More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2468 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2468  acyl carrier protein  100 
 
 		 81 aa  157  4e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000407512  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2207  acyl carrier protein  97.53 
 
 		 81 aa  152  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000161202 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3345  acyl carrier protein  77.78 
 
 		 81 aa  130  9e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0503244  normal  0.362492 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09300  acyl carrier protein  82.72 
 
 		 81 aa  128  2.0000000000000002e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.421361  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1805  acyl carrier protein  78.05 
 
 		 82 aa  125  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.200029  normal  0.0299727 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16760  acyl carrier protein  81.48 
 
 		 82 aa  123  7e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00765703  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2137  phosphopantetheine-binding protein  78.48 
 
 		 82 aa  122  2e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2152  phosphopantetheine-binding protein  78.48 
 
 		 82 aa  120  7e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14090  acyl carrier protein  70.89 
 
 		 82 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.025354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0876  acyl carrier protein  71.43 
 
 		 84 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1988  phosphopantetheine-binding  67.9 
 
 		 81 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44915  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1517  phosphopantetheine-binding  64.2 
 
 		 82 aa  100  6e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.259778  normal  0.0737426 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10270  acyl carrier protein  62.34 
 
 		 81 aa  97.4  5e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.167244 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2039  acyl carrier protein  63.51 
 
 		 80 aa  97.4  6e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0051261  hitchhiker  0.00361328 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1263  acyl carrier protein  61.04 
 
 		 82 aa  93.6  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0921694 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6811  phosphopantetheine-binding  59.49 
 
 		 82 aa  92.8  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3483  acyl carrier protein  59.74 
 
 		 82 aa  92  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.520778  normal  0.883416 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3622  acyl carrier protein  62.16 
 
 		 79 aa  92  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000545579 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12010  acyl carrier protein  60.76 
 
 		 82 aa  92.8  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.114572  normal  0.0939277 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1325  acyl carrier protein  59.21 
 
 		 79 aa  91.3  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3122  phosphopantetheine-binding protein  54.67 
 
 		 101 aa  90.9  5e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.884659  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3380  acyl carrier protein  62.16 
 
 		 79 aa  90.9  5e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0442067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4810  acyl carrier protein  57.69 
 
 		 82 aa  90.5  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0303207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3376  acyl carrier protein  54.55 
 
 		 97 aa  89  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3365  acyl carrier protein  54.55 
 
 		 97 aa  89  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257859  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3427  acyl carrier protein  54.55 
 
 		 97 aa  89  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2778  acyl carrier protein  53.25 
 
 		 99 aa  87.8  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.961024 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3755  acyl carrier protein  54.67 
 
 		 99 aa  87.8  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.345144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7056  acyl carrier protein  52.63 
 
 		 79 aa  85.5  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2725  phosphopantetheine-binding protein  51.9 
 
 		 101 aa  85.9  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2371  acyl carrier protein  54.05 
 
 		 84 aa  85.1  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.272715  normal  0.051956 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1639  phosphopantetheine-binding protein  52.63 
 
 		 87 aa  84.7  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0535915  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3512  acyl carrier protein  53.85 
 
 		 79 aa  83.6  9e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.410127  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1975  acyl carrier protein  54.05 
 
 		 79 aa  82  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.166506  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2951  phosphopantetheine-binding protein  52.63 
 
 		 80 aa  81.3  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.765509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12273  acyl carrier protein  51.72 
 
 		 115 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.46303  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2565  acyl carrier protein  44.78 
 
 		 78 aa  65.9  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0773  acyl carrier protein  37.18 
 
 		 85 aa  61.6  0.000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.250826  hitchhiker  0.0000000000344115 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0959  acyl carrier protein  39.47 
 
 		 80 aa  60.5  0.000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2071  acyl carrier protein  41.79 
 
 		 74 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000431599  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1634  phosphopantetheine-binding  38.36 
 
 		 90 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1722  acyl carrier protein  33.78 
 
 		 75 aa  57.4  0.00000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17961  acyl carrier protein  41.89 
 
 		 80 aa  57  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0258441  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1382  acyl carrier protein  37.66 
 
 		 81 aa  57  0.00000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0180925  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2736  acyl carrier protein  40.3 
 
 		 80 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.875192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0643  acyl carrier protein  39.44 
 
 		 77 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000166271  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1096  acyl carrier protein  36.11 
 
 		 83 aa  55.8  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000417281  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10300  acyl carrier protein  42.03 
 
 		 78 aa  55.5  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00141848  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0746  acyl carrier protein  44.93 
 
