More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0473 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0473  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 
479 aa  976    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.138189  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05281  glutamyl-tRNA synthetase  88.03 
 
 
476 aa  865    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04981  glutamyl-tRNA synthetase  88.66 
 
 
476 aa  870    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.475242  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05371  glutamyl-tRNA synthetase  77.78 
 
 
493 aa  763    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04741  glutamyl-tRNA synthetase  56.09 
 
 
492 aa  555  1e-157  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.633658  normal  0.679149 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05291  glutamyl-tRNA synthetase  55.04 
 
 
492 aa  550  1e-155  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0717874 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1806  glutamyl-tRNA synthetase  55.04 
 
 
476 aa  550  1e-155  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06791  glutamyl-tRNA synthetase  51.89 
 
 
476 aa  541  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1719  glutamyl-tRNA synthetase  50.74 
 
 
477 aa  529  1e-149  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0641  glutamyl-tRNA synthetase  51.58 
 
 
477 aa  531  1e-149  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4302  glutamyl-tRNA synthetase  51.94 
 
 
481 aa  513  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4861  glutamyl-tRNA synthetase  50.41 
 
 
481 aa  499  1e-140  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000702508  unclonable  0.000000180865 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0188  glutamate--tRNA(Gln) ligase / glutamyl-tRNA synthetase  49.69 
 
 
881 aa  495  1e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2393  glutamyl-tRNA synthetase  48.14 
 
 
481 aa  488  1e-137  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0156972  hitchhiker  0.00526056 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3196  glutamyl-tRNA synthetase  49.69 
 
 
482 aa  489  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3060  glutamyl-tRNA synthetase  50 
 
 
481 aa  486  1e-136  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000448328  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2361  glutamyl-tRNA synthetase  49.38 
 
 
483 aa  479  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000183639  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2309  glutamyl-tRNA synthetase  49.07 
 
 
483 aa  478  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  38.38 
 
 
479 aa  333  5e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  38.16 
 
 
485 aa  331  2e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  40 
 
 
488 aa  330  4e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  35.89 
 
 
482 aa  329  8e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  36.73 
 
 
485 aa  325  2e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  40.17 
 
 
490 aa  324  2e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  36.71 
 
 
491 aa  324  3e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0814  glutamyl-tRNA synthetase  37.19 
 
 
468 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.407873  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2357  glutamyl-tRNA synthetase  38.7 
 
 
490 aa  319  7.999999999999999e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  36.88 
 
 
477 aa  318  1e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1293  glutamyl-tRNA synthetase  38.16 
 
 
463 aa  317  2e-85  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  35.94 
 
 
488 aa  316  6e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000204549  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1626  glutamyl-tRNA synthetase  38.35 
 
 
470 aa  316  7e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0744892  normal  0.201462 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0083  glutamyl-tRNA synthetase  37.45 
 
 
488 aa  315  9.999999999999999e-85  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.452446  hitchhiker  0.000158184 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  36.38 
 
 
486 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0184  glutamyl-tRNA synthetase  35.26 
 
 
480 aa  313  2.9999999999999996e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.527143 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1480  glutamyl-tRNA synthetase  37.76 
 
 
463 aa  313  4.999999999999999e-84  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.499307  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  37.39 
 
 
485 aa  312  6.999999999999999e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  37.86 
 
 
480 aa  312  9e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  35.62 
 
 
467 aa  311  2e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000050225  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1274  glutamyl-tRNA synthetase  35.79 
 
 
472 aa  311  2e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  35.16 
 
 
494 aa  311  2e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1305  glutamyl-tRNA synthetase  36.76 
 
 
463 aa  310  2.9999999999999997e-83  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0584  glutamyl-tRNA synthetase  36.06 
 
 
466 aa  310  5e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0242919  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  35.89 
 
 
467 aa  309  5.9999999999999995e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0584  glutamyl-tRNA synthetase  34.99 
 
 
466 aa  309  6.999999999999999e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.779579  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2346  glutamyl-tRNA synthetase  36.4 
 
 
483 aa  309  6.999999999999999e-83  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0066812  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0422  glutamyl-tRNA synthetase  34.99 
 
 
466 aa  309  6.999999999999999e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869081  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0168  glutamyl-tRNA synthetase  36.99 
 
 
484 aa  308  1.0000000000000001e-82  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  35.32 
 
 
467 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0434  glutamyl-tRNA synthetase  37.13 
 
 
463 aa  308  1.0000000000000001e-82  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1604  glutamyl-tRNA synthetase  38.17 
 
 
465 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161822  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49888  predicted protein  35.61 
 
 
546 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.757825  normal  0.413505 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0670  glutamyl-tRNA synthetase  38.36 
 
