More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2816 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_2816  phosphopantetheine-binding protein  100 
 
 
86 aa  172  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4413  phosphopantetheine-binding protein  45.83 
 
 
77 aa  77  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.864281  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0166  acyl carrier protein  34.67 
 
 
78 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.317698  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0196  acyl carrier protein  34.62 
 
 
79 aa  63.2  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1661  acyl carrier protein  34.62 
 
 
79 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2493  acyl carrier protein  34.67 
 
 
78 aa  61.6  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0284  acyl carrier protein  35.14 
 
 
82 aa  60.8  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6611  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0130  acyl carrier protein  34.67 
 
 
78 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0263096  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0174  acyl carrier protein  31.17 
 
 
80 aa  59.3  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1096  acyl carrier protein  38.96 
 
 
83 aa  58.5  0.00000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000417281  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1768  acyl carrier protein  36.36 
 
 
77 aa  57.8  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.461775 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1125  acyl carrier protein  35.14 
 
 
77 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.854343  normal  0.264309 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0798  acyl carrier protein  38.24 
 
 
77 aa  56.2  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1157  acyl carrier protein  37.5 
 
 
78 aa  56.6  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000567099  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0179  acyl carrier protein  31.08 
 
 
78 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00024894  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1909  acyl carrier protein  35.06 
 
 
82 aa  56.6  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.045523  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2463  acyl carrier protein  35.14 
 
 
77 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1070  acyl carrier protein  35.14 
 
 
77 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0381067  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1584  acyl carrier protein  35.06 
 
 
82 aa  56.6  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34262  normal  0.0373148 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1052  acyl carrier protein  35.14 
 
 
77 aa  56.6  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.784582  normal  0.0871909 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0713  acyl carrier protein  34.67 
 
 
78 aa  55.5  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000031745  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1319  acyl carrier protein  35.62 
 
 
78 aa  55.8  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.346066  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1834  acyl carrier protein  34.25 
 
 
79 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0103322  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0510  acyl carrier protein  40.91 
 
 
77 aa  55.8  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0363  acyl carrier protein  36.36 
 
 
78 aa  55.1  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.878931  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0984  acyl carrier protein  32 
 
 
82 aa  55.5  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.156105  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03150  acyl carrier protein  34.25 
 
 
77 aa  55.1  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01090  acyl carrier protein  34.67 
 
 
78 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000166866  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2553  acyl carrier protein  34.67 
 
 
78 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000526358  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1291  acyl carrier protein  36.76 
 
 
77 aa  54.7  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1215  acyl carrier protein  34.67 
 
 
78 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000103813  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1310  acyl carrier protein  34.67 
 
 
78 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000174722  decreased coverage  4.37915e-18 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1990  acyl carrier protein  34.67 
 
 
78 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000000274294  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1316  acyl carrier protein  36.76 
 
 
77 aa  54.7  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2173  acyl carrier protein  34.67 
 
 
78 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000401427  hitchhiker  0.000000000000202194 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1208  hypothetical protein  34.72 
 
 
80 aa  54.7  0.0000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000845225 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1295  acyl carrier protein  34.67 
 
 
78 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000656136  decreased coverage  3.5580799999999995e-20 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1266  acyl carrier protein  34.67 
 
 
78 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000000383773  normal  0.0632427 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2507  acyl carrier protein  34.67 
 
 
78 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996587  hitchhiker  0.000000169384 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0605  acyl carrier protein  35 
 
 
84 aa  54.7  0.0000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  9.329130000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1473  acyl carrier protein  34.67 
 
 
78 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000000839248  hitchhiker  0.00000000000000262365 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01098  hypothetical protein  34.67 
 
 
78 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000144532  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1216  acyl carrier protein  34.67 
 
 
78 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  3.59624e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2230  acyl carrier protein  34.67 
 
 
78 aa  54.7  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.78439e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2033  acyl carrier protein  34.67 
 
 
78 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000123338  hitchhiker  0.00000256014 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1232  acyl carrier protein  35.62 
 
 
79 aa  54.3  0.0000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152652  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1629  acyl carrier protein  33.33 
 
 
78 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4067  acyl carrier protein  34.72 
 
