More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1517 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_1517  phosphopantetheine-binding  100 
 
 
82 aa  159  1e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.259778  normal  0.0737426 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14090  acyl carrier protein  75.31 
 
 
82 aa  124  5e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.025354  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2137  phosphopantetheine-binding protein  72.84 
 
 
82 aa  116  9.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2152  phosphopantetheine-binding protein  68.29 
 
 
82 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1805  acyl carrier protein  69.14 
 
 
82 aa  112  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.200029  normal  0.0299727 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16760  acyl carrier protein  68.29 
 
 
82 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00765703  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3345  acyl carrier protein  67.09 
 
 
81 aa  107  6e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0503244  normal  0.362492 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2468  acyl carrier protein  64.2 
 
 
81 aa  100  6e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000407512  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2207  acyl carrier protein  64.2 
 
 
81 aa  99.8  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000161202 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09300  acyl carrier protein  62.82 
 
 
81 aa  95.1  3e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.421361  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2371  acyl carrier protein  58.44 
 
 
84 aa  89.4  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.272715  normal  0.051956 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1975  acyl carrier protein  57.14 
 
 
79 aa  87.8  4e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.166506  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12010  acyl carrier protein  55.56 
 
 
82 aa  87.8  5e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.114572  normal  0.0939277 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3122  phosphopantetheine-binding protein  57.14 
 
 
101 aa  86.3  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.884659  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1639  phosphopantetheine-binding protein  51.85 
 
 
87 aa  86.3  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0535915  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0876  acyl carrier protein  52.5 
 
 
84 aa  85.9  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10270  acyl carrier protein  58.9 
 
 
81 aa  85.1  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.167244 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3376  acyl carrier protein  55.84 
 
 
97 aa  84.3  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271148  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3365  acyl carrier protein  55.84 
 
 
97 aa  84.3  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257859  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3427  acyl carrier protein  55.84 
 
 
97 aa  84.3  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120295  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7056  acyl carrier protein  53.25 
 
 
79 aa  84  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2778  acyl carrier protein  54.55 
 
 
99 aa  83.6  9e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.961024 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3755  acyl carrier protein  55.84 
 
 
99 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.345144  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2951  phosphopantetheine-binding protein  54.67 
 
 
80 aa  82  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.765509  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2039  acyl carrier protein  56.76 
 
 
80 aa  82.4  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0051261  hitchhiker  0.00361328 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4810  acyl carrier protein  50.62 
 
 
82 aa  82.8  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0303207  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6811  phosphopantetheine-binding  52.44 
 
 
82 aa  82  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1325  acyl carrier protein  55.26 
 
 
79 aa  81.6  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1263  acyl carrier protein  54.55 
 
 
82 aa  80.5  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0921694 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3483  acyl carrier protein  53.25 
 
 
82 aa  78.2  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.520778  normal  0.883416 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1988  phosphopantetheine-binding  52.44 
 
 
81 aa  77.4  0.00000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44915  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2725  phosphopantetheine-binding protein  49.35 
 
 
101 aa  76.3  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3512  acyl carrier protein  52.78 
 
 
79 aa  73.9  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.410127  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3622  acyl carrier protein  50 
 
 
79 aa  72  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000545579 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3380  acyl carrier protein  50 
 
 
79 aa  71.2  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0442067  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12273  acyl carrier protein  56.9 
 
 
115 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.46303  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1664  Acyl carrier protein (ACP)  44.74 
 
 
78 aa  64.7  0.0000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0513886  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1096  acyl carrier protein  38.96 
 
 
83 aa  63.9  0.0000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000417281  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1672  acyl carrier protein  43.66 
 
 
77 aa  63.2  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1526  acyl carrier protein  47.89 
 
 
78 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.262214 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1722  acyl carrier protein  42.86 
 
 
75 aa  63.5  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0088  acyl carrier protein  47.89 
 
 
78 aa  63.2  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1973  acyl carrier protein  47.95 
 
 
77 aa  62  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1915  acyl carrier protein  46.48 
 
 
78 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00426402  unclonable  0.000000216154 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0933  acyl carrier protein  45.45 
 
 
74 aa  62  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000201436  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2565  acyl carrier protein  47.76 
 
 
78 aa  62  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3799  acyl carrier protein  46.48 
 
 
78 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.181664  normal  0.777832 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4504  acyl carrier protein  41.89 
 
 
81 aa  61.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26061  acyl carrier protein  41.98 
 
