More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0538 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_0538  acyl carrier protein  100 
 
 		 82 aa  161  3e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.633941  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0451  Acyl carrier protein  53.75 
 
 		 84 aa  96.3  1e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0773  acyl carrier protein  60 
 
 		 85 aa  96.7  1e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.250826  hitchhiker  0.0000000000344115 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1160  acyl carrier protein  55.84 
 
 		 84 aa  83.6  8e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000195346  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1382  acyl carrier protein  41.25 
 
 		 81 aa  75.1  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0180925  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1157  acyl carrier protein  44.59 
 
 		 78 aa  70.1  0.000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000567099  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1641  acyl carrier protein  41.03 
 
 		 82 aa  70.1  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2493  acyl carrier protein  43.42 
 
 		 78 aa  67.8  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0166  acyl carrier protein  42.31 
 
 		 78 aa  67  0.00000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.317698  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1185  acyl carrier protein  41.25 
 
 		 80 aa  66.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00688444  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2195  acyl carrier protein  44.78 
 
 		 78 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20601  acyl carrier protein  41.25 
 
 		 80 aa  66.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25670  acyl carrier protein  44.78 
 
 		 78 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000226432  normal  0.748876 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1345  acyl carrier protein  49.25 
 
 		 79 aa  65.5  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.095592  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2931  acyl carrier protein  46.27 
 
 		 79 aa  65.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3247  acyl carrier protein  43.28 
 
 		 78 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2874  acyl carrier protein  43.28 
 
 		 78 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0334524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0130  acyl carrier protein  42.31 
 
 		 78 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0263096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1661  acyl carrier protein  48.53 
 
 		 79 aa  65.5  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2747  acyl carrier protein  46.27 
 
 		 79 aa  65.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1602  acyl carrier protein  46.97 
 
 		 77 aa  65.9  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00127335  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2839  acyl carrier protein  46.27 
 
 		 79 aa  65.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3646  acyl carrier protein  44.78 
 
 		 79 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0436  acyl carrier protein  40 
 
 		 76 aa  65.1  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.20002  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1232  acyl carrier protein  44.62 
 
 		 79 aa  64.7  0.0000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152652  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0605  acyl carrier protein  46.15 
 
 		 84 aa  64.3  0.0000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  9.329130000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1082  acyl carrier protein  49.23 
 
 		 78 aa  64.3  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.325179  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3249  acyl carrier protein  44.78 
 
 		 79 aa  64.3  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.124771  normal  0.0273605 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0179  acyl carrier protein  40.26 
 
 		 78 aa  64.3  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00024894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4504  acyl carrier protein  41.33 
 
 		 81 aa  64.3  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1526  acyl carrier protein  43.28 
 
 		 78 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.262214 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1096  acyl carrier protein  37.33 
 
 		 83 aa  64.3  0.0000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000417281  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3071  acyl carrier protein  43.28 
 
 		 79 aa  63.9  0.0000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1580  acyl carrier protein  46.15 
 
 		 84 aa  63.9  0.0000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000805484  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01090  acyl carrier protein  43.94 
 
 		 78 aa  63.5  0.0000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000166866  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2553  acyl carrier protein  43.94 
 
 		 78 aa  63.5  0.0000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000526358  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1216  acyl carrier protein  43.94 
 
 		 78 aa  63.5  0.0000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  3.59624e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1310  acyl carrier protein  43.94 
 
 		 78 aa  63.5  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000174722  decreased coverage  4.37915e-18 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2033  acyl carrier protein  43.94 
 
 		 78 aa  63.5  0.0000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000123338  hitchhiker  0.00000256014 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2230  acyl carrier protein  43.94 
 
 		 78 aa  63.5  0.0000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.78439e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2630  acyl carrier protein  44.78 
 
 		 79 aa  63.5  0.0000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1295  acyl carrier protein  43.94 
 
 		 78 aa  63.5  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000656136  decreased coverage  3.5580799999999995e-20 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1266  acyl carrier protein  43.94 
 
 		 78 aa  63.5  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000000383773  normal  0.0632427 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1473  acyl carrier protein  43.94 
 
 		 78 aa  63.5  0.0000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000000839248  hitchhiker  0.00000000000000262365 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1215  acyl carrier protein  43.94 
 
 		 78 aa  63.5  0.0000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000103813  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01098  hypothetical protein  43.94 
 
 		 78 aa  63.5  0.0000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000144532  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1990  acyl carrier protein  43.94 
 
 		 78 aa  63.5  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000000274294  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2173  acyl carrier protein  43.94 
 
 		 78 aa  63.5  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000401427  hitchhiker  0.000000000000202194 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3277  acyl carrier protein  44.78 
 
 		 79 aa  63.5  0.0000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.796037  normal  0.660207 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2507  acyl carrier protein  43.94 
 
