More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1510 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_1510  phosphopantetheine-binding  100 
 
 
94 aa  179  1e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.406457  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1011  acyl carrier protein  39.33 
 
 
85 aa  63.2  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000000303772  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1157  acyl carrier protein  45 
 
 
78 aa  63.5  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000567099  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4505  acyl carrier protein  44.16 
 
 
81 aa  62.8  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265662  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1439  acyl carrier protein  43.59 
 
 
77 aa  60.1  0.000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1279  acyl carrier protein  40.26 
 
 
86 aa  58.9  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.838777  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2736  acyl carrier protein  39.51 
 
 
80 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.875192  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0959  acyl carrier protein  42.17 
 
 
80 aa  58.2  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1641  acyl carrier protein  40.51 
 
 
82 aa  58.5  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1878  acyl carrier protein  40.51 
 
 
77 aa  58.2  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0843624  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3105  acyl carrier protein  42.86 
 
 
77 aa  58.2  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000128081  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1157  acyl carrier protein  42.86 
 
 
77 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.917954 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1602  acyl carrier protein  40.51 
 
 
77 aa  57.4  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000714682  normal  0.960802 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2839  acyl carrier protein  40.26 
 
 
79 aa  57  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2747  acyl carrier protein  40.26 
 
 
79 aa  57  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2931  acyl carrier protein  40.26 
 
 
79 aa  57  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1604  acyl carrier protein  39.24 
 
 
77 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.0000908014  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5650  acyl carrier protein  40.74 
 
 
80 aa  56.6  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.611546  normal  0.225397 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1062  acyl carrier protein  38.96 
 
 
86 aa  56.2  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000737995  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0284  acyl carrier protein  43.84 
 
 
82 aa  55.8  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6611  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1090  acyl carrier protein  38.96 
 
 
86 aa  56.2  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0263078  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3071  acyl carrier protein  42.86 
 
 
79 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0605  acyl carrier protein  41.77 
 
 
84 aa  55.5  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  9.329130000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1096  acyl carrier protein  42.86 
 
 
83 aa  55.1  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000417281  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2325  acyl carrier protein  45.07 
 
 
79 aa  54.7  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.596605  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3380  acyl carrier protein  40 
 
 
79 aa  54.7  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0442067  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3646  acyl carrier protein  41.43 
 
 
79 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1935  acyl carrier protein  42.86 
 
 
77 aa  54.7  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000441044  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1420  acyl carrier protein  41.46 
 
 
79 aa  54.7  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.704183 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1722  acyl carrier protein  42.31 
 
 
75 aa  55.1  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0267  acyl carrier protein  35.71 
 
 
81 aa  54.3  0.0000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0366533  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1633  acyl carrier protein  37.5 
 
 
83 aa  54.7  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0643  acyl carrier protein  45.35 
 
 
77 aa  54.3  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000166271  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1580  acyl carrier protein  40.51 
 
 
84 aa  54.3  0.0000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000805484  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0269  acyl carrier protein  35.71 
 
 
81 aa  54.3  0.0000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107759  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1866  acyl carrier protein  40.26 
 
 
77 aa  54.7  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00815396  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10300  acyl carrier protein  46.27 
 
 
78 aa  54.3  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00141848  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4810  acyl carrier protein  42.67 
 
 
82 aa  54.3  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0303207  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0685  acyl carrier protein  37.33 
 
 
75 aa  54.3  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00698969  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1629  acyl carrier protein  41.56 
 
 
78 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1587  acyl carrier protein  40.85 
 
 
79 aa  53.5  0.0000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.281743  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1644  acyl carrier protein  40.85 
 
 
79 aa  53.5  0.0000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.28963  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1075  acyl carrier protein  43.66 
 
 
78 aa  53.5  0.0000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.690942  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2462  acyl carrier protein  39.44 
 
 
73 aa  53.1  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0113419  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2195  acyl carrier protein  40.26 
 
 
78 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2018  Acyl carrier protein (ACP)  44 
 
 
78 aa  53.5  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000498687  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25670  acyl carrier protein  40.26 
 
 
78 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000226432  normal  0.748876 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14930  acyl carrier protein  40.26 
 
 
78 aa  53.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1392  acyl carrier protein  41.43 
 
 
79 aa  52.4  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0933  acyl carrier protein  41.33 
 
 
74 aa  52.8  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000201436  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1548  Acyl carrier protein (ACP)  46.38 
 
