More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1975 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1975  acyl carrier protein  100 
 
 		 79 aa  152  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.166506  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1639  phosphopantetheine-binding protein  80.77 
 
 		 87 aa  129  9e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0535915  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2371  acyl carrier protein  79.75 
 
 		 84 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.272715  normal  0.051956 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2951  phosphopantetheine-binding protein  85.53 
 
 		 80 aa  128  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.765509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7056  acyl carrier protein  75.95 
 
 		 79 aa  124  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0876  acyl carrier protein  67.53 
 
 		 84 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1325  acyl carrier protein  72.97 
 
 		 79 aa  108  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2778  acyl carrier protein  65.82 
 
 		 99 aa  107  7.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.961024 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3376  acyl carrier protein  65.82 
 
 		 97 aa  105  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3365  acyl carrier protein  65.82 
 
 		 97 aa  105  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257859  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3427  acyl carrier protein  65.82 
 
 		 97 aa  105  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3755  acyl carrier protein  65.82 
 
 		 99 aa  104  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.345144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10270  acyl carrier protein  73.24 
 
 		 81 aa  103  7e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.167244 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2039  acyl carrier protein  65.33 
 
 		 80 aa  101  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0051261  hitchhiker  0.00361328 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3122  phosphopantetheine-binding protein  60.76 
 
 		 101 aa  99.8  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.884659  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3512  acyl carrier protein  64.86 
 
 		 79 aa  99.8  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.410127  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4810  acyl carrier protein  60.76 
 
 		 82 aa  97.8  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0303207  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2725  phosphopantetheine-binding protein  60.76 
 
 		 101 aa  97.8  4e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3483  acyl carrier protein  61.84 
 
 		 82 aa  97.8  5e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.520778  normal  0.883416 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1263  acyl carrier protein  60.53 
 
 		 82 aa  97.1  8e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0921694 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14090  acyl carrier protein  60.26 
 
 		 82 aa  96.7  9e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.025354  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09300  acyl carrier protein  63.51 
 
 		 81 aa  96.7  9e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.421361  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6811  phosphopantetheine-binding  60.76 
 
 		 82 aa  96.3  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2152  phosphopantetheine-binding protein  59.74 
 
 		 82 aa  94  6e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3380  acyl carrier protein  59.72 
 
 		 79 aa  92  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0442067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16760  acyl carrier protein  56.41 
 
 		 82 aa  90.5  6e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00765703  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1805  acyl carrier protein  59.74 
 
 		 82 aa  90.1  8e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.200029  normal  0.0299727 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3622  acyl carrier protein  57.33 
 
 		 79 aa  90.1  8e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000545579 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1988  phosphopantetheine-binding  58.23 
 
 		 81 aa  90.1  9e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44915  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1517  phosphopantetheine-binding  57.14 
 
 		 82 aa  87.8  4e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.259778  normal  0.0737426 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3345  acyl carrier protein  56.58 
 
 		 81 aa  87.8  5e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0503244  normal  0.362492 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12273  acyl carrier protein  67.21 
 
 		 115 aa  87  8e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.46303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12010  acyl carrier protein  54.43 
 
 		 82 aa  86.3  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.114572  normal  0.0939277 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2137  phosphopantetheine-binding protein  55.84 
 
 		 82 aa  85.5  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2468  acyl carrier protein  54.05 
 
 		 81 aa  82  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000407512  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2207  acyl carrier protein  54.05 
 
 		 81 aa  80.9  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000161202 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4861  phosphopantetheine-binding  44 
 
 		 85 aa  73.2  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.830038  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1527  acyl carrier protein  47.95 
 
 		 79 aa  68.2  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10300  acyl carrier protein  46.48 
 
 		 78 aa  67  0.00000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00141848  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3407  acyl carrier protein  47.95 
 
 		 79 aa  67  0.00000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2564  acyl carrier protein  46.48 
 
 		 77 aa  66.2  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1641  acyl carrier protein  50 
 
 		 82 aa  65.5  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0663  acyl carrier protein  47.89 
 
 		 77 aa  65.1  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00175647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1634  phosphopantetheine-binding  41.18 
 
 		 90 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0088  acyl carrier protein  47.22 
 
 		 78 aa  65.5  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1339  acyl carrier protein  50 
 
 		 78 aa  63.2  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.52176  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0280  acyl carrier protein  51.56 
 
