More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1765 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG1765  acyl carrier protein  100 
 
 
78 aa  154  4e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1398  acyl carrier protein  67.95 
 
 
78 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.359191 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5148  acyl carrier protein  67.53 
 
 
79 aa  108  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.166001 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3914  acyl carrier protein  65.38 
 
 
78 aa  106  9.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4192  acyl carrier protein  65.38 
 
 
78 aa  106  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.666871  normal  0.675617 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0363  acyl carrier protein  61.54 
 
 
78 aa  103  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.878931  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1319  acyl carrier protein  66.22 
 
 
78 aa  100  8e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.346066  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1137  acyl carrier protein  62.82 
 
 
78 aa  99  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1208  hypothetical protein  58.44 
 
 
80 aa  99.4  2e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000845225 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03150  acyl carrier protein  62.67 
 
 
77 aa  97.1  7e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2689  acyl carrier protein  56.58 
 
 
82 aa  93.6  9e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3198  acyl carrier protein  60.53 
 
 
78 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0370442 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3407  acyl carrier protein  63.16 
 
 
79 aa  92.8  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2785  acyl carrier protein  60.53 
 
 
78 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10300  acyl carrier protein  62.5 
 
 
78 aa  92  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00141848  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0280  acyl carrier protein  63.16 
 
 
78 aa  91.7  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.344257 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1527  acyl carrier protein  61.84 
 
 
79 aa  90.9  5e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0558  acyl carrier protein  57.89 
 
 
78 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.531759  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0088  acyl carrier protein  60.53 
 
 
78 aa  90.5  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1767  acyl carrier protein  60 
 
 
78 aa  90.5  7e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0300385  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0529  acyl carrier protein  57.89 
 
 
78 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.221714 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0493  acyl carrier protein  57.89 
 
 
78 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.548895  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1898  acyl carrier protein  56.58 
 
 
79 aa  89.4  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00281225 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0660  acyl carrier protein  56 
 
 
81 aa  89  2e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.179037  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3132  acyl carrier protein  57.89 
 
 
78 aa  88.6  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1232  acyl carrier protein  56.41 
 
 
79 aa  88.6  3e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152652  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0417  acyl carrier protein  60.53 
 
 
77 aa  88.2  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1530  acyl carrier protein  58.67 
 
 
78 aa  88.6  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.129893  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1687  acyl carrier protein  57.69 
 
 
79 aa  88.2  4e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2978  acyl carrier protein  57.69 
 
 
79 aa  88.2  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.702686  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1973  acyl carrier protein  55.84 
 
 
77 aa  88.2  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3483  acyl carrier protein  57.69 
 
 
79 aa  88.2  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.057924  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1201  acyl carrier protein  57.33 
 
 
78 aa  87.4  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.576937  hitchhiker  0.00368899 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1058  acyl carrier protein  57.33 
 
 
78 aa  87.4  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0713713 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0746  acyl carrier protein  57.33 
 
 
78 aa  87.8  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.746533  normal  0.50277 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3819  acyl carrier protein  57.69 
 
 
79 aa  87.8  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.542696  normal  0.0672791 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2468  acyl carrier protein  57.69 
 
 
79 aa  87.8  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1339  acyl carrier protein  59.21 
 
 
78 aa  87.8  5e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.52176  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2301  acyl carrier protein  57.69 
 
 
79 aa  87.8  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0385608  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2352  acyl carrier protein  57.69 
 
 
79 aa  87.8  5e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4505  acyl carrier protein  55.13 
 
 
81 aa  87  7e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265662  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1420  acyl carrier protein  55.84 
 
 
79 aa  87  7e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.704183 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0959  acyl carrier protein  58.33 
 
 
80 aa  86.7  9e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1082  acyl carrier protein  53.25 
 
 
78 aa  85.9  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.325179  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0459  acyl carrier protein  57.33 
 
 
78 aa  85.9  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.997029  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1351  acyl carrier protein  55.84 
 
 
82 aa  85.9  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1347  acyl carrier protein  55.84 
 
 
82 aa  85.9  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0464  acyl carrier protein  57.33 
 
 
78 aa  85.9  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3673  acyl carrier protein  55.84 
 
 
77 aa  85.5  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.173328  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0643  acyl carrier protein  56.58 
 
 
77 aa  85.9  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000166271  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0572  acyl carrier protein  57.33 
 
