More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1062 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1062  acyl carrier protein  100 
 
 		 86 aa  169  1e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000737995  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1090  acyl carrier protein  97.67 
 
 		 86 aa  165  2e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0263078  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1279  acyl carrier protein  94.19 
 
 		 86 aa  159  1e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.838777  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0605  acyl carrier protein  64.56 
 
 		 84 aa  95.9  1e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  9.329130000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1580  acyl carrier protein  64.56 
 
 		 84 aa  96.3  1e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000805484  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0873  acyl carrier protein  60.49 
 
 		 79 aa  95.9  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4156  acyl carrier protein  61.73 
 
 		 78 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.035668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2133  acyl carrier protein  60.49 
 
 		 77 aa  94  6e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000639035  normal  0.0269953 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2502  acyl carrier protein  59.26 
 
 		 78 aa  93.6  9e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000398484  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3831  acyl carrier protein  60.49 
 
 		 78 aa  93.6  9e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67399  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2807  acyl carrier protein  59.26 
 
 		 78 aa  93.6  9e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000000875833  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02710  acyl carrier protein  59.26 
 
 		 79 aa  93.6  9e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.312215  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3799  acyl carrier protein  59.26 
 
 		 78 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.181664  normal  0.777832 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1915  acyl carrier protein  59.26 
 
 		 78 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00426402  unclonable  0.000000216154 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1588  acyl carrier protein  59.26 
 
 		 78 aa  92  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000112562  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2043  acyl carrier protein  62.82 
 
 		 77 aa  92  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000099502  decreased coverage  0.00468408 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1624  acyl carrier protein  59.26 
 
 		 78 aa  92  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000729948  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1979  acyl carrier protein  62.82 
 
 		 77 aa  92.8  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000485272  decreased coverage  0.000456446 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2572  acyl carrier protein  62.82 
 
 		 77 aa  92  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000656295  hitchhiker  0.00274043 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0685  acyl carrier protein  61.54 
 
 		 75 aa  92  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00698969  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1583  acyl carrier protein  62.82 
 
 		 77 aa  92  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000266609  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2775  acyl carrier protein  62.82 
 
 		 77 aa  92  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1760  acyl carrier protein  62.82 
 
 		 77 aa  92  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000614435  normal  0.41842 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1720  acyl carrier protein  62.82 
 
 		 77 aa  92  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138911  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1717  acyl carrier protein  62.82 
 
 		 77 aa  92  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000515668  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2292  acyl carrier protein  61.54 
 
 		 77 aa  91.7  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000308066  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2493  acyl carrier protein  61.54 
 
 		 77 aa  91.7  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000155434  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2395  acyl carrier protein  62.82 
 
 		 77 aa  92  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000802043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2465  acyl carrier protein  62.82 
 
 		 77 aa  92  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000179854  hitchhiker  0.00129052 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1500  acyl carrier protein  61.54 
 
 		 77 aa  91.7  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000077006  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2623  acyl carrier protein  61.54 
 
 		 77 aa  91.7  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000188634  unclonable  0.0000000000890491 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2298  acyl carrier protein  58.02 
 
 		 77 aa  91.3  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00108603  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002997  acyl carrier protein  61.25 
 
 		 77 aa  91.3  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000114141  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1604  acyl carrier protein  61.54 
 
 		 77 aa  91.7  4e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000038664  decreased coverage  0.000139314 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02907  acyl carrier protein  61.25 
 
 		 77 aa  91.3  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0433  acyl carrier protein  60 
 
 		 77 aa  91.3  4e-18  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.145071  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1258  acyl carrier protein  57.65 
 
 		 79 aa  90.5  6e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1907  acyl carrier protein  57.5 
 
 		 78 aa  90.1  9e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000356515  hitchhiker  0.00000541151 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1923  acyl carrier protein  59.26 
 
 		 79 aa  90.1  9e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000792988  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1526  acyl carrier protein  59.26 
 
 		 78 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.262214 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1648  acyl carrier protein  59.49 
 
 		 80 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00355954  normal  0.46932 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1834  acyl carrier protein  56.1 
 
 		 79 aa  90.1  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0103322  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1491  acyl carrier protein  59.26 
 
 		 78 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1609  acyl carrier protein  58.02 
 
 		 78 aa  90.1  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000323844  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1351  acyl carrier protein  58.02 
 
 		 82 aa  89  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1347  acyl carrier protein  58.02 
 
 		 82 aa  89  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1687  acyl carrier protein  58.02 
 
 		 78 aa  89.4  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000299329  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3498  acyl carrier protein  58.02 
 
 		 78 aa  89.4  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000503689  hitchhiker  0.00947262 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14930  acyl carrier protein  56.1 
 
 		 78 aa  89  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1579  acyl carrier protein  58.02 
 
