44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1612 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_1612  hypothetical protein  100 
 
 
81 aa  161  4.0000000000000004e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00005517  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0384  phosphopantetheine-binding  37.97 
 
 
83 aa  72  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4648  hypothetical protein  40.79 
 
 
89 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0765  phosphopantetheine-binding  42.67 
 
 
87 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.321905  normal  0.579086 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3572  hypothetical protein  40.79 
 
 
89 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.141055 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1416  hypothetical protein  42.11 
 
 
84 aa  67.8  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.285013  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3604  phosphopantetheine-binding protein  39.47 
 
 
80 aa  67  0.00000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2594  phosphopantetheine-binding  37.5 
 
 
81 aa  64.3  0.0000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.79488  hitchhiker  0.000628646 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0507  phosphopantetheine-binding  37.97 
 
 
80 aa  62.8  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2178  phosphopantetheine-binding protein  36.25 
 
 
81 aa  61.2  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.510535  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7032  hypothetical protein  35.53 
 
 
83 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.343078  normal  0.583052 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1036  phosphopantetheine-binding  37.84 
 
 
98 aa  59.7  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.121028  normal  0.393092 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2709  phosphopantetheine-binding  32.89 
 
 
88 aa  58.9  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.169236  hitchhiker  0.0000263676 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1094  phosphopantetheine-binding protein  33.77 
 
 
86 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1111  phosphopantetheine-binding protein  33.77 
 
 
86 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1411  phosphopantetheine-binding protein  35.14 
 
 
84 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1122  phosphopantetheine-binding protein  33.77 
 
 
86 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0931  hypothetical protein  33.77 
 
 
82 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3287  phosphopantetheine-binding  29.11 
 
 
87 aa  53.1  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.31338 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0253  phosphopantetheine-binding  35.14 
 
 
86 aa  48.9  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0984  acyl carrier protein  32.91 
 
 
82 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.156105  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3256  acyl carrier protein  32.91 
 
 
82 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.929714  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4983  acetyl-CoA synthetase  39.66 
 
 
280 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.793805  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0510  acyl carrier protein  33.75 
 
 
77 aa  45.8  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0550  hypothetical protein  31.15 
 
 
82 aa  43.5  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.324262  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0284  acyl carrier protein  33.78 
 
 
82 aa  42.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6611  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1856  phosphopantetheine-binding protein  25.81 
 
 
85 aa  42.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3512  acyl carrier protein  31.34 
 
 
79 aa  42.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.410127  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0170  acyl carrier protein  28.77 
 
 
80 aa  42.4  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.519616  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3460  acyl carrier protein  35.71 
 
 
81 aa  42.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000712705 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1382  acyl carrier protein  32.73 
 
 
81 aa  42  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0180925  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1722  acyl carrier protein  30.56 
 
 
75 aa  41.6  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1160  acyl carrier protein  31.03 
 
 
84 aa  41.6  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000195346  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3483  acyl carrier protein  29.41 
 
 
82 aa  41.6  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.520778  normal  0.883416 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2212  acyl carrier protein  32 
 
 
94 aa  41.2  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.266286  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1096  acyl carrier protein  30.67 
 
 
83 aa  41.6  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000417281  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12010  acyl carrier protein  32.73 
 
 
82 aa  41.2  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.114572  normal  0.0939277 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3469  hypothetical protein  27.85 
 
 
92 aa  41.2  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.414098  normal  0.140007 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0126  acyl carrier protein  28.77 
 
 
80 aa  41.2  0.006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.395264  hitchhiker  0.00283985 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1263  acyl carrier protein  30.91 
 
 
82 aa  40.8  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0921694 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1641  acyl carrier protein  31.51 
 
 
82 aa  40.4  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0452  acyl carrier protein  27.27 
 
 
88 aa  40.4  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0561  acyl carrier protein  30 
 
 
77 aa  40.4  0.009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1362  acyl carrier protein  31.94 
 
 
77 aa  40.4  0.009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.915786  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>