27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1769 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1769  acyl carrier protein  100 
 
 		 82 aa  160  6e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0117852 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0194  hypothetical protein  36.62 
 
 		 95 aa  48.9  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.470096  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3755  acyl carrier protein  36.84 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.345144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2778  acyl carrier protein  36.84 
 
 		 99 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.961024 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2725  phosphopantetheine-binding protein  41.67 
 
 		 101 aa  45.1  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3376  acyl carrier protein  39.68 
 
 		 97 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3427  acyl carrier protein  39.68 
 
 		 97 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3365  acyl carrier protein  39.68 
 
 		 97 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257859  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1996  hypothetical protein  31.43 
 
 		 88 aa  44.3  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.889305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3805  Beta-ketoacyl synthase  33.85 
 
 		 2460 aa  43.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.780265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0752  acyl carrier protein  32.86 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0103187  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2600  Beta-ketoacyl synthase  33.33 
 
 		 2543 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4159  phosphopantetheine-binding protein  42.55 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.840095  normal  0.670614 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12273  acyl carrier protein  40 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.46303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0929  acyl carrier protein  29.58 
 
 		 83 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3122  phosphopantetheine-binding protein  43.86 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.884659  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3062  acyl carrier protein  29.58 
 
 		 83 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.73924  normal  0.979198 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3600  acyl carrier protein  28.17 
 
 		 82 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4075  acyl carrier protein  28.17 
 
 		 82 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00792  acyl carrier protein  29.58 
 
 		 81 aa  41.6  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1105  hypothetical protein  24.66 
 
 		 84 aa  41.2  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0969  acyl carrier protein  27.14 
 
 		 84 aa  40.8  0.006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000264763  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2174  putative diguanylate cyclase  28.12 
 
 		 81 aa  40.8  0.007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.377661  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1537  phosphopantetheine-binding  32.88 
 
 		 84 aa  40.4  0.008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.157391  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2617  Beta-ketoacyl synthase  32 
 
 		 2486 aa  40  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3010  polyketide synthase, type I, putative  32 
 
 		 2486 aa  40  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3876  phosphopantetheine-binding  30.65 
 
 		 82 aa  40  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.508072 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>