 		 78 aa  55.5  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.746533  normal  0.50277 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0230  acyl carrier protein  36.99 
 
 		 79 aa  55.5  0.0000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0752  acyl carrier protein  42.25 
 
 		 79 aa  55.1  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0103187  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26061  acyl carrier protein  39.24 
 
 		 103 aa  54.7  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1157  acyl carrier protein  32.47 
 
 		 78 aa  54.7  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000567099  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0663  acyl carrier protein  37.33 
 
 		 77 aa  54.3  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00175647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0284  acyl carrier protein  35.8 
 
 		 82 aa  54.7  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2839  acyl carrier protein  40.3 
 
 		 79 aa  53.9  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0984  acyl carrier protein  38.03 
 
 		 82 aa  53.9  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.156105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2747  acyl carrier protein  40.3 
 
 		 79 aa  53.9  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3256  acyl carrier protein  37.84 
 
 		 82 aa  53.9  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.929714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2931  acyl carrier protein  40.3 
 
 		 79 aa  53.9  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0269  acyl carrier protein  35.53 
 
 		 81 aa  53.9  0.0000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107759  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0267  acyl carrier protein  35.53 
 
 		 81 aa  53.9  0.0000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0366533  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1701  acyl carrier protein  39.73 
 
 		 79 aa  53.5  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1530  acyl carrier protein  43.48 
 
 		 78 aa  53.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.129893  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18011  acyl carrier protein  39.73 
 
 		 79 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18181  acyl carrier protein  39.73 
 
 		 79 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.180905  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1058  acyl carrier protein  43.48 
 
 		 78 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0713713 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2463  acyl carrier protein  40.58 
 
 		 77 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1291  acyl carrier protein  40.91 
 
 		 77 aa  53.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1316  acyl carrier protein  40.91 
 
 		 77 aa  53.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1125  acyl carrier protein  40.58 
 
 		 77 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.854343  normal  0.264309 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1070  acyl carrier protein  40.58 
 
 		 77 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0381067  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1201  acyl carrier protein  43.48 
 
 		 78 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.576937  hitchhiker  0.00368899 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0798  acyl carrier protein  39.39 
 
 		 77 aa  52.4  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0459  acyl carrier protein  43.48 
 
 		 78 aa  52.4  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.997029  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3247  acyl carrier protein  39.13 
 
 		 78 aa  52  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0572  acyl carrier protein  43.48 
 
 		 78 aa  52.4  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000726263  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1185  acyl carrier protein  37.97 
 
 		 80 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00688444  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2874  acyl carrier protein  39.13 
 
 		 78 aa  52  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0334524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20601  acyl carrier protein  37.97 
 
 		 80 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0126  acyl carrier protein  37.97 
 
 		 80 aa  52.8  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.395264  hitchhiker  0.00283985 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0536  acyl carrier protein  37.97 
 
 		 80 aa  52.4  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.75126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4861  phosphopantetheine-binding  41.56 
 
 		 85 aa  52.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.830038  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0510  acyl carrier protein  33.33 
 
 		 77 aa  52.4  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0464  acyl carrier protein  43.48 
 
 		 78 aa  52.4  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3099  acyl carrier protein  32.86 
 
 		 76 aa  51.6  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0179771 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1767  acyl carrier protein  42.03 
 
 		 78 aa  51.6  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0300385  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3799  acyl carrier protein  39.71 
 
 		 78 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.181664  normal  0.777832 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1915  acyl carrier protein  39.71 
 
 		 78 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00426402  unclonable  0.000000216154 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0088  acyl carrier protein  38.03 
 
 		 78 aa  51.2  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0170  acyl carrier protein  37.97 
 
 		 80 aa  51.6  0.000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.519616  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2564  acyl carrier protein  33.33 
 
 		 77 aa  51.6  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1181  acyl carrier protein  33.78 
 
 		 76 aa  51.2  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185913  decreased coverage  0.00116588 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1768  acyl carrier protein  40.58 
 
 		 77 aa  51.6  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.461775 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1610  Acyl carrier protein (ACP)  35.71 
 
 		 90 aa  51.2  0.000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1052  acyl carrier protein  39.13 
 
 		 77 aa  51.2  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.784582  normal  0.0871909 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1416  acyl carrier protein  39.39 
 
 		 76 aa  51.2  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.28944  normal  0.571191 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1361  acyl carrier protein  35.71 
 
 		 76 aa  51.2  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000207547  normal  0.0506091 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0933  acyl carrier protein  35.38 
 
 		 74 aa  50.8  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000201436  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1011  acyl carrier protein  36 
 
 		 85 aa  50.8  0.000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000000303772  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>