174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1489 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1489  phosphopantetheine-binding  100 
 
 		 83 aa  162  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004065  acyl carrier protein  51.22 
 
 		 85 aa  86.7  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0436  acyl carrier protein  48.15 
 
 		 84 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4379  acyl-carrier-protein  49.4 
 
 		 85 aa  85.5  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00582273  normal  0.0972461 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4570  acyl carrier protein  50 
 
 		 82 aa  85.9  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3922  acyl carrier protein  50 
 
 		 85 aa  84.7  4e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0929  acyl carrier protein  53.75 
 
 		 83 aa  84.7  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4763  acyl carrier protein  52.5 
 
 		 81 aa  84.7  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.065062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3062  acyl carrier protein  53.75 
 
 		 83 aa  84.7  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.73924  normal  0.979198 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3686  acyl carrier protein  52.5 
 
 		 81 aa  84.7  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.630716 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5094  acyl carrier protein, putative  49.38 
 
 		 86 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3380  acyl carrier protein  52.56 
 
 		 82 aa  84.3  5e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4075  acyl carrier protein  51.22 
 
 		 82 aa  84  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0351  acyl carrier protein  52.56 
 
 		 82 aa  84  6e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3600  acyl carrier protein  51.22 
 
 		 82 aa  84  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3887  acyl carrier protein  51.95 
 
 		 93 aa  82.8  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2102  acyl carrier protein  50.63 
 
 		 83 aa  82.8  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.493775  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0438  acyl carrier protein  48.78 
 
 		 84 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.517567 
 
 
-
 
NC_003296  RS00792  acyl carrier protein  51.25 
 
 		 81 aa  80.9  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0692  acyl carrier protein  53.95 
 
 		 85 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0950683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0339  acyl carrier protein  47.44 
 
 		 82 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4369  acyl carrier protein  47.44 
 
 		 82 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0349  acyl carrier protein  47.44 
 
 		 82 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000321207 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0341  acyl carrier protein  47.44 
 
 		 82 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.667101  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0445  acyl carrier protein  47.44 
 
 		 82 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.377393  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0346  acyl carrier protein  47.44 
 
 		 82 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0891  acyl carrier protein  46.84 
 
 		 83 aa  77.4  0.00000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.515732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0324  acyl carrier protein  49.35 
 
 		 82 aa  76.6  0.00000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00657258 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0343  acyl carrier protein  46.15 
 
 		 82 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.317237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3889  acyl carrier protein  46.25 
 
 		 82 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0349  acyl carrier protein  46.15 
 
 		 82 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3677  acyl carrier protein  46.15 
 
 		 82 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0913406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4801  acyl carrier protein  45.45 
 
 		 83 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3876  phosphopantetheine-binding  47.37 
 
 		 82 aa  74.7  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.508072 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4597  acyl carrier protein  47.44 
 
 		 80 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000178054 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3512  acyl carrier protein  45 
 
 		 82 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.126809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0112  acyl carrier protein  43.9 
 
 		 82 aa  62.4  0.000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2174  putative diguanylate cyclase  41.33 
 
 		 81 aa  58.2  0.00000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.377661  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1011  acyl carrier protein  31.25 
 
 		 85 aa  57.4  0.00000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000000303772  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1856  phosphopantetheine-binding protein  37.04 
 
 		 85 aa  56.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0969  acyl carrier protein  38.67 
 
 		 84 aa  55.5  0.0000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000264763  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0883  acyl carrier protein  35.62 
 
 		 82 aa  52.8  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000242851  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1849  acyl carrier protein  32.39 
 
 		 77 aa  52  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000445968  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0944  acyl carrier protein  34.72 
 
 		 79 aa  51.2  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000174331  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03900  acyl carrier protein  38.36 
 
 		 80 aa  51.2  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.486098  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1105  hypothetical protein  34.18 
 
 		 84 aa  51.2  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1157  acyl carrier protein  36.36 
 
 		 78 aa  49.3  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000567099  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0267  acyl carrier protein  32.91 
 
 		 81 aa  49.3  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0366533  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4067  acyl carrier protein  30.12 
 
 		 82 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1345  acyl carrier protein  29.87 
 
