More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3848 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_3848  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  100 
 
 
293 aa  590  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3555  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  90.78 
 
 
293 aa  537  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.346556  normal  0.959624 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1270  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  62.5 
 
 
291 aa  371  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1647  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  62.5 
 
 
291 aa  365  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3026  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  62.5 
 
 
295 aa  364  1e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.65346  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1594  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  62.15 
 
 
291 aa  361  6e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2526  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  61.77 
 
 
297 aa  355  6.999999999999999e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.451286 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4004  glutamyl-tRNA Synthetase  63.41 
 
 
300 aa  342  4e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5237  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  59.72 
 
 
293 aa  335  5.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0925  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  57.99 
 
 
293 aa  330  2e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0814  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  59.03 
 
 
293 aa  325  5e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0121184  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0748  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  60.07 
 
 
290 aa  325  6e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3486  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  58.33 
 
 
290 aa  317  2e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4885  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  58.33 
 
 
291 aa  315  7e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.763811  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1135  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  56.6 
 
 
289 aa  312  4.999999999999999e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1631  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  52.67 
 
 
300 aa  295  7e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1152  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  51.9 
 
 
296 aa  290  2e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0433  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  51.77 
 
 
300 aa  278  6e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.245472 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0957  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  51.36 
 
 
304 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.800313  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1847  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  53.74 
 
 
294 aa  268  8e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978391  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3840  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  50.69 
 
 
315 aa  263  2e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3734  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  51.77 
 
 
293 aa  263  2e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3286  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  50.36 
 
 
296 aa  259  3e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0410237 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3110  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  55.32 
 
 
284 aa  255  5e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.599577 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2391  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  49.47 
 
 
280 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00564055 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1025  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  51.58 
 
 
297 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.255521 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4877  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  53.85 
 
 
279 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.284735  normal  0.0736778 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3652  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  47.89 
 
 
288 aa  244  9.999999999999999e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1491  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  47.52 
 
 
281 aa  242  5e-63  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.88267  normal  0.107951 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3205  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  47.04 
 
 
279 aa  235  6e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.572919  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1393  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  46.71 
 
 
282 aa  228  7e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1285  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  50 
 
 
277 aa  228  9e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.442309 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2500  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  44.75 
 
 
294 aa  226  5.0000000000000005e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.296852 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2628  glutamyl-/ glutaminyl-tRNA synthetase  49.65 
 
 
277 aa  225  8e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3242  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  46.72 
 
 
302 aa  216  4e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.533395  normal  0.726961 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1164  glutamate--tRNA ligase  46.23 
 
 
276 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.647916  normal  0.361604 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2353  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  43.88 
 
 
278 aa  210  2e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.930617  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4079  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  45.99 
 
 
281 aa  210  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.688664 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3084  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  46.76 
 
 
287 aa  204  2e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.852004  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0551  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  45.82 
 
 
281 aa  199  6e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1325  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  45.04 
 
 
281 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1474  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  45.36 
 
 
287 aa  196  5.000000000000001e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.104503  normal  0.08026 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0306  Glutamate--tRNA ligase  39.52 
 
 
323 aa  159  7e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09840  glutamyl-tRNA synthetase  36.56 
 
 
492 aa  158  9e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.224887 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1332  Glutamate--tRNA ligase  36.69 
 
 
311 aa  154  2e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000257577  decreased coverage  0.00027046 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07310  glutamyl- or glutaminyl-tRNA synthetase  36.4 
 
 
318 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0295  glutamate--tRNA ligase  38.83 
 
 
323 aa  152  7e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.436066  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1719  glutamyl-tRNA synthetase  34.44 
 
 
477 aa  152  8e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0317  Glutamate--tRNA ligase  38.83 
 
 
323 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1302  glutamyl-tRNA synthetase  35.19 
 
 
535 aa  151  2e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08460  glutamyl-tRNA synthetase  34.83 
 
 
498 aa  151  2e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.842364  normal  0.487414 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4726  Glutamate--tRNA ligase  40.3 
 
 
316 aa  149  4e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0696299  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1951  glutamyl-tRNA synthetase  36.49 
 
 
486 aa  149  6e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0884384  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1586  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  36.3 
 
