182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3716 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_3716  phosphopantetheine-binding  100 
 
 
124 aa  249  9.000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.197892  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1121  phosphopantetheine-binding  48.28 
 
 
126 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.513258  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2659  acyl carrier protein, putative  45.61 
 
 
140 aa  99.4  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.70759  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0686  acyl carrier protein, putative  40 
 
 
135 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1005  acyl carrier protein, putative  41.23 
 
 
137 aa  77.8  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.552515 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2564  acyl carrier protein  35.06 
 
 
77 aa  53.9  0.0000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1157  acyl carrier protein  36 
 
 
78 aa  52.8  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000567099  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0663  acyl carrier protein  38.57 
 
 
77 aa  52.8  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00175647  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1416  acyl carrier protein  40 
 
 
76 aa  52  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.28944  normal  0.571191 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0436  acyl carrier protein  37.14 
 
 
76 aa  52  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.20002  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0225  acyl carrier protein  42.86 
 
 
81 aa  51.2  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.623939  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0536  acyl carrier protein  42.86 
 
 
80 aa  50.8  0.000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.75126  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1975  acyl carrier protein  37.68 
 
 
79 aa  50.4  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.166506  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1639  phosphopantetheine-binding protein  34.78 
 
 
87 aa  49.7  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0535915  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4504  acyl carrier protein  37.68 
 
 
81 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1672  acyl carrier protein  37.66 
 
 
77 aa  49.7  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2951  phosphopantetheine-binding protein  34.78 
 
 
80 aa  49.3  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.765509  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2371  acyl carrier protein  35.44 
 
 
84 aa  48.9  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.272715  normal  0.051956 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1722  acyl carrier protein  45.45 
 
 
75 aa  48.1  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1852  acyl carrier protein  40.35 
 
 
76 aa  47.8  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3099  acyl carrier protein  43.86 
 
 
76 aa  47.8  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0179771 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2519  acyl carrier protein  35.63 
 
 
79 aa  47.4  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0561  acyl carrier protein  39.66 
 
 
77 aa  47.4  0.00006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0230  acyl carrier protein  39.66 
 
 
79 aa  47.4  0.00007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0452  acyl carrier protein  33.77 
 
 
88 aa  47  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26061  acyl carrier protein  41.82 
 
 
103 aa  47  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0126  acyl carrier protein  41.82 
 
 
80 aa  47  0.00009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.395264  hitchhiker  0.00283985 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7056  acyl carrier protein  33.33 
 
 
79 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0170  acyl carrier protein  41.82 
 
 
80 aa  46.2  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.519616  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2430  acyl carrier protein  40.35 
 
 
76 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000123335  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0643  acyl carrier protein  38.55 
 
 
77 aa  46.2  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000166271  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1216  acyl carrier protein  35.63 
 
 
78 aa  46.6  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.729885  normal  0.686684 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3249  acyl carrier protein  36 
 
 
79 aa  46.2  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.124771  normal  0.0273605 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1527  acyl carrier protein  39.29 
 
 
79 aa  46.2  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0310  acyl carrier protein  42.37 
 
 
76 aa  46.6  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00336649  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3122  phosphopantetheine-binding protein  37.88 
 
 
128 aa  46.2  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.172953  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2874  acyl carrier protein  35.71 
 
 
78 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0334524  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0424  hypothetical protein  43.1 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1602  acyl carrier protein  37.68 
 
 
77 aa  46.2  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000714682  normal  0.960802 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1610  Acyl carrier protein (ACP)  35.71 
 
 
90 aa  45.4  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3247  acyl carrier protein  35.71 
 
 
78 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1836  acyl carrier protein  32.89 
 
 
76 aa  45.4  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000000576824  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1935  acyl carrier protein  37.84 
 
 
77 aa  45.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000441044  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0088  acyl carrier protein  33.8 
 
 
78 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0400  hypothetical protein  41.38 
 
 
137 aa  45.4  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4192  acyl carrier protein  38.6 
 
 
78 aa  45.1  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.666871  normal  0.675617 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10300  acyl carrier protein  43.4 
 
 
78 aa  45.1  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00141848  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4505  acyl carrier protein  35.62 
 
 
81 aa  45.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265662  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0959  acyl carrier protein  32.14 
 
 
80 aa  45.1  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3460  acyl carrier protein  41.27 
 
