More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4413 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4413  phosphopantetheine-binding protein  100 
 
 		 77 aa  157  7e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.864281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2816  phosphopantetheine-binding protein  45.83 
 
 		 86 aa  77  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3249  acyl carrier protein  52.94 
 
 		 79 aa  75.9  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.124771  normal  0.0273605 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1392  acyl carrier protein  51.47 
 
 		 79 aa  75.5  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2630  acyl carrier protein  50 
 
 		 79 aa  75.9  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5269  acyl carrier protein  50 
 
 		 79 aa  75.9  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3277  acyl carrier protein  50 
 
 		 79 aa  75.9  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.796037  normal  0.660207 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1186  acyl carrier protein  50 
 
 		 79 aa  75.9  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.026536 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3646  acyl carrier protein  48.68 
 
 		 79 aa  73.2  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1733  acyl carrier protein  47.37 
 
 		 79 aa  72  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.9219  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1548  Acyl carrier protein (ACP)  48.57 
 
 		 77 aa  71.6  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.079585  normal  0.066745 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3071  acyl carrier protein  50.72 
 
 		 79 aa  71.2  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1053  acyl carrier protein  47.22 
 
 		 79 aa  70.5  0.000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.549233 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1082  acyl carrier protein  47.22 
 
 		 79 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0533  acyl carrier protein  47.22 
 
 		 79 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2850  acyl carrier protein  47.22 
 
 		 79 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.814249  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2904  acyl carrier protein  47.22 
 
 		 79 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4236  acyl carrier protein  47.22 
 
 		 79 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.223636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2789  acyl carrier protein  47.22 
 
 		 79 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0831  acyl carrier protein  47.22 
 
 		 79 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2476  acyl carrier protein  47.22 
 
 		 79 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1720  acyl carrier protein  47.22 
 
 		 79 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2805  acyl carrier protein  47.22 
 
 		 79 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1075  acyl carrier protein  47.22 
 
 		 79 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.777412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1799  acyl carrier protein  47.22 
 
 		 79 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.714333  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0644  acyl carrier protein  47.22 
 
 		 79 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2180  acyl carrier protein  47.22 
 
 		 79 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.253205  normal  0.154334 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1000  acyl carrier protein  47.22 
 
 		 79 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1124  acyl carrier protein  47.22 
 
 		 79 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2909  acyl carrier protein  47.22 
 
 		 79 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1004  acyl carrier protein  47.22 
 
 		 79 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.486697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2262  acyl carrier protein  47.22 
 
 		 79 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.033873  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1672  acyl carrier protein  46.67 
 
 		 77 aa  69.7  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0984  acyl carrier protein  49.35 
 
 		 82 aa  69.7  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.156105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2427  acyl carrier protein  47.22 
 
 		 79 aa  69.7  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.954024  normal  0.837243 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0166  acyl carrier protein  47.14 
 
 		 78 aa  70.1  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.317698  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1398  acyl carrier protein  49.21 
 
 		 78 aa  69.7  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.359191 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0608  acyl carrier protein  49.28 
 
 		 79 aa  69.3  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000394559 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0983  acyl carrier protein  46.88 
 
 		 79 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.415355  normal  0.0515815 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0918  acyl carrier protein  46.88 
 
 		 79 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.150298  normal  0.183908 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3256  acyl carrier protein  49.35 
 
 		 82 aa  68.9  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.929714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1641  acyl carrier protein  56.14 
 
 		 82 aa  68.2  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2689  acyl carrier protein  50 
 
 		 82 aa  68.2  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0284  acyl carrier protein  47.76 
 
 		 82 aa  68.6  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10300  acyl carrier protein  47.83 
 
 		 78 aa  68.2  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00141848  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14930  acyl carrier protein  45.83 
 
 		 78 aa  68.2  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2462  acyl carrier protein  48.44 
 
 		 73 aa  68.2  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0113419  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0401  acyl carrier protein  51.56 
 
 		 79 aa  67.8  0.00000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00338401  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01090  acyl carrier protein  44 
 
 		 78 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000166866  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2553  acyl carrier protein  44 
 
 		 78 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000526358  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1215  acyl carrier protein  44 
 
 		 78 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000103813  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2033  acyl carrier protein  44 
 
 		 78 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000123338  hitchhiker  0.00000256014 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2507  acyl carrier protein  44 
 
