116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0351 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0351  acyl carrier protein  100 
 
 		 82 aa  160  8.000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0341  acyl carrier protein  83.95 
 
 		 82 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.667101  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3889  acyl carrier protein  81.48 
 
 		 82 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0346  acyl carrier protein  83.95 
 
 		 82 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0349  acyl carrier protein  83.95 
 
 		 82 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000321207 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0339  acyl carrier protein  82.72 
 
 		 82 aa  133  8e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0445  acyl carrier protein  79.27 
 
 		 82 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.377393  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0343  acyl carrier protein  81.48 
 
 		 82 aa  131  3e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.317237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3512  acyl carrier protein  80.49 
 
 		 82 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.126809  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4369  acyl carrier protein  81.48 
 
 		 82 aa  130  5e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0349  acyl carrier protein  81.48 
 
 		 82 aa  130  5e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3677  acyl carrier protein  81.48 
 
 		 82 aa  130  5e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0913406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0324  acyl carrier protein  80.49 
 
 		 82 aa  130  6e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00657258 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4597  acyl carrier protein  78.75 
 
 		 80 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000178054 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3380  acyl carrier protein  74.39 
 
 		 82 aa  120  7e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2102  acyl carrier protein  64.56 
 
 		 83 aa  107  7.000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.493775  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4763  acyl carrier protein  61.04 
 
 		 81 aa  97.1  8e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.065062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3686  acyl carrier protein  61.04 
 
 		 81 aa  97.1  8e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.630716 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3887  acyl carrier protein  58.02 
 
 		 93 aa  95.5  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004065  acyl carrier protein  58.23 
 
 		 85 aa  95.9  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0929  acyl carrier protein  57.14 
 
 		 83 aa  93.2  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3062  acyl carrier protein  57.14 
 
 		 83 aa  93.2  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.73924  normal  0.979198 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0891  acyl carrier protein  56.25 
 
 		 83 aa  90.5  7e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.515732  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00792  acyl carrier protein  53.25 
 
 		 81 aa  89.4  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0692  acyl carrier protein  55.84 
 
 		 85 aa  90.1  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0950683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3600  acyl carrier protein  56 
 
 		 82 aa  89  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4075  acyl carrier protein  56 
 
 		 82 aa  89  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4801  acyl carrier protein  53.09 
 
 		 83 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0436  acyl carrier protein  52.44 
 
 		 84 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3876  phosphopantetheine-binding  56.58 
 
 		 82 aa  88.6  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.508072 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3922  acyl carrier protein  51.9 
 
 		 85 aa  88.6  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4570  acyl carrier protein  51.9 
 
 		 82 aa  87.4  5e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5094  acyl carrier protein, putative  51.22 
 
 		 86 aa  86.7  9e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0438  acyl carrier protein  48.15 
 
 		 84 aa  81.3  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.517567 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4379  acyl-carrier-protein  47.5 
 
 		 85 aa  78.2  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00582273  normal  0.0972461 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2174  putative diguanylate cyclase  43.66 
 
 		 81 aa  65.5  0.0000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.377661  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0112  acyl carrier protein  42.67 
 
 		 82 aa  65.1  0.0000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0969  acyl carrier protein  39.19 
 
 		 84 aa  61.6  0.000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000264763  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0550  hypothetical protein  38.75 
 
 		 82 aa  59.7  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.324262  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1489  phosphopantetheine-binding  52.56 
 
 		 83 aa  55.8  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1856  phosphopantetheine-binding protein  31.65 
 
 		 85 aa  52  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03900  acyl carrier protein  40.54 
 
 		 80 aa  50.1  0.000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.486098  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1105  hypothetical protein  35 
 
 		 84 aa  49.3  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1382  acyl carrier protein  33.78 
 
 		 81 aa  47.4  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0180925  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0944  acyl carrier protein  35.21 
 
 		 79 aa  47.4  0.00007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000174331  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0269  acyl carrier protein  33.77 
 
 		 81 aa  46.2  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107759  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0267  acyl carrier protein  33.77 
 
 		 81 aa  46.2  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0366533  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1157  acyl carrier protein  38.89 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000567099  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09300  acyl carrier protein  34.62 
 