 
82 aa  53.9  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02710  acyl carrier protein  33.77 
 
 
79 aa  54.3  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.312215  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0643  acyl carrier protein  40.32 
 
 
77 aa  53.9  0.0000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000166271  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0660  acyl carrier protein  31.17 
 
 
81 aa  53.9  0.0000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.179037  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1392  acyl carrier protein  36.11 
 
 
79 aa  54.3  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3892  acyl carrier protein  34.25 
 
 
77 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3701  acyl carrier protein  34.25 
 
 
77 aa  53.9  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3591  acyl carrier protein  34.25 
 
 
77 aa  53.9  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3609  acyl carrier protein  34.25 
 
 
77 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3949  acyl carrier protein  34.25 
 
 
77 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.457007  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3988  acyl carrier protein  34.25 
 
 
77 aa  53.9  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.168963  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0752  acyl carrier protein  33.77 
 
 
79 aa  53.9  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0103187  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10300  acyl carrier protein  40.32 
 
 
78 aa  53.9  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00141848  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1294  acyl carrier protein  34.25 
 
 
77 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0897377  hitchhiker  0.00000000000000136256 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3864  acyl carrier protein  34.25 
 
 
77 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.3997e-48 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1672  acyl carrier protein  35.71 
 
 
77 aa  53.9  0.0000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3898  acyl carrier protein  34.25 
 
 
77 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000161668  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2502  acyl carrier protein  34.25 
 
 
77 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000438987  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3673  acyl carrier protein  34.25 
 
 
77 aa  53.9  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.173328  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1137  acyl carrier protein  34.25 
 
 
78 aa  53.5  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2195  acyl carrier protein  32 
 
 
78 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0873  acyl carrier protein  33.77 
 
 
79 aa  53.5  0.0000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1186  acyl carrier protein  36.11 
 
 
79 aa  53.5  0.0000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.026536 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5269  acyl carrier protein  36.11 
 
 
79 aa  53.5  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1722  acyl carrier protein  43.33 
 
 
75 aa  53.5  0.0000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2630  acyl carrier protein  36.11 
 
 
79 aa  53.5  0.0000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25670  acyl carrier protein  32 
 
 
78 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000226432  normal  0.748876 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3277  acyl carrier protein  36.11 
 
 
79 aa  53.5  0.0000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.796037  normal  0.660207 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2850  acyl carrier protein  32.47 
 
 
79 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.814249  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1799  acyl carrier protein  32.47 
 
 
79 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.714333  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0533  acyl carrier protein  32.47 
 
 
79 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2909  acyl carrier protein  32.47 
 
 
79 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1648  acyl carrier protein  32.47 
 
 
80 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00355954  normal  0.46932 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2565  acyl carrier protein  32.88 
 
 
78 aa  53.1  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1004  acyl carrier protein  32.47 
 
 
79 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.486697  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2904  acyl carrier protein  32.47 
 
 
79 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2789  acyl carrier protein  32.47 
 
 
79 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4236  acyl carrier protein  32.47 
 
 
79 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.223636  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1609  acyl carrier protein  33.33 
 
 
78 aa  52.8  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000323844  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2180  acyl carrier protein  32.47 
 
 
79 aa  53.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.253205  normal  0.154334 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2476  acyl carrier protein  32.47 
 
 
79 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1720  acyl carrier protein  32.47 
 
 
79 aa  53.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1339  acyl carrier protein  35.62 
 
 
78 aa  53.1  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.52176  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14930  acyl carrier protein  32.88 
 
 
78 aa  53.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1075  acyl carrier protein  32.47 
 
 
79 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.777412  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3249  acyl carrier protein  36.11 
 
 
79 aa  52.8  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.124771  normal  0.0273605 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0644  acyl carrier protein  32.47 
 
 
79 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1082  acyl carrier protein  32.47 
 
 
79 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1398  acyl carrier protein  32.47 
 
 
78 aa  53.1  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.359191 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0831  acyl carrier protein  32.47 
 
 
79 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1000  acyl carrier protein  32.47 
 
 
79 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1124  acyl carrier protein  32.47 
 
 
79 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2805  acyl carrier protein  32.47 
 
 
79 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>