 
78 aa  85.9  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000726263  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1216  acyl carrier protein  54.55 
 
 
78 aa  85.9  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.729885  normal  0.686684 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0873  acyl carrier protein  53.85 
 
 
79 aa  85.5  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1799  acyl carrier protein  53.85 
 
 
79 aa  85.1  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.714333  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3892  acyl carrier protein  54.55 
 
 
77 aa  84.7  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3898  acyl carrier protein  54.55 
 
 
77 aa  84.7  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000161668  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3701  acyl carrier protein  54.55 
 
 
77 aa  84.7  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3591  acyl carrier protein  54.55 
 
 
77 aa  84.7  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3609  acyl carrier protein  54.55 
 
 
77 aa  84.7  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0533  acyl carrier protein  53.85 
 
 
79 aa  85.1  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2502  acyl carrier protein  54.55 
 
 
77 aa  84.7  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000438987  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2904  acyl carrier protein  53.85 
 
 
79 aa  85.1  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4236  acyl carrier protein  53.85 
 
 
79 aa  85.1  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.223636  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0831  acyl carrier protein  53.85 
 
 
79 aa  85.1  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2789  acyl carrier protein  53.85 
 
 
79 aa  85.1  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3988  acyl carrier protein  54.55 
 
 
77 aa  84.7  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.168963  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2805  acyl carrier protein  53.85 
 
 
79 aa  85.1  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3949  acyl carrier protein  54.55 
 
 
77 aa  84.7  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.457007  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2476  acyl carrier protein  53.85 
 
 
79 aa  85.1  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1720  acyl carrier protein  53.85 
 
 
79 aa  85.1  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1082  acyl carrier protein  53.85 
 
 
79 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1258  acyl carrier protein  53.85 
 
 
79 aa  84.7  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1075  acyl carrier protein  53.85 
 
 
79 aa  85.1  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.777412  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2909  acyl carrier protein  53.85 
 
 
79 aa  85.1  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0644  acyl carrier protein  53.85 
 
 
79 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1004  acyl carrier protein  53.85 
 
 
79 aa  85.1  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.486697  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1000  acyl carrier protein  53.85 
 
 
79 aa  85.1  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2180  acyl carrier protein  53.85 
 
 
79 aa  85.1  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.253205  normal  0.154334 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1124  acyl carrier protein  53.85 
 
 
79 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1294  acyl carrier protein  54.55 
 
 
77 aa  84.7  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0897377  hitchhiker  0.00000000000000136256 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2850  acyl carrier protein  53.85 
 
 
79 aa  85.1  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.814249  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0605  acyl carrier protein  56.58 
 
 
84 aa  85.1  3e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  9.329130000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3864  acyl carrier protein  54.55 
 
 
77 aa  84.7  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.3997e-48 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0713  acyl carrier protein  53.25 
 
 
78 aa  84.7  4e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000031745  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0510  acyl carrier protein  52.7 
 
 
77 aa  84.7  4e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02710  acyl carrier protein  52.56 
 
 
79 aa  84.7  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.312215  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26061  acyl carrier protein  59.42 
 
 
103 aa  84.3  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1935  acyl carrier protein  52.63 
 
 
77 aa  84.3  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000441044  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14930  acyl carrier protein  57.53 
 
 
78 aa  84  6e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1580  acyl carrier protein  56.58 
 
 
84 aa  84  6e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000805484  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1096  acyl carrier protein  51.95 
 
 
83 aa  84  7e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000417281  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1052  acyl carrier protein  57.53 
 
 
77 aa  84  7e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.784582  normal  0.0871909 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2181  acyl carrier protein  57.53 
 
 
77 aa  83.6  8e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1629  acyl carrier protein  56.16 
 
 
78 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1090  acyl carrier protein  53.95 
 
 
77 aa  83.6  9e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.343466  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0894  acyl carrier protein  54.67 
 
 
79 aa  83.2  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0694526 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1834  acyl carrier protein  57.53 
 
 
79 aa  82.8  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0103322  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1125  acyl carrier protein  56.16 
 
 
77 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.854343  normal  0.264309 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1745  acyl carrier protein  53.95 
 
 
77 aa  83.2  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000920991  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2462  acyl carrier protein  60.29 
 
 
73 aa  82.8  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0113419  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>