More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0174 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0174  acyl carrier protein  100 
 
 
80 aa  154  3e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0179  acyl carrier protein  93.33 
 
 
78 aa  135  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00024894  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1661  acyl carrier protein  85.71 
 
 
79 aa  133  9.999999999999999e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0196  acyl carrier protein  84.81 
 
 
79 aa  132  9.999999999999999e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0130  acyl carrier protein  88.16 
 
 
78 aa  131  1.9999999999999998e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0263096  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0166  acyl carrier protein  89.47 
 
 
78 aa  131  1.9999999999999998e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.317698  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2493  acyl carrier protein  88.16 
 
 
78 aa  131  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2325  acyl carrier protein  64.47 
 
 
79 aa  97.8  4e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.596605  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1584  acyl carrier protein  61.43 
 
 
82 aa  95.9  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34262  normal  0.0373148 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1909  acyl carrier protein  61.43 
 
 
82 aa  95.9  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.045523  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1090  acyl carrier protein  62.5 
 
 
77 aa  96.3  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.343466  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0660  acyl carrier protein  59.26 
 
 
81 aa  95.5  2e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.179037  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2121  acyl carrier protein  61.33 
 
 
79 aa  94.7  4e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000862864  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1606  acyl carrier protein  59.72 
 
 
110 aa  92  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  8.57537e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2018  Acyl carrier protein (ACP)  60 
 
 
78 aa  92.4  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000498687  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1232  acyl carrier protein  60 
 
 
79 aa  92.8  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152652  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02907  acyl carrier protein  59.46 
 
 
77 aa  92.4  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02710  acyl carrier protein  58.57 
 
 
79 aa  92.4  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.312215  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002997  acyl carrier protein  59.46 
 
 
77 aa  92.4  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000114141  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0168  acyl carrier protein  61.11 
 
 
76 aa  92.4  2e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000122767  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1075  acyl carrier protein  58.9 
 
 
78 aa  91.7  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.690942  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3247  acyl carrier protein  62.69 
 
 
78 aa  91.3  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0873  acyl carrier protein  58.57 
 
 
79 aa  91.3  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1420  acyl carrier protein  58.57 
 
 
79 aa  91.3  4e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.704183 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2874  acyl carrier protein  62.69 
 
 
78 aa  91.3  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0334524  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1548  Acyl carrier protein (ACP)  62.69 
 
 
77 aa  90.9  5e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.079585  normal  0.066745 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1664  Acyl carrier protein (ACP)  60 
 
 
78 aa  90.9  5e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0513886  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1137  acyl carrier protein  61.33 
 
 
78 aa  90.9  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1504  acyl carrier protein  61.43 
 
 
78 aa  90.5  6e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0070299  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2000  acyl carrier protein  64.29 
 
 
76 aa  90.1  9e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0605  acyl carrier protein  57.14 
 
 
84 aa  89.7  1e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  9.329130000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2298  acyl carrier protein  60 
 
 
77 aa  89  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00108603  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1579  acyl carrier protein  60 
 
 
78 aa  89  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.86341e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2623  acyl carrier protein  58.57 
 
 
77 aa  88.6  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000188634  unclonable  0.0000000000890491 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2292  acyl carrier protein  58.57 
 
 
77 aa  88.6  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000308066  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2493  acyl carrier protein  58.57 
 
 
77 aa  88.6  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000155434  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1687  acyl carrier protein  60 
 
 
78 aa  89  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000299329  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1500  acyl carrier protein  58.57 
 
 
77 aa  88.6  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000077006  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3498  acyl carrier protein  60 
 
 
78 aa  89  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000503689  hitchhiker  0.00947262 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1979  acyl carrier protein  60 
 
 
77 aa  89  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000485272  decreased coverage  0.000456446 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1834  acyl carrier protein  57.14 
 
 
79 aa  88.6  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0103322  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1720  acyl carrier protein  60 
 
 
77 aa  88.6  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138911  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2775  acyl carrier protein  60 
 
 
77 aa  88.6  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1760  acyl carrier protein  60 
 
 
77 aa  88.6  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000614435  normal  0.41842 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1351  acyl carrier protein  55.71 
 
 
82 aa  88.2  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1347  acyl carrier protein  55.71 
 
 
82 aa  88.2  3e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1935  acyl carrier protein  63.24 
 
 
77 aa  88.6  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000441044  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1491  acyl carrier protein  57.33 
 
 
78 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114932  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1717  acyl carrier protein  60 
 
 
77 aa  88.6  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000515668  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1319  acyl carrier protein  57.89 
 