 		 78 aa  89.4  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.86341e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1232  acyl carrier protein  59.49 
 
 		 79 aa  88.6  3e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152652  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1420  acyl carrier protein  59.49 
 
 		 79 aa  88.2  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.704183 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1866  acyl carrier protein  61.54 
 
 		 77 aa  88.2  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00815396  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01090  acyl carrier protein  56.79 
 
 		 78 aa  88.2  4e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000166866  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2553  acyl carrier protein  56.79 
 
 		 78 aa  88.2  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000526358  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1990  acyl carrier protein  56.79 
 
 		 78 aa  88.2  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000000274294  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2033  acyl carrier protein  56.79 
 
 		 78 aa  88.2  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000123338  hitchhiker  0.00000256014 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2507  acyl carrier protein  56.79 
 
 		 78 aa  88.2  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996587  hitchhiker  0.000000169384 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1473  acyl carrier protein  56.79 
 
 		 78 aa  88.2  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000000839248  hitchhiker  0.00000000000000262365 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01098  hypothetical protein  56.79 
 
 		 78 aa  88.2  4e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000144532  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2173  acyl carrier protein  56.79 
 
 		 78 aa  88.2  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000401427  hitchhiker  0.000000000000202194 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1216  acyl carrier protein  56.79 
 
 		 78 aa  88.2  4e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  3.59624e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1310  acyl carrier protein  56.79 
 
 		 78 aa  88.2  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000174722  decreased coverage  4.37915e-18 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1215  acyl carrier protein  56.79 
 
 		 78 aa  88.2  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000103813  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1295  acyl carrier protein  56.79 
 
 		 78 aa  88.2  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000656136  decreased coverage  3.5580799999999995e-20 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1629  acyl carrier protein  56.1 
 
 		 78 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2121  acyl carrier protein  56.79 
 
 		 79 aa  87.8  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000862864  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2230  acyl carrier protein  56.79 
 
 		 78 aa  88.2  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.78439e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1606  acyl carrier protein  57.32 
 
 		 110 aa  88.2  4e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  8.57537e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1266  acyl carrier protein  56.79 
 
 		 78 aa  88.2  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000000383773  normal  0.0632427 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2195  acyl carrier protein  58.97 
 
 		 78 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25670  acyl carrier protein  58.97 
 
 		 78 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000226432  normal  0.748876 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1633  acyl carrier protein  60.26 
 
 		 83 aa  86.7  9e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1075  acyl carrier protein  54.88 
 
 		 78 aa  86.3  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.690942  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1090  acyl carrier protein  54.88 
 
 		 77 aa  86.3  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.343466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1602  acyl carrier protein  57.69 
 
 		 77 aa  85.5  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00127335  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3788  acyl carrier protein  60 
 
 		 87 aa  85.5  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.155338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1584  acyl carrier protein  58.02 
 
 		 82 aa  85.1  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34262  normal  0.0373148 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0959  acyl carrier protein  55 
 
 		 80 aa  84.7  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1909  acyl carrier protein  58.02 
 
 		 82 aa  85.1  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.045523  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0417  acyl carrier protein  56.1 
 
 		 77 aa  84.7  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1504  acyl carrier protein  55.56 
 
 		 78 aa  84.7  4e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0070299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0933  acyl carrier protein  55.7 
 
 		 74 aa  84.7  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000201436  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4505  acyl carrier protein  55.81 
 
 		 81 aa  84.3  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265662  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0168  acyl carrier protein  56.96 
 
 		 76 aa  84.3  5e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000122767  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1630  acyl carrier protein  55.7 
 
 		 78 aa  84  6e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000123369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0408  acyl carrier protein  54.32 
 
 		 79 aa  83.6  7e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.442287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2018  Acyl carrier protein (ACP)  57.69 
 
 		 78 aa  83.6  8e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000498687  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1053  acyl carrier protein  53.09 
 
 		 79 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.549233 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1935  acyl carrier protein  57.69 
 
 		 77 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000441044  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1082  acyl carrier protein  53.09 
 
 		 79 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1548  Acyl carrier protein (ACP)  57.89 
 
 		 77 aa  82.4  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.079585  normal  0.066745 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2180  acyl carrier protein  53.09 
 
 		 79 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.253205  normal  0.154334 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2789  acyl carrier protein  53.09 
 
 		 79 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1004  acyl carrier protein  53.09 
 
 		 79 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.486697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3071  acyl carrier protein  55.56 
 
 		 79 aa  82  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1720  acyl carrier protein  53.09 
 
 		 79 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1075  acyl carrier protein  53.09 
 
 		 79 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.777412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2325  acyl carrier protein  51.85 
 
 		 79 aa  82  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.596605  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1000  acyl carrier protein  53.09 
 
 		 79 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>