27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2659 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_2659  acyl carrier protein, putative  100 
 
 
140 aa  284  2.9999999999999996e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.70759  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0686  acyl carrier protein, putative  48.7 
 
 
135 aa  102  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3716  phosphopantetheine-binding  45.61 
 
 
124 aa  99.4  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.197892  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1005  acyl carrier protein, putative  45.61 
 
 
137 aa  95.1  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.552515 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1121  phosphopantetheine-binding  44.04 
 
 
126 aa  90.5  7e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.513258  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1246  acyl carrier protein  46 
 
 
93 aa  48.9  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.15129  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3353  acyl carrier protein  46 
 
 
93 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.53669  normal  0.0790473 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2111  acyl carrier protein  46 
 
 
93 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144779  normal  0.165327 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2090  acyl carrier protein  46 
 
 
93 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1506  acyl carrier protein  46 
 
 
93 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.41568  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2233  acyl carrier protein  46 
 
 
93 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5351  acyl carrier protein  35.09 
 
 
78 aa  46.2  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1263  acyl carrier protein  42 
 
 
93 aa  45.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.321822 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3522  acyl carrier protein  42 
 
 
93 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1157  acyl carrier protein  40.35 
 
 
78 aa  45.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000567099  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5019  acyl carrier protein  42.59 
 
 
102 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.256894  normal  0.657506 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4548  acyl carrier protein  39.34 
 
 
98 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00748175 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5061  acyl carrier protein  39.34 
 
 
98 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5008  acyl carrier protein  39.34 
 
 
98 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.312305  normal  0.300589 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1868  acyl carrier protein  42 
 
 
95 aa  43.9  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4854  acyl carrier protein  42 
 
 
95 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.62131  normal  0.144839 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0984  acyl carrier protein  38.46 
 
 
82 aa  41.6  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.156105  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0855  acyl carrier protein  40 
 
 
93 aa  41.2  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0847  acyl carrier protein  40 
 
 
93 aa  41.2  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1672  acyl carrier protein  35.09 
 
 
77 aa  40.8  0.007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2029  acyl carrier protein  37.74 
 
 
92 aa  40.4  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2564  acyl carrier protein  33.33 
 
 
77 aa  40.4  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>