More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4941 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4941  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  100 
 
 
293 aa  579  1e-164  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5029  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  100 
 
 
293 aa  579  1e-164  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5322  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  97.27 
 
 
293 aa  562  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1233  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  80.14 
 
 
296 aa  463  1e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.447568  normal  0.0288811 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5575  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  79.18 
 
 
310 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.861555  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0414  Glutamate--tRNA ligase  61.36 
 
 
309 aa  353  2e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3985  glutamate--tRNA ligase  61.02 
 
 
298 aa  335  5e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0570  Glutamate--tRNA ligase  62.58 
 
 
319 aa  330  1e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3764  Glutamate--tRNA ligase  60 
 
 
297 aa  329  3e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4042  Glutamate--tRNA ligase  65.26 
 
 
285 aa  323  2e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02060  glutamyl- or glutaminyl-tRNA synthetase  61.09 
 
 
311 aa  318  9e-86  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4726  Glutamate--tRNA ligase  52.98 
 
 
316 aa  263  3e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0696299  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02670  glutamyl- or glutaminyl-tRNA synthetase  50 
 
 
328 aa  244  8e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.374446  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0306  Glutamate--tRNA ligase  47.77 
 
 
323 aa  223  4e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0295  glutamate--tRNA ligase  46.5 
 
 
323 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.436066  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0317  Glutamate--tRNA ligase  46.18 
 
 
323 aa  211  9e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3073  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  48.19 
 
 
310 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0319  glutamate--tRNA ligase  50.19 
 
 
337 aa  199  5e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.468556  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07310  glutamyl- or glutaminyl-tRNA synthetase  45.45 
 
 
318 aa  198  9e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1769  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  41.5 
 
 
331 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1188  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  45.07 
 
 
310 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0787184 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1332  Glutamate--tRNA ligase  43.53 
 
 
311 aa  197  2.0000000000000003e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000257577  decreased coverage  0.00027046 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13470  glutamyl- or glutaminyl-tRNA synthetase  46.5 
 
 
317 aa  197  2.0000000000000003e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.301512  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0947  Glutamate--tRNA ligase  45.42 
 
 
313 aa  195  6e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.507725  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2226  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  44.27 
 
 
311 aa  195  9e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000178146  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2698  glutamyl- and glutaminyl- tRNA synthetase  44.37 
 
 
311 aa  192  4e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000386478  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1780  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  45.1 
 
 
314 aa  192  6e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.234416 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1586  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  41.98 
 
 
313 aa  190  2.9999999999999997e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.384476  normal  0.0681988 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0867  Glutamate--tRNA ligase  43.17 
 
 
327 aa  188  1e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0334  Glutamate--tRNA ligase  39.34 
 
 
373 aa  187  2e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.374336 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3484  glutamyl-tRNA synthetase  37.83 
 
 
469 aa  186  3e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2714  glutamyl-tRNA synthetase  39.84 
 
 
469 aa  186  4e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000169422  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1396  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  43.14 
 
 
334 aa  185  7e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.535698  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1329  tRNA synthetase class I domain-containing protein  45.2 
 
 
314 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  36.13 
 
 
495 aa  183  4.0000000000000006e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5440  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  40.67 
 
 
293 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2533  glutamyl-tRNA synthetase  39.6 
 
 
473 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000038789  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1031  glutamate--tRNA ligase  43.49 
 
 
283 aa  181  1e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2709  glutamyl-tRNA synthetase  40.86 
 
 
301 aa  181  2e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.63084  normal  0.578011 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62510  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  40.33 
 
 
293 aa  180  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.632499  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3769  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  42.81 
 
 
301 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0219396 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  33.44 
 
 
479 aa  179  4e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3371  glutamate--tRNA ligase  40.53 
 
 
309 aa  179  4e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0584  glutamyl-tRNA synthetase  41.04 
 
 
466 aa  178  8e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.779579  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0422  glutamyl-tRNA synthetase  41.04 
 
 
466 aa  178  8e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869081  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2499  glutamyl-tRNA synthetase  38.8 
 
 
469 aa  177  1e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000172182  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2196  glutamyl-tRNA synthetase  36.12 
 
 
463 aa  177  2e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000179412  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1365  glutamyl-tRNA synthetase  39.84 
 
 
469 aa  177  2e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000124879  normal  0.0325353 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1430  glutamyl-tRNA synthetase  39.84 
 
 
469 aa  177  2e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000061517  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3450  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  40.33 
 
