More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1491 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1491  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  100 
 
 
281 aa  577  1e-164  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.88267  normal  0.107951 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3110  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  53.53 
 
 
284 aa  264  1e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.599577 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3652  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  48.56 
 
 
288 aa  261  8.999999999999999e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3734  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  52.27 
 
 
293 aa  260  2e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3555  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  47.52 
 
 
293 aa  249  4e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.346556  normal  0.959624 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0748  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  47.83 
 
 
290 aa  245  6e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1631  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  44.98 
 
 
300 aa  245  6.999999999999999e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3848  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  47.52 
 
 
293 aa  242  3.9999999999999997e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4885  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  46.67 
 
 
291 aa  241  9e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.763811  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1152  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  47.84 
 
 
296 aa  240  2e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0814  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  45.23 
 
 
293 aa  240  2e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0121184  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1847  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  48.53 
 
 
294 aa  238  8e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978391  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2353  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  46.18 
 
 
278 aa  238  1e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.930617  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1325  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  48.89 
 
 
281 aa  236  3e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0925  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  44.6 
 
 
293 aa  236  4e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5237  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  44.6 
 
 
293 aa  235  7e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0433  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  46.57 
 
 
300 aa  234  1.0000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.245472 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1474  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  48.6 
 
 
287 aa  226  2e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.104503  normal  0.08026 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2526  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  44.68 
 
 
297 aa  224  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.451286 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3486  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  44.33 
 
 
290 aa  224  1e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1135  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  43.42 
 
 
289 aa  224  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0957  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  45.04 
 
 
304 aa  223  2e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.800313  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1647  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  42.36 
 
 
291 aa  223  3e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2391  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  45.62 
 
 
280 aa  223  3e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00564055 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3026  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  42.11 
 
 
295 aa  223  3e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.65346  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3840  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  44.1 
 
 
315 aa  221  9.999999999999999e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4877  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  48.36 
 
 
279 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.284735  normal  0.0736778 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0551  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  48.29 
 
 
281 aa  220  1.9999999999999999e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1285  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  47.31 
 
 
277 aa  219  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.442309 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1270  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  40.91 
 
 
291 aa  219  3e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1393  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  44.44 
 
 
282 aa  219  3e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1594  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  42.01 
 
 
291 aa  219  5e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1164  glutamate--tRNA ligase  47 
 
 
276 aa  218  7e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.647916  normal  0.361604 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3242  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  46.35 
 
 
302 aa  218  7e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.533395  normal  0.726961 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3286  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  45.59 
 
 
296 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0410237 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1025  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  47.48 
 
 
297 aa  215  7e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.255521 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2628  glutamyl-/ glutaminyl-tRNA synthetase  46.59 
 
 
277 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2500  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  43.1 
 
 
294 aa  213  1.9999999999999998e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.296852 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3205  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  44.16 
 
 
279 aa  210  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.572919  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4079  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  44.88 
 
 
281 aa  211  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.688664 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3084  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  47.66 
 
 
287 aa  210  2e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.852004  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4004  glutamyl-tRNA Synthetase  41.9 
 
 
300 aa  204  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07310  glutamyl- or glutaminyl-tRNA synthetase  40.15 
 
 
318 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1396  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  42.01 
 
 
334 aa  175  8e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.535698  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1586  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  39.43 
 
 
313 aa  174  9.999999999999999e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.384476  normal  0.0681988 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2900  glutamate--tRNA ligase  42.25 
 
 
302 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0201877  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3764  Glutamate--tRNA ligase  41.73 
 
 
297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1769  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  39.79 
 
 
331 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0570  Glutamate--tRNA ligase  41.58 
 
 
319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1332  Glutamate--tRNA ligase  36.88 
 
 
311 aa  171  2e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000257577  decreased coverage  0.00027046 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3061  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  39.06 
 
 
291 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.293014  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0867  Glutamate--tRNA ligase  40.57 
 
 
327 aa  165  6.9999999999999995e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0947  Glutamate--tRNA ligase  38.81 
 
 
313 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.507725  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0334  Glutamate--tRNA ligase  35.08 
 
 
373 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.374336 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4726  Glutamate--tRNA ligase  39.21 
 