 
77 aa  52.4  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.079585  normal  0.066745 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002997  acyl carrier protein  42.67 
 
 
77 aa  52.4  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000114141  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1606  acyl carrier protein  41.03 
 
 
110 aa  52.4  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  8.57537e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0873  acyl carrier protein  41.56 
 
 
79 aa  52.4  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1602  acyl carrier protein  41.56 
 
 
77 aa  52  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00127335  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1526  acyl carrier protein  41.56 
 
 
78 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.262214 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0452  acyl carrier protein  41.56 
 
 
88 aa  52.4  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02907  acyl carrier protein  42.67 
 
 
77 aa  52.4  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1491  acyl carrier protein  41.56 
 
 
78 aa  52  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114932  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3277  acyl carrier protein  40 
 
 
79 aa  52  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.796037  normal  0.660207 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0417  acyl carrier protein  38.03 
 
 
77 aa  52  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1733  acyl carrier protein  40 
 
 
79 aa  52  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.9219  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1052  acyl carrier protein  39.73 
 
 
77 aa  51.6  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.784582  normal  0.0871909 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5269  acyl carrier protein  40 
 
 
79 aa  52  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1186  acyl carrier protein  40 
 
 
79 aa  52  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.026536 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2630  acyl carrier protein  40 
 
 
79 aa  52  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2071  acyl carrier protein  38.67 
 
 
74 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000431599  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1263  acyl carrier protein  40 
 
 
82 aa  52  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0921694 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4504  acyl carrier protein  32.5 
 
 
81 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02710  acyl carrier protein  40.26 
 
 
79 aa  51.2  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.312215  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0126  acyl carrier protein  38.75 
 
 
80 aa  51.6  0.000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.395264  hitchhiker  0.00283985 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0752  acyl carrier protein  41.33 
 
 
79 aa  51.6  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0103187  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2181  acyl carrier protein  39.73 
 
 
77 aa  51.6  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0280  acyl carrier protein  38.36 
 
 
78 aa  51.6  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.344257 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2519  acyl carrier protein  40 
 
 
79 aa  51.2  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1909  acyl carrier protein  40.28 
 
 
82 aa  51.2  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.045523  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2262  acyl carrier protein  42.86 
 
 
79 aa  51.2  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.033873  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0310  acyl carrier protein  39.73 
 
 
76 aa  51.2  0.000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00336649  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0170  acyl carrier protein  38.75 
 
 
80 aa  50.8  0.000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.519616  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1584  acyl carrier protein  40.28 
 
 
82 aa  51.2  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34262  normal  0.0373148 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2427  acyl carrier protein  42.86 
 
 
79 aa  51.2  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.954024  normal  0.837243 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3249  acyl carrier protein  41.43 
 
 
79 aa  51.2  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.124771  normal  0.0273605 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1258  acyl carrier protein  39.24 
 
 
79 aa  51.2  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1915  acyl carrier protein  41.56 
 
 
78 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00426402  unclonable  0.000000216154 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1639  phosphopantetheine-binding protein  32.88 
 
 
87 aa  50.8  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0535915  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0918  acyl carrier protein  42.86 
 
 
79 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.150298  normal  0.183908 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1648  acyl carrier protein  37.5 
 
 
80 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00355954  normal  0.46932 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1834  acyl carrier protein  40 
 
 
79 aa  50.8  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0103322  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0436  acyl carrier protein  35.06 
 
 
76 aa  50.8  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.20002  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0983  acyl carrier protein  42.86 
 
 
79 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.415355  normal  0.0515815 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1527  acyl carrier protein  36 
 
 
79 aa  50.8  0.000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4067  acyl carrier protein  37.8 
 
 
82 aa  50.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2904  acyl carrier protein  41.43 
 
 
79 aa  50.4  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1720  acyl carrier protein  41.43 
 
 
79 aa  50.4  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1075  acyl carrier protein  41.43 
 
 
79 aa  50.4  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.777412  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1799  acyl carrier protein  41.43 
 
 
79 aa  50.4  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.714333  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2789  acyl carrier protein  41.43 
 
 
79 aa  50.4  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1124  acyl carrier protein  41.43 
 
 
79 aa  50.4  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1768  acyl carrier protein  39.44 
 
 
77 aa  50.8  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.461775 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1979  acyl carrier protein  40.51 
 
 
77 aa  50.8  0.000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000485272  decreased coverage  0.000456446 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>