 		 78 aa  63.5  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.344257 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1672  acyl carrier protein  47.76 
 
 		 77 aa  62.8  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1610  Acyl carrier protein (ACP)  43.66 
 
 		 90 aa  62.4  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1733  acyl carrier protein  50.79 
 
 		 79 aa  62  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.9219  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0608  acyl carrier protein  53.23 
 
 		 79 aa  62.4  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000394559 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1382  acyl carrier protein  41.67 
 
 		 81 aa  62.4  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0180925  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1664  Acyl carrier protein (ACP)  48.48 
 
 		 78 aa  62  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0513886  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3071  acyl carrier protein  51.61 
 
 		 79 aa  62  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2931  acyl carrier protein  49.12 
 
 		 79 aa  61.2  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2747  acyl carrier protein  49.12 
 
 		 79 aa  61.2  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2839  acyl carrier protein  49.12 
 
 		 79 aa  61.2  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2071  acyl carrier protein  48.44 
 
 		 74 aa  61.6  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000431599  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2462  acyl carrier protein  46.48 
 
 		 73 aa  61.6  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0113419  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0984  acyl carrier protein  41.1 
 
 		 82 aa  61.2  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.156105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1232  acyl carrier protein  45.83 
 
 		 79 aa  60.8  0.000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152652  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0685  acyl carrier protein  40.85 
 
 		 75 aa  60.8  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00698969  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3646  acyl carrier protein  50 
 
 		 79 aa  60.8  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4504  acyl carrier protein  39.19 
 
 		 81 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1392  acyl carrier protein  47.69 
 
 		 79 aa  60.8  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26061  acyl carrier protein  41.56 
 
 		 103 aa  60.5  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1416  acyl carrier protein  44.29 
 
 		 76 aa  60.5  0.000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.28944  normal  0.571191 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1767  acyl carrier protein  48.48 
 
 		 78 aa  60.8  0.000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0300385  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5269  acyl carrier protein  50 
 
 		 79 aa  60.5  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1186  acyl carrier protein  50 
 
 		 79 aa  60.5  0.000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.026536 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2630  acyl carrier protein  50 
 
 		 79 aa  60.5  0.000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3277  acyl carrier protein  50 
 
 		 79 aa  60.5  0.000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.796037  normal  0.660207 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0959  acyl carrier protein  44.44 
 
 		 80 aa  60.5  0.000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1915  acyl carrier protein  45.07 
 
 		 78 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00426402  unclonable  0.000000216154 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2805  acyl carrier protein  46.88 
 
 		 79 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0533  acyl carrier protein  46.88 
 
 		 79 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1799  acyl carrier protein  46.88 
 
 		 79 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.714333  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2018  Acyl carrier protein (ACP)  44.29 
 
 		 78 aa  59.3  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000498687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1004  acyl carrier protein  46.88 
 
 		 79 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.486697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3799  acyl carrier protein  45.07 
 
 		 78 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.181664  normal  0.777832 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2904  acyl carrier protein  46.88 
 
 		 79 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4236  acyl carrier protein  46.88 
 
 		 79 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.223636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2180  acyl carrier protein  46.88 
 
 		 79 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.253205  normal  0.154334 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0417  acyl carrier protein  43.06 
 
 		 77 aa  59.7  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1720  acyl carrier protein  46.88 
 
 		 79 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2850  acyl carrier protein  46.88 
 
 		 79 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.814249  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2789  acyl carrier protein  46.88 
 
 		 79 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2476  acyl carrier protein  46.88 
 
 		 79 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1075  acyl carrier protein  46.88 
 
 		 79 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.777412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2909  acyl carrier protein  46.88 
 
 		 79 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4505  acyl carrier protein  48.44 
 
 		 81 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265662  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0644  acyl carrier protein  46.88 
 
 		 79 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1000  acyl carrier protein  46.88 
 
 		 79 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1082  acyl carrier protein  46.88 
 
 		 79 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1124  acyl carrier protein  46.88 
 
 		 79 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0831  acyl carrier protein  46.88 
 
 		 79 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1765  acyl carrier protein  43.04 
 
 		 78 aa  59.3  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3358  acyl carrier protein  44.44 
 
 		 79 aa  58.9  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.304425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2785  acyl carrier protein  42.47 
 
 		 78 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3198  acyl carrier protein  42.47 
 
 		 78 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0370442 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>