 		 78 aa  63.5  0.0000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996587  hitchhiker  0.000000169384 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5269  acyl carrier protein  44.78 
 
 		 79 aa  63.5  0.0000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1186  acyl carrier protein  44.78 
 
 		 79 aa  63.5  0.0000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.026536 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1392  acyl carrier protein  44.78 
 
 		 79 aa  63.5  0.0000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3914  acyl carrier protein  43.24 
 
 		 78 aa  63.5  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1604  acyl carrier protein  46.15 
 
 		 77 aa  63.5  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.0000908014  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1915  acyl carrier protein  42.42 
 
 		 78 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00426402  unclonable  0.000000216154 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2083  acyl carrier protein  44.62 
 
 		 76 aa  63.2  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000417197  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1548  Acyl carrier protein (ACP)  43.28 
 
 		 77 aa  63.2  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.079585  normal  0.066745 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1439  acyl carrier protein  50 
 
 		 77 aa  63.2  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1602  acyl carrier protein  44.62 
 
 		 77 aa  62.8  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000714682  normal  0.960802 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10300  acyl carrier protein  47.69 
 
 		 78 aa  62.8  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00141848  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0984  acyl carrier protein  43.55 
 
 		 82 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.156105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0168  acyl carrier protein  42.42 
 
 		 76 aa  63.5  0.000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000122767  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1420  acyl carrier protein  43.08 
 
 		 79 aa  62.8  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.704183 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1648  acyl carrier protein  40.91 
 
 		 80 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00355954  normal  0.46932 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1733  acyl carrier protein  43.28 
 
 		 79 aa  62.8  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.9219  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3256  acyl carrier protein  43.55 
 
 		 82 aa  62.8  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.929714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0663  acyl carrier protein  40 
 
 		 77 aa  62.4  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00175647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1672  acyl carrier protein  43.28 
 
 		 77 aa  62.8  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1629  acyl carrier protein  41.54 
 
 		 78 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3799  acyl carrier protein  42.42 
 
 		 78 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.181664  normal  0.777832 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0196  acyl carrier protein  41.56 
 
 		 79 aa  62.8  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2000  acyl carrier protein  47.69 
 
 		 76 aa  62  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1491  acyl carrier protein  42.42 
 
 		 78 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4156  acyl carrier protein  40.91 
 
 		 78 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.035668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5387  acyl carrier protein  42.86 
 
 		 78 aa  62  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0170  acyl carrier protein  39.24 
 
 		 80 aa  62  0.000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.519616  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4505  acyl carrier protein  43.28 
 
 		 81 aa  62  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265662  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1878  acyl carrier protein  43.08 
 
 		 77 aa  61.6  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0843624  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14930  acyl carrier protein  43.08 
 
 		 78 aa  61.2  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2564  acyl carrier protein  38.16 
 
 		 77 aa  61.6  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0126  acyl carrier protein  39.24 
 
 		 80 aa  61.2  0.000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.395264  hitchhiker  0.00283985 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0536  acyl carrier protein  38.46 
 
 		 80 aa  61.2  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.75126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1416  acyl carrier protein  36.62 
 
 		 76 aa  61.2  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.28944  normal  0.571191 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1834  acyl carrier protein  43.08 
 
 		 79 aa  61.2  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0103322  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02710  acyl carrier protein  40 
 
 		 79 aa  60.8  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.312215  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1609  acyl carrier protein  42.42 
 
 		 78 aa  61.2  0.000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000323844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1745  acyl carrier protein  40 
 
 		 77 aa  60.8  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000920991  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1979  acyl carrier protein  40.91 
 
 		 77 aa  60.8  0.000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000485272  decreased coverage  0.000456446 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3460  acyl carrier protein  39.24 
 
 		 81 aa  60.5  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000712705 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1909  acyl carrier protein  41.54 
 
 		 82 aa  60.5  0.000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.045523  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1584  acyl carrier protein  41.54 
 
 		 82 aa  60.5  0.000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34262  normal  0.0373148 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1157  acyl carrier protein  43.08 
 
 		 77 aa  60.5  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.917954 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3105  acyl carrier protein  43.08 
 
 		 77 aa  60.5  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000128081  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1258  acyl carrier protein  44.62 
 
 		 79 aa  60.5  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2775  acyl carrier protein  40.91 
 
 		 77 aa  60.1  0.000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1720  acyl carrier protein  40.91 
 
 		 77 aa  60.1  0.000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138911  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1583  acyl carrier protein  40.91 
 
 		 77 aa  60.1  0.000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000266609  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0639  acyl carrier protein  41.79 
 
 		 79 aa  60.5  0.000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.299203 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0510  acyl carrier protein  43.08 
 
 		 77 aa  60.1  0.000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>