162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2663 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_2663  putative acyl carrier protein  100 
 
 
86 aa  164  4e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0908  phosphopantetheine-binding protein  53.95 
 
 
88 aa  83.2  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0550  hypothetical protein  46.58 
 
 
82 aa  64.3  0.0000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.324262  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1856  phosphopantetheine-binding protein  42.11 
 
 
85 aa  61.2  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3922  acyl carrier protein  40.28 
 
 
85 aa  56.2  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1105  hypothetical protein  40.54 
 
 
84 aa  55.8  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1996  hypothetical protein  40.96 
 
 
88 aa  55.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.889305  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0349  acyl carrier protein  42.03 
 
 
82 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000321207 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0341  acyl carrier protein  42.03 
 
 
82 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.667101  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0339  acyl carrier protein  42.03 
 
 
82 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0346  acyl carrier protein  42.03 
 
 
82 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4597  acyl carrier protein  42.03 
 
 
80 aa  54.7  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000178054 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0445  acyl carrier protein  40.58 
 
 
82 aa  53.5  0.0000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.377393  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0891  acyl carrier protein  40.28 
 
 
83 aa  53.5  0.0000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.515732  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17961  acyl carrier protein  35.8 
 
 
80 aa  52.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0258441  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3887  acyl carrier protein  39.73 
 
 
93 aa  53.1  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0349  acyl carrier protein  40.58 
 
 
82 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3677  acyl carrier protein  40.58 
 
 
82 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0913406  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0351  acyl carrier protein  42.03 
 
 
82 aa  52.4  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0984  acyl carrier protein  36.71 
 
 
82 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.156105  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7056  acyl carrier protein  34.21 
 
 
79 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0536  acyl carrier protein  35.8 
 
 
80 aa  52  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.75126  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2102  acyl carrier protein  35.8 
 
 
83 aa  51.6  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.493775  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3512  acyl carrier protein  40.58 
 
 
82 aa  52  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.126809  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4570  acyl carrier protein  40.28 
 
 
82 aa  52  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0324  acyl carrier protein  42.03 
 
 
82 aa  51.6  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00657258 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4369  acyl carrier protein  38.03 
 
 
82 aa  51.6  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4801  acyl carrier protein  36.99 
 
 
83 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2174  putative diguanylate cyclase  37.8 
 
 
81 aa  51.6  0.000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.377661  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1639  phosphopantetheine-binding protein  32.89 
 
 
87 aa  51.2  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0535915  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0126  acyl carrier protein  34.57 
 
 
80 aa  50.8  0.000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.395264  hitchhiker  0.00283985 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1672  acyl carrier protein  35.29 
 
 
77 aa  50.4  0.000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3600  acyl carrier protein  37.5 
 
 
82 aa  50.4  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03900  acyl carrier protein  37.8 
 
 
80 aa  50.8  0.000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.486098  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4075  acyl carrier protein  37.5 
 
 
82 aa  50.4  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1185  acyl carrier protein  33.33 
 
 
80 aa  50.4  0.000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00688444  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0929  acyl carrier protein  37.5 
 
 
83 aa  50.4  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3062  acyl carrier protein  37.5 
 
 
83 aa  50.4  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.73924  normal  0.979198 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20601  acyl carrier protein  33.33 
 
 
80 aa  50.4  0.000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417158  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26061  acyl carrier protein  34.57 
 
 
103 aa  50.4  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0663  acyl carrier protein  39.71 
 
 
77 aa  50.4  0.000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00175647  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09300  acyl carrier protein  34.62 
 
 
81 aa  50.1  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.421361  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4504  acyl carrier protein  36.71 
 
 
81 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0692  acyl carrier protein  37.5 
 
 
85 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0950683  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3365  acyl carrier protein  37.33 
 
 
97 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257859  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3427  acyl carrier protein  37.33 
 
 
97 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120295  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3376  acyl carrier protein  37.33 
 
 
97 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271148  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2564  acyl carrier protein  44.83 
 
 
77 aa  49.7  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0969  acyl carrier protein  35.37 
 
 
84 aa  49.7  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000264763  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3256  acyl carrier protein  36.71 
 
 
82 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.929714  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0170  acyl carrier protein  33.33 
 