 
78 aa  88.2  3e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.346066  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1583  acyl carrier protein  60 
 
 
77 aa  88.6  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000266609  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1923  acyl carrier protein  57.33 
 
 
79 aa  88.2  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000792988  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2043  acyl carrier protein  57.14 
 
 
77 aa  88.2  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000099502  decreased coverage  0.00468408 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1398  acyl carrier protein  60.56 
 
 
78 aa  88.6  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.359191 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2395  acyl carrier protein  60 
 
 
77 aa  88.6  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000802043  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2465  acyl carrier protein  60 
 
 
77 aa  88.6  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000179854  hitchhiker  0.00129052 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2572  acyl carrier protein  60 
 
 
77 aa  88.6  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000656295  hitchhiker  0.00274043 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1604  acyl carrier protein  58.57 
 
 
77 aa  87.8  4e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000038664  decreased coverage  0.000139314 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1580  acyl carrier protein  55.71 
 
 
84 aa  87.8  5e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000805484  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1526  acyl carrier protein  57.14 
 
 
78 aa  87.4  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.262214 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1604  acyl carrier protein  59.15 
 
 
77 aa  87  7e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.0000908014  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1915  acyl carrier protein  55.71 
 
 
78 aa  87  7e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00426402  unclonable  0.000000216154 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0713  acyl carrier protein  57.14 
 
 
78 aa  87  7e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000031745  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1096  acyl carrier protein  54.67 
 
 
83 aa  87  7e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000417281  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1258  acyl carrier protein  58.57 
 
 
79 aa  87  8e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1157  acyl carrier protein  56.94 
 
 
77 aa  86.3  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.917954 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2476  acyl carrier protein  59.42 
 
 
79 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2195  acyl carrier protein  52 
 
 
78 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1053  acyl carrier protein  60.87 
 
 
79 aa  86.3  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.549233 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1082  acyl carrier protein  59.42 
 
 
79 aa  86.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0533  acyl carrier protein  59.42 
 
 
79 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2180  acyl carrier protein  59.42 
 
 
79 aa  86.7  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.253205  normal  0.154334 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1648  acyl carrier protein  49.35 
 
 
80 aa  85.9  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00355954  normal  0.46932 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2805  acyl carrier protein  59.42 
 
 
79 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2262  acyl carrier protein  60.87 
 
 
79 aa  86.3  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.033873  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2904  acyl carrier protein  59.42 
 
 
79 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4236  acyl carrier protein  59.42 
 
 
79 aa  86.7  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.223636  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1602  acyl carrier protein  59.15 
 
 
77 aa  86.3  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000714682  normal  0.960802 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3105  acyl carrier protein  56.94 
 
 
77 aa  86.3  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000128081  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1004  acyl carrier protein  59.42 
 
 
79 aa  86.7  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.486697  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1720  acyl carrier protein  59.42 
 
 
79 aa  86.7  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1733  acyl carrier protein  57.33 
 
 
79 aa  86.3  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.9219  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1630  acyl carrier protein  55.71 
 
 
78 aa  86.3  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000123369  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2502  acyl carrier protein  58.57 
 
 
78 aa  86.3  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000398484  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1075  acyl carrier protein  59.42 
 
 
79 aa  86.7  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.777412  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2427  acyl carrier protein  60.87 
 
 
79 aa  86.3  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.954024  normal  0.837243 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1799  acyl carrier protein  59.42 
 
 
79 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.714333  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0644  acyl carrier protein  59.42 
 
 
79 aa  86.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3799  acyl carrier protein  55.71 
 
 
78 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.181664  normal  0.777832 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2909  acyl carrier protein  59.42 
 
 
79 aa  86.7  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1000  acyl carrier protein  59.42 
 
 
79 aa  86.7  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25670  acyl carrier protein  52 
 
 
78 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000226432  normal  0.748876 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2850  acyl carrier protein  59.42 
 
 
79 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.814249  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1124  acyl carrier protein  59.42 
 
 
79 aa  86.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2807  acyl carrier protein  58.57 
 
 
78 aa  86.3  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000000875833  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0831  acyl carrier protein  59.42 
 
 
79 aa  86.7  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2789  acyl carrier protein  59.42 
 
 
79 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1878  acyl carrier protein  56.94 
 
 
77 aa  85.9  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0843624  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1624  acyl carrier protein  58.57 
 
 
78 aa  85.5  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000729948  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1588  acyl carrier protein  58.57 
 
 
78 aa  85.5  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000112562  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>