 
330 aa  177  2e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1418  glutamyl-tRNA synthetase  39.84 
 
 
469 aa  177  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000145575  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0814  glutamyl-tRNA synthetase  38.19 
 
 
468 aa  176  3e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.407873  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1302  glutamyl-tRNA synthetase  38.31 
 
 
535 aa  176  4e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4692  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  42.51 
 
 
295 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000687127 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1274  glutamyl-tRNA synthetase  37.85 
 
 
472 aa  176  4e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1554  glutamyl-tRNA synthetase  39.84 
 
 
469 aa  176  5e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000003282  normal  0.0351282 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4805  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  44.08 
 
 
298 aa  176  5e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0167775  hitchhiker  0.00700115 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  37.42 
 
 
494 aa  176  5e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2802  glutamyl-tRNA synthetase  39.84 
 
 
469 aa  176  5e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000260001  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2822  glutamyl-tRNA synthetase  39.84 
 
 
469 aa  176  5e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000059188  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2947  glutamyl-tRNA synthetase  39.84 
 
 
469 aa  176  5e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000528448  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4694  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  42.5 
 
 
300 aa  175  6e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.958357  hitchhiker  0.000909372 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1728  glutamyl-tRNA synthetase  38 
 
 
469 aa  176  6e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000433955  normal  0.283148 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2004  glutamyl-tRNA synthetase  41.54 
 
 
329 aa  176  6e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.266458  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4558  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  42.5 
 
 
300 aa  175  7e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000548174 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  32.69 
 
 
485 aa  175  8e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1449  glutamyl-tRNA synthetase  38.4 
 
 
469 aa  175  9e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000565413  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2210  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  41.45 
 
 
315 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.895513  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  32.78 
 
 
477 aa  174  9.999999999999999e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2648  glutamyl-tRNA synthetase  41.87 
 
 
464 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1302  glutamyl-tRNA synthetase  39.2 
 
 
471 aa  174  9.999999999999999e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2906  glutamyl-tRNA synthetase  38 
 
 
469 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000836575  normal  0.409064 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2408  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  41.09 
 
 
314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0145  glutamyl-tRNA synthetase  36.21 
 
 
462 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.092829  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1023  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  45.49 
 
 
303 aa  174  1.9999999999999998e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.202098  hitchhiker  0.00000345941 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2014  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  40.07 
 
 
311 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1456  glutamyl-tRNA synthetase  37.85 
 
 
469 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000100274  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0740  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  42.08 
 
 
295 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000657167 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3343  Glutamate--tRNA ligase  38.58 
 
 
338 aa  172  3.9999999999999995e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.533309  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0504  glutamyl-tRNA synthetase  39.16 
 
 
504 aa  172  3.9999999999999995e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0630842  normal  0.758869 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  38.8 
 
 
467 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2207  glutamyl-tRNA synthetase  38.65 
 
 
469 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000288711  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  37.45 
 
 
491 aa  172  5e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0797  glutamate--tRNA ligase  40.82 
 
 
303 aa  172  5e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000376322  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1109  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  42.52 
 
 
299 aa  172  5e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0456  glutamyl-tRNA synthetase  33.6 
 
 
466 aa  172  5e-42  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2919  glutamyl-tRNA synthetase  36.4 
 
 
469 aa  172  5e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000159151  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3586  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  43.55 
 
 
294 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42650  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  40.82 
 
 
298 aa  172  5.999999999999999e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.404894  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0584  glutamyl-tRNA synthetase  35.5 
 
 
466 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0242919  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5223  glutamyl-tRNA synthetase  39.66 
 
 
474 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.142944  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1579  glutamyl-tRNA synthetase  39.2 
 
 
470 aa  172  6.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.496089  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  38.8 
 
 
467 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000050225  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3469  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  42.11 
 
 
394 aa  171  9e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000116518  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2798  glutamyl-tRNA synthetase  37.05 
 
 
472 aa  171  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0783891  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4681  glutamyl-tRNA synthetase  39.66 
 
 
474 aa  171  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0298  glutamyl-tRNA synthetase  35.1 
 
 
469 aa  171  1e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4720  glutamate--tRNA ligase  42.21 
 
 
292 aa  171  1e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.943988  normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1892  glutamyl-tRNA synthetase  35.1 
 
 
473 aa  171  1e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1055  glutamyl-tRNA synthetase  37.85 
 
 
471 aa  171  1e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.291926  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>