 		 78 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996587  hitchhiker  0.000000169384 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1990  acyl carrier protein  44 
 
 		 78 aa  67.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000000274294  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1310  acyl carrier protein  44 
 
 		 78 aa  67.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000174722  decreased coverage  4.37915e-18 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1295  acyl carrier protein  44 
 
 		 78 aa  67.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000656136  decreased coverage  3.5580799999999995e-20 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1834  acyl carrier protein  45.31 
 
 		 79 aa  67.8  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0103322  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1473  acyl carrier protein  44 
 
 		 78 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000000839248  hitchhiker  0.00000000000000262365 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2195  acyl carrier protein  45.95 
 
 		 78 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1216  acyl carrier protein  44 
 
 		 78 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  3.59624e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2230  acyl carrier protein  44 
 
 		 78 aa  67.8  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.78439e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1266  acyl carrier protein  44 
 
 		 78 aa  67.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000000383773  normal  0.0632427 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25670  acyl carrier protein  45.95 
 
 		 78 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000226432  normal  0.748876 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01098  hypothetical protein  44 
 
 		 78 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000144532  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2173  acyl carrier protein  44 
 
 		 78 aa  67.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000401427  hitchhiker  0.000000000000202194 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1915  acyl carrier protein  46.67 
 
 		 78 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00426402  unclonable  0.000000216154 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3799  acyl carrier protein  46.67 
 
 		 78 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.181664  normal  0.777832 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3105  acyl carrier protein  45.71 
 
 		 77 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000128081  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1157  acyl carrier protein  45.71 
 
 		 77 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.917954 
 
 
-
 
NC_006686  CND04410  acyl carrier protein (acp), putative  44.78 
 
 		 127 aa  67.4  0.00000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0685  acyl carrier protein  48.44 
 
 		 75 aa  67.4  0.00000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00698969  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0174  acyl carrier protein  45.71 
 
 		 80 aa  67.4  0.00000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2493  acyl carrier protein  45.71 
 
 		 78 aa  67.4  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1629  acyl carrier protein  45.83 
 
 		 78 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1935  acyl carrier protein  48.57 
 
 		 77 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000441044  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0196  acyl carrier protein  47.14 
 
 		 79 aa  67  0.00000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0408  acyl carrier protein  50 
 
 		 79 aa  67  0.00000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.442287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1602  acyl carrier protein  47.14 
 
 		 77 aa  67  0.00000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000714682  normal  0.960802 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0179  acyl carrier protein  47.14 
 
 		 78 aa  67  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00024894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2325  acyl carrier protein  47.22 
 
 		 79 aa  67  0.00000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.596605  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1604  acyl carrier protein  47.14 
 
 		 77 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.0000908014  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1491  acyl carrier protein  44 
 
 		 78 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1526  acyl carrier protein  44 
 
 		 78 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.262214 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4156  acyl carrier protein  44 
 
 		 78 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.035668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0605  acyl carrier protein  42.65 
 
 		 84 aa  66.2  0.0000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  9.329130000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0639  acyl carrier protein  47.83 
 
 		 79 aa  66.2  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.299203 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0363  acyl carrier protein  48.57 
 
 		 78 aa  66.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.878931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1923  acyl carrier protein  44.12 
 
 		 79 aa  66.6  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000792988  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1866  acyl carrier protein  46.88 
 
 		 77 aa  66.2  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00815396  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3498  acyl carrier protein  43.94 
 
 		 78 aa  65.5  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000503689  hitchhiker  0.00947262 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1439  acyl carrier protein  48.44 
 
 		 77 aa  65.5  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1878  acyl carrier protein  45.71 
 
 		 77 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0843624  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1504  acyl carrier protein  43.06 
 
 		 78 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0070299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1584  acyl carrier protein  43.75 
 
 		 82 aa  65.5  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34262  normal  0.0373148 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1909  acyl carrier protein  43.75 
 
 		 82 aa  65.5  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.045523  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002997  acyl carrier protein  43.94 
 
 		 77 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000114141  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0168  acyl carrier protein  45.45 
 
 		 76 aa  66.2  0.0000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000122767  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1157  acyl carrier protein  50 
 
 		 78 aa  65.9  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000567099  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1745  acyl carrier protein  47.14 
 
 		 77 aa  65.5  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000920991  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1579  acyl carrier protein  43.94 
 
 		 78 aa  65.5  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.86341e-19  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>