 		 81 aa  46.6  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.421361  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26061  acyl carrier protein  36 
 
 		 103 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2071  acyl carrier protein  33.8 
 
 		 74 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000431599  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1537  phosphopantetheine-binding  33.75 
 
 		 84 aa  46.2  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.157391  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0908  phosphopantetheine-binding protein  36.84 
 
 		 88 aa  45.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1011  acyl carrier protein  30.99 
 
 		 85 aa  45.1  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000000303772  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12010  acyl carrier protein  32.89 
 
 		 82 aa  45.4  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.114572  normal  0.0939277 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1973  acyl carrier protein  36.11 
 
 		 77 aa  44.7  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1082  acyl carrier protein  36.11 
 
 		 78 aa  45.1  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.325179  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2207  acyl carrier protein  34.62 
 
 		 81 aa  44.7  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000161202 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2564  acyl carrier protein  35.21 
 
 		 77 aa  44.3  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4504  acyl carrier protein  32.91 
 
 		 81 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1160  acyl carrier protein  34.25 
 
 		 84 aa  43.9  0.0007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000195346  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1263  acyl carrier protein  33.33 
 
 		 82 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0921694 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16760  acyl carrier protein  35.06 
 
 		 82 aa  43.5  0.0009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00765703  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1185  acyl carrier protein  33.33 
 
 		 80 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00688444  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3365  acyl carrier protein  35.06 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257859  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3427  acyl carrier protein  35.06 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20601  acyl carrier protein  33.33 
 
 		 80 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3376  acyl carrier protein  35.06 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2778  acyl carrier protein  35.06 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.961024 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1527  acyl carrier protein  30.56 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3122  phosphopantetheine-binding protein  32.47 
 
 		 101 aa  43.5  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.884659  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0616  acyl carrier protein  39.06 
 
 		 74 aa  43.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000175358  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0779  phosphopantetheine-binding protein  28.17 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1701  acyl carrier protein  32.43 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2468  acyl carrier protein  34.21 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000407512  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0088  acyl carrier protein  33.33 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1361  acyl carrier protein  35.94 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000207547  normal  0.0506091 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1975  acyl carrier protein  36.11 
 
 		 79 aa  42  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.166506  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2951  phosphopantetheine-binding protein  32.89 
 
 		 80 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.765509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1216  acyl carrier protein  35.71 
 
 		 78 aa  42  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.729885  normal  0.686684 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3755  acyl carrier protein  33.77 
 
 		 99 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.345144  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2371  acyl carrier protein  35.14 
 
 		 84 aa  42  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.272715  normal  0.051956 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10300  acyl carrier protein  35.71 
 
 		 78 aa  42  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00141848  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1639  phosphopantetheine-binding protein  31.17 
 
 		 87 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0535915  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1765  acyl carrier protein  30.88 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3892  acyl carrier protein  34.72 
 
 		 77 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3701  acyl carrier protein  34.72 
 
 		 77 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3591  acyl carrier protein  34.72 
 
 		 77 aa  41.6  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3609  acyl carrier protein  34.72 
 
 		 77 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0126  acyl carrier protein  32 
 
 		 80 aa  41.6  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.395264  hitchhiker  0.00283985 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3988  acyl carrier protein  34.72 
 
 		 77 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.168963  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0280  acyl carrier protein  34.29 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.344257 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1767  acyl carrier protein  34.78 
 
 		 78 aa  41.2  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0300385  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18181  acyl carrier protein  32.43 
 
 		 79 aa  41.2  0.004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.180905  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18011  acyl carrier protein  32.43 
 
 		 79 aa  41.2  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2502  acyl carrier protein  34.72 
 
 		 77 aa  41.6  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000438987  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3898  acyl carrier protein  34.72 
 
 		 77 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000161668  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3949  acyl carrier protein  34.72 
 
 		 77 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.457007  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1294  acyl carrier protein  34.72 
 
 		 77 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0897377  hitchhiker  0.00000000000000136256 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3864  acyl carrier protein  34.72 
 
 		 77 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.3997e-48 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>