More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4861 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4861  phosphopantetheine-binding  100 
 
 		 85 aa  160  5.0000000000000005e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.830038  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1325  acyl carrier protein  49.37 
 
 		 79 aa  79.7  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7056  acyl carrier protein  46.05 
 
 		 79 aa  76.3  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2371  acyl carrier protein  42.68 
 
 		 84 aa  74.7  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.272715  normal  0.051956 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0876  acyl carrier protein  43.9 
 
 		 84 aa  74.7  0.0000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10270  acyl carrier protein  51.95 
 
 		 81 aa  74.3  0.0000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.167244 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1975  acyl carrier protein  44 
 
 		 79 aa  73.2  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.166506  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1639  phosphopantetheine-binding protein  47.37 
 
 		 87 aa  72.8  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0535915  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2778  acyl carrier protein  50 
 
 		 99 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.961024 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3755  acyl carrier protein  50 
 
 		 99 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.345144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3376  acyl carrier protein  50 
 
 		 97 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3365  acyl carrier protein  50 
 
 		 97 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257859  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3427  acyl carrier protein  50 
 
 		 97 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2039  acyl carrier protein  48.72 
 
 		 80 aa  71.6  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0051261  hitchhiker  0.00361328 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2725  phosphopantetheine-binding protein  48 
 
 		 101 aa  69.3  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12273  acyl carrier protein  59.32 
 
 		 115 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.46303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3512  acyl carrier protein  44.74 
 
 		 79 aa  68.2  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.410127  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3122  phosphopantetheine-binding protein  50.67 
 
 		 101 aa  68.2  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.884659  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2951  phosphopantetheine-binding protein  40.26 
 
 		 80 aa  66.2  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.765509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14090  acyl carrier protein  46.67 
 
 		 82 aa  65.9  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.025354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3380  acyl carrier protein  46.25 
 
 		 79 aa  65.5  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0442067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1263  acyl carrier protein  42.68 
 
 		 82 aa  64.7  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0921694 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09300  acyl carrier protein  45.95 
 
 		 81 aa  64.3  0.0000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.421361  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12010  acyl carrier protein  52.38 
 
 		 82 aa  63.9  0.0000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.114572  normal  0.0939277 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3622  acyl carrier protein  45 
 
 		 79 aa  62.4  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000545579 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2152  phosphopantetheine-binding protein  44 
 
 		 82 aa  61.6  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16760  acyl carrier protein  45.95 
 
 		 82 aa  62  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00765703  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1849  acyl carrier protein  40.54 
 
 		 77 aa  61.2  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000445968  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3483  acyl carrier protein  40.24 
 
 		 82 aa  60.8  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.520778  normal  0.883416 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0522  acyl carrier protein  42.11 
 
 		 78 aa  59.7  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000162549  hitchhiker  0.00260243 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0517  acyl carrier protein  42.11 
 
 		 78 aa  59.7  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000044528  decreased coverage  0.00212296 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2137  phosphopantetheine-binding protein  44.74 
 
 		 82 aa  59.7  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1517  phosphopantetheine-binding  47.3 
 
 		 82 aa  59.7  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.259778  normal  0.0737426 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1805  acyl carrier protein  42.67 
 
 		 82 aa  58.5  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.200029  normal  0.0299727 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1988  phosphopantetheine-binding  41.89 
 
 		 81 aa  57.8  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44915  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3345  acyl carrier protein  42.67 
 
 		 81 aa  57.4  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0503244  normal  0.362492 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0452  acyl carrier protein  41.03 
 
 		 88 aa  57  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4067  acyl carrier protein  35.53 
 
 		 82 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1185  acyl carrier protein  38.46 
 
 		 80 aa  55.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00688444  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20601  acyl carrier protein  38.46 
 
 		 80 aa  55.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0536  acyl carrier protein  37.97 
 
 		 80 aa  55.8  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.75126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1382  acyl carrier protein  40 
 
 		 81 aa  55.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0180925  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1915  acyl carrier protein  45.07 
 
 		 78 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00426402  unclonable  0.000000216154 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1526  acyl carrier protein  43.06 
 
 		 78 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.262214 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0170  acyl carrier protein  38.46 
 
 		 80 aa  55.1  0.0000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.519616  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1491  acyl carrier protein  43.06 
 
 		 78 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2397  acyl carrier protein  33.33 
 
 		 84 aa  55.1  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.774036  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0126  acyl carrier protein  38.46 
 