 		 79 aa  48.9  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.095592  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0269  acyl carrier protein  32.91 
 
 		 81 aa  49.3  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107759  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1641  acyl carrier protein  28.21 
 
 		 82 aa  48.5  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0959  acyl carrier protein  32.43 
 
 		 80 aa  48.1  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1537  phosphopantetheine-binding  32.88 
 
 		 84 aa  47.4  0.00006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.157391  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0908  phosphopantetheine-binding protein  40.28 
 
 		 88 aa  47.4  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1420  acyl carrier protein  32 
 
 		 79 aa  47.4  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.704183 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1527  acyl carrier protein  30.56 
 
 		 79 aa  47.4  0.00008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1382  acyl carrier protein  31.17 
 
 		 81 aa  47  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0180925  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1639  phosphopantetheine-binding protein  30 
 
 		 87 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0535915  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1258  acyl carrier protein  33.33 
 
 		 79 aa  45.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0685  acyl carrier protein  29.58 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00698969  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3647  acyl carrier protein  25 
 
 		 84 aa  45.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0742845  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1633  acyl carrier protein  26.51 
 
 		 83 aa  45.8  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1996  hypothetical protein  35 
 
 		 88 aa  46.2  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.889305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1361  acyl carrier protein  26.76 
 
 		 76 aa  45.8  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000207547  normal  0.0506091 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1160  acyl carrier protein  30.67 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000195346  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1510  phosphopantetheine-binding  32.94 
 
 		 94 aa  45.1  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.406457  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2121  acyl carrier protein  33.8 
 
 		 79 aa  45.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000862864  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2689  acyl carrier protein  30.49 
 
 		 82 aa  45.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0984  acyl carrier protein  31.33 
 
 		 82 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.156105  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1026  acyl carrier protein  32.35 
 
 		 78 aa  44.7  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000177026  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0773  acyl carrier protein  29.33 
 
 		 85 aa  45.1  0.0004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.250826  hitchhiker  0.0000000000344115 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2462  acyl carrier protein  33.33 
 
 		 73 aa  44.7  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0113419  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1088  acyl carrier protein  30.26 
 
 		 80 aa  44.7  0.0004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.3263  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2071  acyl carrier protein  29.85 
 
 		 74 aa  45.1  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000431599  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0990  acyl carrier protein  27.16 
 
 		 82 aa  44.7  0.0004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.567267  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7056  acyl carrier protein  30.14 
 
 		 79 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0310  Acyl carrier protein  28.75 
 
 		 79 aa  44.7  0.0005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.697361  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1439  acyl carrier protein  32.39 
 
 		 77 aa  44.3  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2564  acyl carrier protein  32 
 
 		 77 aa  44.3  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3407  acyl carrier protein  29.17 
 
 		 79 aa  43.9  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4505  acyl carrier protein  30 
 
 		 81 aa  43.9  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265662  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0798  acyl carrier protein  25.68 
 
 		 77 aa  42.7  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0873  acyl carrier protein  32.86 
 
 		 79 aa  43.5  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4413  phosphopantetheine-binding protein  36.36 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.864281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1629  acyl carrier protein  32.86 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14930  acyl carrier protein  30.99 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3256  acyl carrier protein  31.33 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.929714  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2298  acyl carrier protein  31.43 
 
 		 77 aa  42.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00108603  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1351  acyl carrier protein  27.63 
 
 		 82 aa  42.7  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1347  acyl carrier protein  27.63 
 
 		 82 aa  42.7  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02710  acyl carrier protein  31.43 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.312215  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1722  acyl carrier protein  32.88 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0876  acyl carrier protein  25.33 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1979  acyl carrier protein  32.39 
 
 		 77 aa  42.4  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000485272  decreased coverage  0.000456446 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1834  acyl carrier protein  29.58 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0103322  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1604  acyl carrier protein  33.8 
 
 		 77 aa  42.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000038664  decreased coverage  0.000139314 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0310  acyl carrier protein  32.88 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00336649  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0779  phosphopantetheine-binding protein  29.17 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0752  acyl carrier protein  34.85 
 
 		 79 aa  42.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0103187  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>