49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0765 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_0765  phosphopantetheine-binding  100 
 
 
87 aa  176  9e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.321905  normal  0.579086 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0384  phosphopantetheine-binding  67.07 
 
 
83 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3572  hypothetical protein  64.71 
 
 
89 aa  88.6  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.141055 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4648  hypothetical protein  64.71 
 
 
89 aa  88.6  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7032  hypothetical protein  58.44 
 
 
83 aa  87  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.343078  normal  0.583052 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2709  phosphopantetheine-binding  45.12 
 
 
88 aa  82  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.169236  hitchhiker  0.0000263676 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1416  hypothetical protein  54.67 
 
 
84 aa  81.6  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.285013  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1094  phosphopantetheine-binding protein  52.86 
 
 
86 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1122  phosphopantetheine-binding protein  52.86 
 
 
86 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1111  phosphopantetheine-binding protein  52.86 
 
 
86 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0931  hypothetical protein  61.19 
 
 
82 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1411  phosphopantetheine-binding protein  56.72 
 
 
84 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2594  phosphopantetheine-binding  51.32 
 
 
81 aa  72.8  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.79488  hitchhiker  0.000628646 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1612  hypothetical protein  42.67 
 
 
81 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00005517  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3287  phosphopantetheine-binding  40 
 
 
87 aa  67.4  0.00000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.31338 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4983  acetyl-CoA synthetase  57.14 
 
 
280 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.793805  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3604  phosphopantetheine-binding protein  36.11 
 
 
80 aa  60.1  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1036  phosphopantetheine-binding  36.92 
 
 
98 aa  51.6  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.121028  normal  0.393092 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2178  phosphopantetheine-binding protein  36.62 
 
 
81 aa  50.8  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.510535  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0507  phosphopantetheine-binding  34.85 
 
 
80 aa  47.8  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3469  hypothetical protein  38.89 
 
 
92 aa  47  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.414098  normal  0.140007 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1856  phosphopantetheine-binding protein  31.03 
 
 
85 aa  45.1  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0253  phosphopantetheine-binding  34.67 
 
 
86 aa  43.9  0.0007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2397  acyl carrier protein  33.87 
 
 
84 aa  43.9  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.774036  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1160  acyl carrier protein  36.84 
 
 
84 aa  43.9  0.0008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000195346  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0550  hypothetical protein  34.62 
 
 
82 aa  43.1  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.324262  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1263  acyl carrier protein  33.33 
 
 
82 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0921694 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1325  acyl carrier protein  28.57 
 
 
79 aa  42.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0876  acyl carrier protein  32.89 
 
 
84 aa  42.4  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1105  hypothetical protein  30.3 
 
 
84 aa  42.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4810  acyl carrier protein  30.77 
 
 
82 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0303207  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3376  acyl carrier protein  28.95 
 
 
97 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271148  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3427  acyl carrier protein  28.95 
 
 
97 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120295  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0451  Acyl carrier protein  25.4 
 
 
84 aa  42  0.003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3365  acyl carrier protein  28.95 
 
 
97 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257859  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3483  acyl carrier protein  33.33 
 
 
82 aa  42  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.520778  normal  0.883416 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3512  acyl carrier protein  28.57 
 
 
79 aa  42  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.410127  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2945  phosphopantetheine-binding protein  40 
 
 
78 aa  41.6  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.129659  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1096  acyl carrier protein  29.49 
 
 
83 aa  41.6  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000417281  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1849  acyl carrier protein  42.86 
 
 
77 aa  41.6  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000445968  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3380  acyl carrier protein  27.27 
 
 
79 aa  41.2  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0442067  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3755  acyl carrier protein  28.95 
 
 
99 aa  41.2  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.345144  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2725  phosphopantetheine-binding protein  28.57 
 
 
101 aa  41.2  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1672  acyl carrier protein  37.21 
 
 
77 aa  40.8  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0507  acyl carrier protein  30.51 
 
 
77 aa  40.8  0.007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0583644  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1701  acyl carrier protein  25.32 
 
 
79 aa  40.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12010  acyl carrier protein  25.71 
 
 
82 aa  40.4  0.009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.114572  normal  0.0939277 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12273  acyl carrier protein  30.36 
 
 
115 aa  40.4  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.46303  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2778  acyl carrier protein  30.3 
 
 
99 aa  40.4  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.961024 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>