 
81 aa  45.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000712705 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3105  acyl carrier protein  37.68 
 
 
77 aa  45.4  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000128081  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0616  acyl carrier protein  40 
 
 
74 aa  45.1  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000175358  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1157  acyl carrier protein  37.68 
 
 
77 aa  45.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.917954 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2083  acyl carrier protein  41.38 
 
 
76 aa  45.4  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000417197  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1733  acyl carrier protein  34.67 
 
 
79 aa  44.7  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.9219  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1878  acyl carrier protein  37.68 
 
 
77 aa  44.7  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0843624  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5148  acyl carrier protein  36.84 
 
 
79 aa  44.3  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.166001 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1768  acyl carrier protein  41.07 
 
 
77 aa  44.3  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.461775 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1664  Acyl carrier protein (ACP)  34.21 
 
 
78 aa  44.3  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0513886  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3358  acyl carrier protein  37.5 
 
 
79 aa  44.3  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.304425  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1604  acyl carrier protein  36.23 
 
 
77 aa  43.9  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.0000908014  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1382  acyl carrier protein  34.67 
 
 
81 aa  43.9  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0180925  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1767  acyl carrier protein  37.5 
 
 
78 aa  43.9  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0300385  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1745  acyl carrier protein  35.14 
 
 
77 aa  43.9  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000920991  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0285  acyl carrier protein  37.5 
 
 
77 aa  43.9  0.0007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2630  acyl carrier protein  34.67 
 
 
79 aa  43.9  0.0008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1186  acyl carrier protein  34.67 
 
 
79 aa  43.9  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.026536 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3277  acyl carrier protein  34.67 
 
 
79 aa  43.9  0.0008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.796037  normal  0.660207 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1325  acyl carrier protein  35.94 
 
 
79 aa  43.9  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5269  acyl carrier protein  34.67 
 
 
79 aa  43.9  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1181  acyl carrier protein  35.53 
 
 
76 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185913  decreased coverage  0.00116588 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1185  acyl carrier protein  38.18 
 
 
80 aa  42.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00688444  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3646  acyl carrier protein  34.67 
 
 
79 aa  43.5  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0510  acyl carrier protein  35.71 
 
 
77 aa  43.1  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3071  acyl carrier protein  34.67 
 
 
79 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20601  acyl carrier protein  38.18 
 
 
80 aa  42.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417158  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0883  acyl carrier protein  32.76 
 
 
82 aa  43.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000242851  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2029  acyl carrier protein  37.25 
 
 
92 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0493  acyl carrier protein  37.5 
 
 
77 aa  42  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0459  acyl carrier protein  37.5 
 
 
78 aa  42.4  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.997029  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3914  acyl carrier protein  38.46 
 
 
78 aa  42.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2463  acyl carrier protein  39.29 
 
 
77 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1526  acyl carrier protein  33.8 
 
 
78 aa  42  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.262214 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1633  acyl carrier protein  39.29 
 
 
83 aa  42.4  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1627  acyl carrier protein  37.5 
 
 
77 aa  42.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0810267  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1641  acyl carrier protein  32.89 
 
 
82 aa  42.4  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0280  acyl carrier protein  37.5 
 
 
78 aa  42.4  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.344257 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1320  acyl carrier protein  35.29 
 
 
94 aa  42.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0168  acyl carrier protein  36.21 
 
 
76 aa  42.4  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000122767  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0363  acyl carrier protein  36.84 
 
 
78 aa  42.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.878931  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0608  acyl carrier protein  40.35 
 
 
79 aa  42.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000394559 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0660  acyl carrier protein  36.84 
 
 
81 aa  42.7  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.179037  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0933  acyl carrier protein  39.29 
 
 
74 aa  42.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000201436  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1125  acyl carrier protein  39.29 
 
 
77 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.854343  normal  0.264309 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0267  acyl carrier protein  32.76 
 
 
81 aa  42.7  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0366533  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1070  acyl carrier protein  39.29 
 
 
77 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0381067  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0269  acyl carrier protein  32.76 
 
 
81 aa  42.7  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107759  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0464  acyl carrier protein  37.5 
 
 
78 aa  42.4  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1160  acyl carrier protein  37.33 
 
 
84 aa  42.4  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000195346  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0572  acyl carrier protein  37.5 
 
 
78 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000726263  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>