62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3572 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_3572  hypothetical protein  100 
 
 		 89 aa  172  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.141055 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4648  hypothetical protein  100 
 
 		 89 aa  172  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7032  hypothetical protein  67.09 
 
 		 83 aa  110  9e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.343078  normal  0.583052 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0931  hypothetical protein  64.2 
 
 		 82 aa  103  7e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1416  hypothetical protein  62.03 
 
 		 84 aa  103  9e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.285013  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0384  phosphopantetheine-binding  66.67 
 
 		 83 aa  102  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2709  phosphopantetheine-binding  47.56 
 
 		 88 aa  89.4  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.169236  hitchhiker  0.0000263676 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0765  phosphopantetheine-binding  64.71 
 
 		 87 aa  88.6  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.321905  normal  0.579086 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1411  phosphopantetheine-binding protein  53.66 
 
 		 84 aa  87.4  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1122  phosphopantetheine-binding protein  50.62 
 
 		 86 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1094  phosphopantetheine-binding protein  50.62 
 
 		 86 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1111  phosphopantetheine-binding protein  50.62 
 
 		 86 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3604  phosphopantetheine-binding protein  42.11 
 
 		 80 aa  72.4  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2594  phosphopantetheine-binding  46.75 
 
 		 81 aa  68.6  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.79488  hitchhiker  0.000628646 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1612  hypothetical protein  40.26 
 
 		 81 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00005517  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4983  acetyl-CoA synthetase  63.83 
 
 		 280 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.793805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3287  phosphopantetheine-binding  37.66 
 
 		 87 aa  60.5  0.000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.31338 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0507  phosphopantetheine-binding  37.66 
 
 		 80 aa  58.9  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2178  phosphopantetheine-binding protein  37.18 
 
 		 81 aa  58.2  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.510535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0253  phosphopantetheine-binding  40 
 
 		 86 aa  47  0.00009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1036  phosphopantetheine-binding  30.68 
 
 		 98 aa  47  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.121028  normal  0.393092 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2039  acyl carrier protein  31.58 
 
 		 80 aa  45.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0051261  hitchhiker  0.00361328 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1160  acyl carrier protein  35.59 
 
 		 84 aa  45.4  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000195346  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3483  acyl carrier protein  30 
 
 		 82 aa  45.4  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.520778  normal  0.883416 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1263  acyl carrier protein  31.33 
 
 		 82 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0921694 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0468  acyl carrier protein  30.56 
 
 		 77 aa  44.7  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0170  acyl carrier protein  27.14 
 
 		 80 aa  44.7  0.0004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.519616  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0876  acyl carrier protein  28.95 
 
 		 84 aa  44.7  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1185  acyl carrier protein  26.39 
 
 		 80 aa  44.3  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00688444  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20601  acyl carrier protein  26.39 
 
 		 80 aa  44.3  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3469  hypothetical protein  37.84 
 
 		 92 aa  44.3  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.414098  normal  0.140007 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0493  acyl carrier protein  29.17 
 
 		 77 aa  44.3  0.0006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1496  acyl carrier protein  31.82 
 
 		 77 aa  43.9  0.0007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0230  acyl carrier protein  29.11 
 
 		 79 aa  43.9  0.0008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0126  acyl carrier protein  25.71 
 
 		 80 aa  43.1  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.395264  hitchhiker  0.00283985 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2778  acyl carrier protein  27.78 
 
 		 99 aa  42.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.961024 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12273  acyl carrier protein  29.85 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.46303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3419  acyl carrier protein  32.93 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.355665  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2725  phosphopantetheine-binding protein  27.78 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1639  phosphopantetheine-binding protein  29.11 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0535915  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2689  acyl carrier protein  23.68 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2951  phosphopantetheine-binding protein  29.17 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.765509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26061  acyl carrier protein  25.71 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_42161  predicted protein  26.19 
 
 		 114 aa  42  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0806882  normal  0.994618 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3755  acyl carrier protein  27.78 
 
 		 99 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.345144  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2371  acyl carrier protein  31.43 
 
 		 84 aa  42  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.272715  normal  0.051956 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6811  phosphopantetheine-binding  30.65 
 
 		 82 aa  41.6  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2397  acyl carrier protein  31.08 
 
 		 84 aa  42  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.774036  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0451  Acyl carrier protein  33.33 
 
 		 84 aa  42  0.003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3512  acyl carrier protein  26.09 
 
 		 79 aa  41.6  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.410127  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0561  acyl carrier protein  40 
 
 		 77 aa  41.6  0.004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3376  acyl carrier protein  27.78 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3427  acyl carrier protein  27.78 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1325  acyl carrier protein  28.95 
 
 		 79 aa  41.2  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3365  acyl carrier protein  27.78 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257859  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1362  acyl carrier protein  39.47 
 
 		 77 aa  41.2  0.005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.915786  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0507  acyl carrier protein  26.32 
 
 		 77 aa  40.8  0.006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0583644  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04410  acyl carrier protein (acp), putative  23.75 
 
 		 127 aa  40.8  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0285  acyl carrier protein  44.74 
 
 		 77 aa  40.8  0.006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1975  acyl carrier protein  30.56 
 
 		 79 aa  40.4  0.009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.166506  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0616  acyl carrier protein  30.19 
 
 		 74 aa  40  0.009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000175358  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1988  phosphopantetheine-binding  29.51 
 
 		 81 aa  40  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44915  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>