 
464 aa  307  3e-82  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.418683  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0075  glutamyl-tRNA synthetase  36.8 
 
 
464 aa  306  5.0000000000000004e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1793  glutamyl-tRNA synthetase  37.47 
 
 
484 aa  306  6e-82  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0101164  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0548  glutamyl-tRNA synthetase  38.56 
 
 
459 aa  305  9.000000000000001e-82  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.102119  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1409  glutamyl-tRNA synthetase  36.13 
 
 
463 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0264  glutamyl-tRNA synthetase  37.32 
 
 
469 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.530461  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0996  glutamyl-tRNA synthetase  37.42 
 
 
464 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.990972 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1523  glutamyl-tRNA synthetase  36.73 
 
 
474 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.316174  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5036  glutamyl-tRNA synthetase  36.52 
 
 
474 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2538  glutamyl-tRNA synthetase  37.32 
 
 
481 aa  303  3.0000000000000004e-81  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1325  glutamyl-tRNA synthetase  38.74 
 
 
478 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1216  glutamyl-tRNA synthetase  35.93 
 
 
470 aa  303  5.000000000000001e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000500466  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  41.94 
 
 
466 aa  302  8.000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1234  glutamyl-tRNA synthetase  35.45 
 
 
468 aa  302  8.000000000000001e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.966582  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1650  glutamyl-tRNA synthetase  35.23 
 
 
466 aa  302  8.000000000000001e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.93151e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004184  glutamyl-tRNA synthetase  36.59 
 
 
475 aa  302  9e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.926878  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01271  glutamyl-tRNA synthetase  36.38 
 
 
475 aa  301  1e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3484  glutamyl-tRNA synthetase  41.13 
 
 
469 aa  301  2e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  34.34 
 
 
490 aa  300  3e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0564  glutamyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 
484 aa  300  4e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0550  glutamyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 
484 aa  300  4e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0204  glutamyl-tRNA synthetase  33.6 
 
 
506 aa  300  5e-80  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000464542  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2196  glutamyl-tRNA synthetase  35.68 
 
 
463 aa  298  1e-79  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000179412  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2648  glutamyl-tRNA synthetase  35.73 
 
 
464 aa  298  1e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0082  glutamyl-tRNA synthetase  37.68 
 
 
485 aa  298  2e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000052897  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0647  glutamyl-tRNA synthetase  36.31 
 
 
474 aa  298  2e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  35.25 
 
 
495 aa  297  2e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0145  glutamyl-tRNA synthetase  36.99 
 
 
462 aa  296  5e-79  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.092829  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1590  glutamyl-tRNA synthetase  36.27 
 
 
467 aa  296  5e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  unclonable  0.000000281277 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1366  glutamyl-tRNA synthetase  34.66 
 
 
468 aa  296  5e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000255518  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0082  glutamyl-tRNA synthetase  36.92 
 
 
485 aa  296  6e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000167432  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0051  glutamyl-tRNA synthetase / glutamate--tRNA(Gln) ligase  34.59 
 
 
518 aa  296  7e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1806  glutamyl-tRNA synthetase  34.5 
 
 
509 aa  295  1e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1579  glutamyl-tRNA synthetase  34.76 
 
 
470 aa  295  1e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.496089  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1302  glutamyl-tRNA synthetase  35.07 
 
 
471 aa  295  1e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2043  glutamyl-tRNA synthetase  36.9 
 
 
473 aa  295  2e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0696  glutamyl-tRNA synthetase  40.94 
 
 
463 aa  295  2e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.69774  normal  0.269454 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1201  glutamyl-tRNA synthetase  36.99 
 
 
501 aa  294  3e-78  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000196599  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0113  glutamyl-tRNA synthetase  35.1 
 
 
484 aa  294  3e-78  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000311302  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0108  glutamyl-tRNA synthetase  35.87 
 
 
491 aa  294  3e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000769227  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1892  glutamyl-tRNA synthetase  36.34 
 
 
473 aa  294  3e-78  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1410  glutamyl-tRNA synthetase  34.14 
 
 
473 aa  294  3e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.999682  normal  0.435226 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0098  glutamyl-tRNA synthetase  35.44 
 
 
491 aa  293  6e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.11563e-60 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1396  glutamyl-tRNA synthetase  38.48 
 
 
479 aa  292  7e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00644149 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  36.11 
 
 
491 aa  292  8e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0683  glutamyl-tRNA synthetase  35.44 
 
 
467 aa  292  9e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0298  glutamyl-tRNA synthetase  36.14 
 
 
469 aa  292  1e-77  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1105  glutamyl-tRNA synthetase  35.64 
 
 
473 aa  291  1e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0321  glutamyl-tRNA synthetase  36.38 
 
 
498 aa  291  1e-77  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>