 
80 aa  49.3  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.519616  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1701  acyl carrier protein  35.9 
 
 
79 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0112  acyl carrier protein  36.11 
 
 
82 aa  49.3  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0343  acyl carrier protein  39.13 
 
 
82 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.317237  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3755  acyl carrier protein  37.33 
 
 
99 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.345144  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18181  acyl carrier protein  35.9 
 
 
79 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.180905  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18011  acyl carrier protein  35.9 
 
 
79 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2778  acyl carrier protein  36 
 
 
99 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.961024 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0752  acyl carrier protein  42.42 
 
 
79 aa  49.7  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0103187  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2951  phosphopantetheine-binding protein  32 
 
 
80 aa  48.5  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.765509  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1157  acyl carrier protein  35.14 
 
 
78 aa  48.1  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000567099  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2152  phosphopantetheine-binding protein  32.5 
 
 
82 aa  48.5  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00792  acyl carrier protein  34.72 
 
 
81 aa  48.1  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1537  phosphopantetheine-binding  35.44 
 
 
84 aa  48.1  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.157391  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3876  phosphopantetheine-binding  35.71 
 
 
82 aa  48.1  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.508072 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3889  acyl carrier protein  39.13 
 
 
82 aa  48.1  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0452  acyl carrier protein  38.71 
 
 
88 aa  47.8  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2371  acyl carrier protein  28.95 
 
 
84 aa  47.8  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.272715  normal  0.051956 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0876  acyl carrier protein  30.26 
 
 
84 aa  47  0.00008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2725  phosphopantetheine-binding protein  38.1 
 
 
101 aa  47  0.00009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3686  acyl carrier protein  37.5 
 
 
81 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.630716 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4763  acyl carrier protein  37.5 
 
 
81 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.065062  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1745  acyl carrier protein  41.27 
 
 
77 aa  46.2  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000920991  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3380  acyl carrier protein  39.13 
 
 
82 aa  47  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2071  acyl carrier protein  40.91 
 
 
74 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000431599  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3690  phosphopantetheine-binding protein  35.44 
 
 
87 aa  46.2  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12010  acyl carrier protein  30 
 
 
82 aa  45.4  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.114572  normal  0.0939277 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004065  acyl carrier protein  41.67 
 
 
85 aa  46.2  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4067  acyl carrier protein  40 
 
 
82 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4379  acyl-carrier-protein  32.89 
 
 
85 aa  46.2  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00582273  normal  0.0972461 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1382  acyl carrier protein  32.1 
 
 
81 aa  45.8  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0180925  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3460  acyl carrier protein  36.76 
 
 
81 aa  45.4  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000712705 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1527  acyl carrier protein  36.23 
 
 
79 aa  45.8  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2689  acyl carrier protein  34.18 
 
 
82 aa  45.4  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10300  acyl carrier protein  39.68 
 
 
78 aa  45.1  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00141848  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0269  acyl carrier protein  32.88 
 
 
81 aa  45.4  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107759  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12273  acyl carrier protein  38.6 
 
 
115 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.46303  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0267  acyl carrier protein  32.88 
 
 
81 aa  45.4  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0366533  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4413  phosphopantetheine-binding protein  36.23 
 
 
77 aa  44.7  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.864281  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2039  acyl carrier protein  30.86 
 
 
80 aa  44.7  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0051261  hitchhiker  0.00361328 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4505  acyl carrier protein  36.36 
 
 
81 aa  44.7  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265662  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5650  acyl carrier protein  36.51 
 
 
80 aa  44.3  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.611546  normal  0.225397 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1263  acyl carrier protein  31.58 
 
 
82 aa  44.7  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0921694 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4861  phosphopantetheine-binding  32.91 
 
 
85 aa  44.7  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.830038  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0510  acyl carrier protein  33.33 
 
 
77 aa  44.3  0.0006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0643  acyl carrier protein  37.88 
 
 
77 aa  43.9  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000166271  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2874  acyl carrier protein  44.9 
 
 
78 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0334524  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3247  acyl carrier protein  44.9 
 
 
78 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1610  Acyl carrier protein (ACP)  35.29 
 
 
90 aa  43.1  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0685  acyl carrier protein  36.51 
 
 
75 aa  43.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00698969  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>