 
313 aa  149  6e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.384476  normal  0.0681988 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0641  glutamyl-tRNA synthetase  34.89 
 
 
477 aa  148  8e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2900  glutamate--tRNA ligase  42.32 
 
 
302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0201877  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0947  Glutamate--tRNA ligase  37.19 
 
 
313 aa  144  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.507725  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3061  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  39.62 
 
 
291 aa  143  3e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.293014  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  31.38 
 
 
488 aa  143  4e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000204549  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04741  glutamyl-tRNA synthetase  32.08 
 
 
492 aa  142  5e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.633658  normal  0.679149 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1031  glutamate--tRNA ligase  41.31 
 
 
283 aa  142  6e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2934  glutamate--tRNA ligase  38.3 
 
 
327 aa  142  9e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0900886  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1329  tRNA synthetase class I domain-containing protein  37.36 
 
 
314 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1769  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  36.05 
 
 
331 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  33.22 
 
 
488 aa  140  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0319  glutamate--tRNA ligase  38.79 
 
 
337 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.468556  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0670  glutamyl-tRNA synthetase  34.8 
 
 
464 aa  140  1.9999999999999998e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.418683  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2226  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  38.4 
 
 
311 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000178146  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3717  glutamyl-tRNA synthetase  36.3 
 
 
468 aa  139  4.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0517014 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2904  glutamate--tRNA ligase  38.41 
 
 
338 aa  139  7e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.437681  normal  0.870267 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2250  glutamyl-tRNA synthetase  36.65 
 
 
472 aa  138  1e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.000000000347292  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1905  glutamate--tRNA ligase  36.86 
 
 
309 aa  137  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0217385  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1396  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  35.56 
 
 
334 aa  138  1e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.535698  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3985  glutamate--tRNA ligase  37.45 
 
 
298 aa  138  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2357  glutamyl-tRNA synthetase  31.34 
 
 
490 aa  137  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2004  glutamyl-tRNA synthetase  34.52 
 
 
329 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.266458  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1780  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  37.07 
 
 
314 aa  136  4e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.234416 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0690  glutamate--tRNA ligase  38.31 
 
 
300 aa  136  4e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.858834 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4602  glutamyl-tRNA synthetase  36.84 
 
 
447 aa  136  4e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12827  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0935  glutamyl-tRNA synthetase  37.05 
 
 
468 aa  136  5e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.355577  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06791  glutamyl-tRNA synthetase  32.04 
 
 
476 aa  135  6.0000000000000005e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  34.69 
 
 
467 aa  135  8e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  32.59 
 
 
479 aa  135  9e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  33.57 
 
 
485 aa  135  9e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3092  glutamyl-tRNA synthetase  32.55 
 
 
471 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.45014 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49888  predicted protein  33.09 
 
 
546 aa  135  9.999999999999999e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.757825  normal  0.413505 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3126  Glutamate--tRNA ligase  38.97 
 
 
307 aa  135  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.216069  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1251  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  36.12 
 
 
296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.540986  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2709  glutamyl-tRNA synthetase  38.66 
 
 
301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.63084  normal  0.578011 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0570  Glutamate--tRNA ligase  33.9 
 
 
319 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0504  glutamyl-tRNA synthetase  34.15 
 
 
504 aa  134  1.9999999999999998e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0630842  normal  0.758869 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1995  glutamyl-tRNA synthetase  33.45 
 
 
471 aa  133  3e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.249393  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_52655  glutamyl-trna synthase  35.22 
 
 
588 aa  133  3.9999999999999996e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.233509  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4720  glutamate--tRNA ligase  37.5 
 
 
292 aa  133  3.9999999999999996e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.943988  normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0884  glutamyl-tRNA synthetase  32.85 
 
 
441 aa  133  3.9999999999999996e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0428129  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05371  glutamyl-tRNA synthetase  31.05 
 
 
493 aa  132  5e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1133  glutamyl-tRNA synthetase  34.69 
 
 
466 aa  132  6e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.484042  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0705  glutamyl-tRNA synthetase  33.45 
 
 
471 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2919  glutamyl-tRNA synthetase  33.82 
 
 
469 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000159151  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2014  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  36.8 
 
 
311 aa  132  9e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>