl carrier protein  31.17 
 
 		 99 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.345144  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3892  acyl carrier protein  33.33 
 
 		 77 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3701  acyl carrier protein  33.33 
 
 		 77 aa  43.9  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3591  acyl carrier protein  33.33 
 
 		 77 aa  43.9  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3609  acyl carrier protein  33.33 
 
 		 77 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3988  acyl carrier protein  33.33 
 
 		 77 aa  43.9  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.168963  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1291  acyl carrier protein  34.57 
 
 		 77 aa  43.9  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1160  acyl carrier protein  31.51 
 
 		 84 aa  43.9  0.0008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000195346  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1316  acyl carrier protein  34.57 
 
 		 77 aa  43.9  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2502  acyl carrier protein  33.33 
 
 		 77 aa  43.9  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000438987  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2371  acyl carrier protein  36.62 
 
 		 84 aa  43.9  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.272715  normal  0.051956 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3898  acyl carrier protein  33.33 
 
 		 77 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000161668  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3949  acyl carrier protein  33.33 
 
 		 77 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.457007  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1294  acyl carrier protein  33.33 
 
 		 77 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0897377  hitchhiker  0.00000000000000136256 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3864  acyl carrier protein  33.33 
 
 		 77 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.3997e-48 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0170  acyl carrier protein  30.67 
 
 		 80 aa  43.5  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.519616  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0436  acyl carrier protein  33.9 
 
 		 76 aa  43.5  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.20002  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0773  acyl carrier protein  33.78 
 
 		 85 aa  43.5  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.250826  hitchhiker  0.0000000000344115 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1988  phosphopantetheine-binding  36.36 
 
 		 81 aa  43.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44915  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26061  acyl carrier protein  30.67 
 
 		 103 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3673  acyl carrier protein  33.33 
 
 		 77 aa  43.5  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.173328  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2951  phosphopantetheine-binding protein  31.58 
 
 		 80 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.765509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1641  acyl carrier protein  32.43 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0126  acyl carrier protein  29.33 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.395264  hitchhiker  0.00283985 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1610  Acyl carrier protein (ACP)  32 
 
 		 90 aa  42.4  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0663  acyl carrier protein  30.99 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00175647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2039  acyl carrier protein  33.33 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0051261  hitchhiker  0.00361328 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4067  acyl carrier protein  30.14 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2207  acyl carrier protein  30.77 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000161202 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1767  acyl carrier protein  34.78 
 
 		 78 aa  42  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0300385  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1973  acyl carrier protein  34.72 
 
 		 77 aa  42  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1361  acyl carrier protein  35.94 
 
 		 76 aa  42  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000207547  normal  0.0506091 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4192  acyl carrier protein  29.33 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.666871  normal  0.675617 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>