More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3205 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3205  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  100 
 
 
279 aa  550  1e-156  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.572919  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2353  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  56.89 
 
 
278 aa  308  5.9999999999999995e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.930617  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0748  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  54.2 
 
 
290 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3734  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  56.54 
 
 
293 aa  281  6.000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0814  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  54.2 
 
 
293 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0121184  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3486  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  51.72 
 
 
290 aa  264  1e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4885  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  52.1 
 
 
291 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.763811  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1647  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  49.31 
 
 
291 aa  258  7e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1631  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  49.83 
 
 
300 aa  257  2e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1270  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  47.92 
 
 
291 aa  256  4e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1135  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  50.35 
 
 
289 aa  256  4e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1594  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  48.96 
 
 
291 aa  254  1.0000000000000001e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0925  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  50.35 
 
 
293 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5237  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  48.44 
 
 
293 aa  251  7e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3652  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  52.55 
 
 
288 aa  250  2e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0433  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  48.77 
 
 
300 aa  244  9e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.245472 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2526  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  48.59 
 
 
297 aa  238  1e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.451286 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3026  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  47.77 
 
 
295 aa  237  2e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.65346  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3840  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  47.57 
 
 
315 aa  235  5.0000000000000005e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3848  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  47.04 
 
 
293 aa  235  6e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3110  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  53.68 
 
 
284 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.599577 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3555  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  46.69 
 
 
293 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.346556  normal  0.959624 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1325  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  50.54 
 
 
281 aa  233  3e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3286  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  47.16 
 
 
296 aa  230  2e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0410237 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4877  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  51.21 
 
 
279 aa  224  1e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.284735  normal  0.0736778 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1847  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  51.07 
 
 
294 aa  223  4e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978391  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1474  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  50.18 
 
 
287 aa  219  3e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.104503  normal  0.08026 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1152  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  44.6 
 
 
296 aa  218  7.999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1393  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  47.04 
 
 
282 aa  217  2e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2391  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  46.83 
 
 
280 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00564055 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2500  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  44.44 
 
 
294 aa  213  1.9999999999999998e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.296852 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4004  glutamyl-tRNA Synthetase  44.33 
 
 
300 aa  212  3.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3242  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  48.74 
 
 
302 aa  211  1e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.533395  normal  0.726961 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4079  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  50.7 
 
 
281 aa  211  1e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.688664 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1491  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  44.16 
 
 
281 aa  210  2e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.88267  normal  0.107951 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1285  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  48.76 
 
 
277 aa  209  4e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.442309 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0957  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  44.6 
 
 
304 aa  207  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.800313  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2628  glutamyl-/ glutaminyl-tRNA synthetase  48.06 
 
 
277 aa  205  7e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1164  glutamate--tRNA ligase  46.1 
 
 
276 aa  198  7e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.647916  normal  0.361604 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3084  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  50.71 
 
 
287 aa  193  3e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.852004  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1025  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  45.64 
 
 
297 aa  187  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.255521 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0551  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  44.24 
 
 
281 aa  184  1.0000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1332  Glutamate--tRNA ligase  38.81 
 
 
311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000257577  decreased coverage  0.00027046 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07310  glutamyl- or glutaminyl-tRNA synthetase  40.91 
 
 
318 aa  169  4e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1586  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  41.42 
 
 
313 aa  161  1e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.384476  normal  0.0681988 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0334  Glutamate--tRNA ligase  38.49 
 
 
373 aa  159  4e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.374336 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0306  Glutamate--tRNA ligase  42.46 
 
 
323 aa  158  8e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4726  Glutamate--tRNA ligase  43.07 
 
 
316 aa  157  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0696299  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1769  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  39.16 
 
 
331 aa  157  3e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2275  glutamyl-tRNA synthetase  38.79 
 
 
441 aa  155  6e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.845682  normal  0.24806 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1031  glutamate--tRNA ligase  41.41 
 
 
283 aa  154  1e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0295  glutamate--tRNA ligase  41.9 
 
 
323 aa  153  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.436066  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3636  glutamyl-tRNA synthetase  37.63 
 
 
449 aa  150  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.158878 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1302  glutamyl-tRNA synthetase  35.36 
 