 
316 aa  162  5.0000000000000005e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0696299  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0306  Glutamate--tRNA ligase  41.2 
 
 
323 aa  162  8.000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1031  glutamate--tRNA ligase  40.53 
 
 
283 aa  161  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1905  glutamate--tRNA ligase  38.01 
 
 
309 aa  160  3e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0217385  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1329  tRNA synthetase class I domain-containing protein  40.91 
 
 
314 aa  159  4e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3450  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  39.3 
 
 
330 aa  159  4e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0690  glutamate--tRNA ligase  40.38 
 
 
300 aa  159  5e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.858834 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3985  glutamate--tRNA ligase  40.93 
 
 
298 aa  159  6e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1780  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  39.62 
 
 
314 aa  158  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.234416 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0319  glutamate--tRNA ligase  41.2 
 
 
337 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.468556  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2004  glutamyl-tRNA synthetase  39.13 
 
 
329 aa  157  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.266458  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0295  glutamate--tRNA ligase  41.2 
 
 
323 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.436066  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3027  glutamate--tRNA ligase  36.23 
 
 
278 aa  157  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.968888  normal  0.390374 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2934  glutamate--tRNA ligase  38.63 
 
 
327 aa  156  3e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0900886  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09840  glutamyl-tRNA synthetase  34.62 
 
 
492 aa  156  3e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.224887 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1302  glutamyl-tRNA synthetase  35.44 
 
 
535 aa  156  4e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0641  glutamyl-tRNA synthetase  35.61 
 
 
477 aa  156  5.0000000000000005e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2709  glutamyl-tRNA synthetase  39 
 
 
301 aa  155  8e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.63084  normal  0.578011 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1882  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  37.45 
 
 
295 aa  154  1e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13470  glutamyl- or glutaminyl-tRNA synthetase  36.1 
 
 
317 aa  154  2e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.301512  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0317  Glutamate--tRNA ligase  40.49 
 
 
323 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0927  glutamyl-tRNA synthetase-related protein  40.47 
 
 
296 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1046  Glutamate--tRNA ligase  40.47 
 
 
296 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244442 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1023  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  38.95 
 
 
303 aa  153  2.9999999999999998e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.202098  hitchhiker  0.00000345941 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0670  glutamyl-tRNA synthetase  34.18 
 
 
464 aa  152  5e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.418683  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1982  glutamate--tRNA ligase  38.01 
 
 
323 aa  152  8e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.193008  normal  0.926165 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3294  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  37.5 
 
 
296 aa  151  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  35.48 
 
 
467 aa  151  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000050225  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  35.13 
 
 
467 aa  150  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0676  glutamate--tRNA ligase  39.77 
 
 
310 aa  150  2e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0414  Glutamate--tRNA ligase  36.33 
 
 
309 aa  150  3e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1188  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  38.55 
 
 
310 aa  149  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0787184 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2648  glutamyl-tRNA synthetase  36.1 
 
 
464 aa  150  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0935  glutamyl-tRNA synthetase  36.3 
 
 
468 aa  150  3e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.355577  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1951  glutamyl-tRNA synthetase  36.69 
 
 
486 aa  149  4e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0884384  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1251  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  38.28 
 
 
296 aa  149  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.540986  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1782  Glutamate--tRNA ligase  38.01 
 
 
323 aa  149  4e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2581  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  39.03 
 
 
310 aa  149  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.457948 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4602  glutamyl-tRNA synthetase  37.87 
 
 
447 aa  149  5e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12827  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2904  glutamate--tRNA ligase  36.73 
 
 
338 aa  149  5e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.437681  normal  0.870267 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2226  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  38.2 
 
 
311 aa  149  7e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000178146  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0696  glutamyl-tRNA synthetase  35.9 
 
 
463 aa  148  9e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.69774  normal  0.269454 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0504  glutamyl-tRNA synthetase  34.44 
 
 
504 aa  148  1.0000000000000001e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0630842  normal  0.758869 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4720  glutamate--tRNA ligase  38.46 
 
 
292 aa  147  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.943988  normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08460  glutamyl-tRNA synthetase  33.69 
 
 
498 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.842364  normal  0.487414 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3371  glutamate--tRNA ligase  38.17 
 
 
309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>