58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0969 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0969  acyl carrier protein  100 
 
 
84 aa  166  1e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000264763  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2174  putative diguanylate cyclase  88.89 
 
 
81 aa  144  6e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.377661  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0112  acyl carrier protein  64.94 
 
 
82 aa  105  2e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0438  acyl carrier protein  52.63 
 
 
84 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.517567 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5094  acyl carrier protein, putative  50 
 
 
86 aa  88.6  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0436  acyl carrier protein  52.63 
 
 
84 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4801  acyl carrier protein  45.33 
 
 
83 aa  77.4  0.00000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3876  phosphopantetheine-binding  46.75 
 
 
82 aa  75.9  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.508072 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0891  acyl carrier protein  44 
 
 
83 aa  73.6  0.0000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.515732  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4570  acyl carrier protein  44 
 
 
82 aa  73.6  0.0000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004065  acyl carrier protein  41.56 
 
 
85 aa  72  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2102  acyl carrier protein  42.11 
 
 
83 aa  69.7  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.493775  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3887  acyl carrier protein  43.84 
 
 
93 aa  68.9  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4597  acyl carrier protein  41.89 
 
 
80 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000178054 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0445  acyl carrier protein  39.19 
 
 
82 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.377393  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0339  acyl carrier protein  39.19 
 
 
82 aa  67  0.00000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4369  acyl carrier protein  40.54 
 
 
82 aa  67  0.00000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3922  acyl carrier protein  42.68 
 
 
85 aa  66.2  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0346  acyl carrier protein  39.19 
 
 
82 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3512  acyl carrier protein  40.54 
 
 
82 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.126809  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0341  acyl carrier protein  39.19 
 
 
82 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.667101  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0349  acyl carrier protein  39.19 
 
 
82 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000321207 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3677  acyl carrier protein  39.19 
 
 
82 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0913406  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0349  acyl carrier protein  39.19 
 
 
82 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00792  acyl carrier protein  38.67 
 
 
81 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3889  acyl carrier protein  41.89 
 
 
82 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3062  acyl carrier protein  36.59 
 
 
83 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.73924  normal  0.979198 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0929  acyl carrier protein  36.59 
 
 
83 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3600  acyl carrier protein  38.67 
 
 
82 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4075  acyl carrier protein  38.67 
 
 
82 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0343  acyl carrier protein  37.84 
 
 
82 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.317237  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3380  acyl carrier protein  40.54 
 
 
82 aa  62  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0324  acyl carrier protein  39.19 
 
 
82 aa  61.6  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00657258 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0351  acyl carrier protein  39.19 
 
 
82 aa  61.6  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0692  acyl carrier protein  35.37 
 
 
85 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0950683  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4379  acyl-carrier-protein  40.26 
 
 
85 aa  59.7  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00582273  normal  0.0972461 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4763  acyl carrier protein  38.67 
 
 
81 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.065062  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3686  acyl carrier protein  38.67 
 
 
81 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.630716 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1856  phosphopantetheine-binding protein  37.18 
 
 
85 aa  53.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0550  hypothetical protein  32.93 
 
 
82 aa  52.4  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.324262  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03900  acyl carrier protein  33.33 
 
 
80 aa  48.9  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.486098  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0944  acyl carrier protein  32.91 
 
 
79 aa  46.2  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000174331  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4504  acyl carrier protein  30.86 
 
 
81 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1996  hypothetical protein  34.18 
 
 
88 aa  45.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.889305  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0267  acyl carrier protein  30.77 
 
 
81 aa  44.3  0.0006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0366533  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0269  acyl carrier protein  30.77 
 
 
81 aa  44.3  0.0006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107759  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1510  phosphopantetheine-binding  29.27 
 
 
94 aa  44.3  0.0006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.406457  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0984  acyl carrier protein  32.1 
 
 
82 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.156105  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1105  hypothetical protein  29.27 
 
 
84 aa  43.5  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0908  phosphopantetheine-binding protein  27.38 
 
 
88 aa  42.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4413  phosphopantetheine-binding protein  36.36 
 
 
77 aa  42.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.864281  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1157  acyl carrier protein  32.39 
 
 
78 aa  42  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000567099  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1096  acyl carrier protein  31.65 
 
 
83 aa  41.2  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000417281  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3256  acyl carrier protein  30.86 
 
 
82 aa  41.6  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.929714  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0536  acyl carrier protein  28.21 
 
 
80 aa  40.8  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.75126  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0779  phosphopantetheine-binding protein  28.77 
 
 
76 aa  40.8  0.006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1769  acyl carrier protein  27.14 
 
 
82 aa  40.8  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0117852 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0616  acyl carrier protein  29.03 
 
 
74 aa  40.4  0.009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000175358  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>