 
535 aa  150  2e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2748  glutamyl-tRNA synthetase  39.36 
 
 
440 aa  150  3e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.042231 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3764  Glutamate--tRNA ligase  39.45 
 
 
297 aa  149  4e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0641  glutamyl-tRNA synthetase  36.49 
 
 
477 aa  149  5e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2455  glutamyl-tRNA synthetase  36.71 
 
 
441 aa  149  6e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0895293 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0884  glutamyl-tRNA synthetase  36.69 
 
 
441 aa  148  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0428129  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1396  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  37.63 
 
 
334 aa  146  3e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.535698  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06791  glutamyl-tRNA synthetase  33.56 
 
 
476 aa  146  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05371  glutamyl-tRNA synthetase  34.28 
 
 
493 aa  146  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0317  Glutamate--tRNA ligase  40.14 
 
 
323 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3450  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  40.21 
 
 
330 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0365  Glutamate--tRNA ligase  40.78 
 
 
312 aa  145  8.000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2004  glutamyl-tRNA synthetase  38.49 
 
 
329 aa  144  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.266458  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08460  glutamyl-tRNA synthetase  36.2 
 
 
498 aa  144  2e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.842364  normal  0.487414 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09840  glutamyl-tRNA synthetase  36.3 
 
 
492 aa  144  2e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.224887 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1719  glutamyl-tRNA synthetase  36.71 
 
 
477 aa  144  2e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04741  glutamyl-tRNA synthetase  33.45 
 
 
492 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.633658  normal  0.679149 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0382  glutamyl-tRNA synthetase  35.66 
 
 
441 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.699293  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0319  glutamate--tRNA ligase  42.65 
 
 
337 aa  143  3e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.468556  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0473  glutamyl-tRNA synthetase  31.83 
 
 
479 aa  143  4e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.138189  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0670  glutamyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 
464 aa  142  6e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.418683  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0797  glutamyl-tRNA synthetase  36.71 
 
 
441 aa  142  7e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.143416  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0570  Glutamate--tRNA ligase  41.09 
 
 
319 aa  142  8e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2934  glutamate--tRNA ligase  38.91 
 
 
327 aa  141  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0900886  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004184  glutamyl-tRNA synthetase  34.4 
 
 
475 aa  141  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.926878  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0935  glutamyl-tRNA synthetase  38.35 
 
 
468 aa  141  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.355577  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3027  glutamate--tRNA ligase  35.07 
 
 
278 aa  141  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.968888  normal  0.390374 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3060  glutamyl-tRNA synthetase  34.38 
 
 
481 aa  141  1.9999999999999998e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000448328  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2250  glutamyl-tRNA synthetase  37.1 
 
 
472 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.000000000347292  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1951  glutamyl-tRNA synthetase  36.63 
 
 
486 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0884384  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0867  Glutamate--tRNA ligase  38.03 
 
 
327 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2900  glutamate--tRNA ligase  40.23 
 
 
302 aa  140  3e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0201877  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0456  glutamyl-tRNA synthetase  34.32 
 
 
480 aa  140  3e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04981  glutamyl-tRNA synthetase  32.38 
 
 
476 aa  140  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.475242  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0947  Glutamate--tRNA ligase  38.64 
 
 
313 aa  140  3e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.507725  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  34.49 
 
 
477 aa  139  6e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4861  glutamyl-tRNA synthetase  33.56 
 
 
481 aa  139  7e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000702508  unclonable  0.000000180865 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4941  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  38.43 
 
 
293 aa  139  7e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5029  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  38.43 
 
 
293 aa  139  7e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3985  glutamate--tRNA ligase  39.77 
 
 
298 aa  139  7e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05281  glutamyl-tRNA synthetase  32.03 
 
 
476 aa  138  7.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5322  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  38.06 
 
 
293 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1188  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  38.85 
 
 
310 aa  137  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0787184 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4302  glutamyl-tRNA synthetase  31.96 
 
 
481 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1905  glutamate--tRNA ligase  37.09 
 
 
309 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0217385  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2919  glutamyl-tRNA synthetase  33.82 
 
 
469 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000159151  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0188  glutamate--tRNA(Gln) ligase / glutamyl-tRNA synthetase  34.48 
 
 
881 aa  137  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.558191 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>