23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2178 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2178  phosphopantetheine-binding protein  100 
 
 		 81 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.510535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3604  phosphopantetheine-binding protein  46.05 
 
 		 80 aa  72.8  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1411  phosphopantetheine-binding protein  44 
 
 		 84 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1612  hypothetical protein  36.25 
 
 		 81 aa  61.2  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00005517  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1416  hypothetical protein  38.16 
 
 		 84 aa  60.5  0.000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.285013  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7032  hypothetical protein  37.66 
 
 		 83 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.343078  normal  0.583052 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0507  phosphopantetheine-binding  36.84 
 
 		 80 aa  57.4  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2709  phosphopantetheine-binding  36.25 
 
 		 88 aa  57.4  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.169236  hitchhiker  0.0000263676 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1111  phosphopantetheine-binding protein  34.21 
 
 		 86 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1094  phosphopantetheine-binding protein  34.21 
 
 		 86 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1122  phosphopantetheine-binding protein  34.21 
 
 		 86 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3572  hypothetical protein  36.84 
 
 		 89 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.141055 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4648  hypothetical protein  36.84 
 
 		 89 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2594  phosphopantetheine-binding  33.33 
 
 		 81 aa  55.5  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.79488  hitchhiker  0.000628646 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3469  hypothetical protein  38.24 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.414098  normal  0.140007 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0384  phosphopantetheine-binding  34.67 
 
 		 83 aa  53.9  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0931  hypothetical protein  37.68 
 
 		 82 aa  52.4  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3287  phosphopantetheine-binding  41.27 
 
 		 87 aa  52  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.31338 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0765  phosphopantetheine-binding  36.62 
 
 		 87 aa  50.8  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.321905  normal  0.579086 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4983  acetyl-CoA synthetase  44.44 
 
 		 280 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.793805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0324  acyl carrier protein  37.93 
 
 		 82 aa  41.6  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00657258 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3876  phosphopantetheine-binding  30.38 
 
 		 82 aa  40.4  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.508072 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3889  acyl carrier protein  34.48 
 
 		 82 aa  40  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>