 		 80 aa  54.7  0.0000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.395264  hitchhiker  0.00283985 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3799  acyl carrier protein  45.07 
 
 		 78 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.181664  normal  0.777832 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1641  acyl carrier protein  36.62 
 
 		 82 aa  54.7  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1416  acyl carrier protein  41.1 
 
 		 76 aa  54.3  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.28944  normal  0.571191 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6811  phosphopantetheine-binding  37.18 
 
 		 82 aa  54.3  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26061  acyl carrier protein  38.67 
 
 		 103 aa  53.9  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1672  acyl carrier protein  36.49 
 
 		 77 aa  53.1  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0401  acyl carrier protein  35.53 
 
 		 79 aa  53.5  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00338401  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0639  acyl carrier protein  39.47 
 
 		 79 aa  53.1  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.299203 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4810  acyl carrier protein  36.49 
 
 		 82 aa  52  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0303207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0408  acyl carrier protein  34.21 
 
 		 79 aa  52.8  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.442287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1973  acyl carrier protein  39.19 
 
 		 77 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3247  acyl carrier protein  41.43 
 
 		 78 aa  52  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17961  acyl carrier protein  34.62 
 
 		 80 aa  52  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0258441  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3071  acyl carrier protein  37.33 
 
 		 79 aa  52.4  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3646  acyl carrier protein  37.33 
 
 		 79 aa  52.4  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2565  acyl carrier protein  38.96 
 
 		 78 aa  52.8  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2874  acyl carrier protein  41.43 
 
 		 78 aa  52  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0334524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0310  acyl carrier protein  37.5 
 
 		 76 aa  52.8  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00336649  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0773  acyl carrier protein  30.38 
 
 		 85 aa  52.4  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.250826  hitchhiker  0.0000000000344115 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2468  acyl carrier protein  41.56 
 
 		 81 aa  52.8  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000407512  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10300  acyl carrier protein  39.74 
 
 		 78 aa  52  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00141848  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1799  acyl carrier protein  37.33 
 
 		 79 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.714333  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1096  acyl carrier protein  34.62 
 
 		 83 aa  51.6  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000417281  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31440  acyl carrier protein  34.21 
 
 		 127 aa  52  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.820176  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1004  acyl carrier protein  37.33 
 
 		 79 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.486697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2909  acyl carrier protein  37.33 
 
 		 79 aa  52  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0533  acyl carrier protein  37.33 
 
 		 79 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2476  acyl carrier protein  37.33 
 
 		 79 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2262  acyl carrier protein  36 
 
 		 79 aa  51.6  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.033873  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3647  acyl carrier protein  34.52 
 
 		 84 aa  52  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0742845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2904  acyl carrier protein  37.33 
 
 		 79 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2180  acyl carrier protein  37.33 
 
 		 79 aa  52  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.253205  normal  0.154334 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2805  acyl carrier protein  37.33 
 
 		 79 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4236  acyl carrier protein  37.33 
 
 		 79 aa  52  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.223636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1720  acyl carrier protein  37.33 
 
 		 79 aa  52  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2789  acyl carrier protein  37.33 
 
 		 79 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2850  acyl carrier protein  37.33 
 
 		 79 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.814249  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1075  acyl carrier protein  37.33 
 
 		 79 aa  52  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.777412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2427  acyl carrier protein  36 
 
 		 79 aa  51.6  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.954024  normal  0.837243 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1082  acyl carrier protein  37.33 
 
 		 79 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0644  acyl carrier protein  37.33 
 
 		 79 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0831  acyl carrier protein  37.33 
 
 		 79 aa  52  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1000  acyl carrier protein  37.33 
 
 		 79 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1124  acyl carrier protein  37.33 
 
 		 79 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0660  acyl carrier protein  34.18 
 
 		 81 aa  51.6  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.179037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0608  acyl carrier protein  40.85 
 
 		 79 aa  51.2  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000394559 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4505  acyl carrier protein  39.19 
 
 		 81 aa  51.2  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265662  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2121  acyl carrier protein  38.16 
 
 		 79 aa  51.6  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000862864  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2325  acyl carrier protein  37.84 
 
 		 79 aa  51.6  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.596605  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2207  acyl carrier protein  41.56 
 
 		 81 aa  51.2  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000161202 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0984  acyl carrier protein  34.62 
 
 		 82 aa  51.2  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.156105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0166  acyl carrier protein  39.39 
 
 		 78 aa  51.2  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.317698  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>