 
103 aa  60.8  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1082  acyl carrier protein  46.58 
 
 
78 aa  60.8  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.325179  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0643  acyl carrier protein  46.38 
 
 
77 aa  60.5  0.000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000166271  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4861  phosphopantetheine-binding  47.3 
 
 
85 aa  59.7  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.830038  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2195  acyl carrier protein  45.71 
 
 
78 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0536  acyl carrier protein  42.11 
 
 
80 aa  59.7  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.75126  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1181  acyl carrier protein  44.29 
 
 
76 aa  60.1  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185913  decreased coverage  0.00116588 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1339  acyl carrier protein  45.07 
 
 
78 aa  59.7  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.52176  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0280  acyl carrier protein  45.07 
 
 
78 aa  60.1  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.344257 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1641  acyl carrier protein  39.74 
 
 
82 aa  60.1  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1216  acyl carrier protein  44.74 
 
 
78 aa  59.7  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.729885  normal  0.686684 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25670  acyl carrier protein  45.71 
 
 
78 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000226432  normal  0.748876 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0510  acyl carrier protein  39.39 
 
 
77 aa  59.7  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10300  acyl carrier protein  46.38 
 
 
78 aa  59.3  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00141848  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3071  acyl carrier protein  45.71 
 
 
79 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0126  acyl carrier protein  42.31 
 
 
80 aa  58.9  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.395264  hitchhiker  0.00283985 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1491  acyl carrier protein  45.07 
 
 
78 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114932  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0949  acyl carrier protein  47.89 
 
 
79 aa  59.3  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000253013  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1232  acyl carrier protein  48.48 
 
 
79 aa  59.3  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152652  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1382  acyl carrier protein  39.47 
 
 
81 aa  58.9  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0180925  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1392  acyl carrier protein  44 
 
 
79 aa  58.9  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1745  acyl carrier protein  43.66 
 
 
77 aa  58.9  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000920991  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1090  acyl carrier protein  41.77 
 
 
77 aa  59.3  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.343466  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0959  acyl carrier protein  41.43 
 
 
80 aa  59.3  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2519  acyl carrier protein  43.42 
 
 
79 aa  58.5  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0608  acyl carrier protein  45.71 
 
 
79 aa  58.2  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000394559 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1420  acyl carrier protein  46.97 
 
 
79 aa  58.2  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.704183 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1701  acyl carrier protein  38.96 
 
 
79 aa  58.2  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1733  acyl carrier protein  44.29 
 
 
79 aa  58.2  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.9219  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3646  acyl carrier protein  44.29 
 
 
79 aa  58.2  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18011  acyl carrier protein  38.96 
 
 
79 aa  57.8  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2689  acyl carrier protein  38.96 
 
 
82 aa  57.8  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18181  acyl carrier protein  38.96 
 
 
79 aa  57.8  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.180905  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1186  acyl carrier protein  44.29 
 
 
79 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.026536 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1935  acyl carrier protein  43.66 
 
 
77 aa  57.8  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000441044  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2630  acyl carrier protein  44.29 
 
 
79 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3277  acyl carrier protein  44.29 
 
 
79 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.796037  normal  0.660207 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5269  acyl carrier protein  44.29 
 
 
79 aa  57.8  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0639  acyl carrier protein  45.21 
 
 
79 aa  57.4  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.299203 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1630  acyl carrier protein  49.21 
 
 
78 aa  57.4  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000123369  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17961  acyl carrier protein  36.71 
 
 
80 aa  57.4  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0258441  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2736  acyl carrier protein  41.03 
 
 
80 aa  57.4  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.875192  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2121  acyl carrier protein  42.25 
 
 
79 aa  57.4  0.00000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000862864  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0798  acyl carrier protein  44.29 
 
 
77 aa  57  0.00000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1075  acyl carrier protein  41.89 
 
 
78 aa  57  0.00000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.690942  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2839  acyl carrier protein  43.08 
 
 
79 aa  57  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2747  acyl carrier protein  43.08 
 
 
79 aa  57  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2931  acyl carrier protein  43.08 
 
 
79 aa  57  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1185  acyl carrier protein  39.74 
 
 
80 aa  56.6  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00688444  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17331  acyl carrier protein (ACP)  43.24 
 
 
80 aa  56.6  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3249  acyl carrier protein  44.29 
 
 
79 aa  56.6  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.124771  normal  0.0273605 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0066  acyl carrier protein  42.65 
 
 
76 aa  56.2  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>