28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3604 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_3604  phosphopantetheine-binding protein  100 
 
 		 80 aa  157  4e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1411  phosphopantetheine-binding protein  43.04 
 
 		 84 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3572  hypothetical protein  42.11 
 
 		 89 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.141055 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2178  phosphopantetheine-binding protein  46.05 
 
 		 81 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.510535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4648  hypothetical protein  42.11 
 
 		 89 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7032  hypothetical protein  39.47 
 
 		 83 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.343078  normal  0.583052 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1122  phosphopantetheine-binding protein  40 
 
 		 86 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1094  phosphopantetheine-binding protein  40 
 
 		 86 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1416  hypothetical protein  35.9 
 
 		 84 aa  68.9  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.285013  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1111  phosphopantetheine-binding protein  40 
 
 		 86 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1612  hypothetical protein  39.47 
 
 		 81 aa  67  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00005517  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2709  phosphopantetheine-binding  36.84 
 
 		 88 aa  63.9  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.169236  hitchhiker  0.0000263676 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2594  phosphopantetheine-binding  39.47 
 
 		 81 aa  63.9  0.0000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.79488  hitchhiker  0.000628646 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0507  phosphopantetheine-binding  35 
 
 		 80 aa  61.6  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0931  hypothetical protein  37.18 
 
 		 82 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0384  phosphopantetheine-binding  36.62 
 
 		 83 aa  60.8  0.000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0765  phosphopantetheine-binding  36.11 
 
 		 87 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.321905  normal  0.579086 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3287  phosphopantetheine-binding  36.84 
 
 		 87 aa  59.3  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.31338 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4983  acetyl-CoA synthetase  44.44 
 
 		 280 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.793805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3469  hypothetical protein  28.75 
 
 		 92 aa  50.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.414098  normal  0.140007 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1036  phosphopantetheine-binding  32.31 
 
 		 98 aa  46.2  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.121028  normal  0.393092 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1181  acyl carrier protein  32.89 
 
 		 76 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185913  decreased coverage  0.00116588 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1836  acyl carrier protein  34.21 
 
 		 76 aa  44.7  0.0005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000000576824  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1610  Acyl carrier protein (ACP)  34.25 
 
 		 90 aa  43.5  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0451  Acyl carrier protein  31.25 
 
 		 84 aa  42  0.003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0550  hypothetical protein  28.92 
 
 		 82 aa  41.2  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.324262  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0493  acyl carrier protein  32 
 
 		 77 aa  40.8  0.006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0468  acyl carrier protein  30.67 
 
 		 77 aa  40  0.009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>