More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3840 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_3840  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  100 
 
 
315 aa  632  1e-180  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4885  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  59.93 
 
 
291 aa  323  3e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.763811  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1647  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  56.55 
 
 
291 aa  320  1.9999999999999998e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1270  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  55.52 
 
 
291 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1594  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  56.55 
 
 
291 aa  320  1.9999999999999998e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1135  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  56.9 
 
 
289 aa  319  5e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3026  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  56.55 
 
 
295 aa  315  6e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.65346  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5237  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  55.99 
 
 
293 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0814  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  57.39 
 
 
293 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0121184  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2526  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  55.29 
 
 
297 aa  301  1e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.451286 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0748  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  55.63 
 
 
290 aa  299  4e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3486  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  55.17 
 
 
290 aa  299  4e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0925  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  55.52 
 
 
293 aa  298  7e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1152  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  56.21 
 
 
296 aa  293  3e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3555  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  51.48 
 
 
293 aa  281  7.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.346556  normal  0.959624 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0957  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  55.09 
 
 
304 aa  276  3e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.800313  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0433  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  50.84 
 
 
300 aa  268  1e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.245472 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3286  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  50.67 
 
 
296 aa  267  2e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0410237 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4004  glutamyl-tRNA Synthetase  51.04 
 
 
300 aa  266  2.9999999999999995e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3848  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  50.69 
 
 
293 aa  265  7e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1847  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  55.05 
 
 
294 aa  265  1e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978391  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1631  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  49.83 
 
 
300 aa  265  1e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1025  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  56.9 
 
 
297 aa  264  2e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.255521 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2391  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  53.1 
 
 
280 aa  261  1e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00564055 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4877  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  57.24 
 
 
279 aa  259  4e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.284735  normal  0.0736778 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3652  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  48.44 
 
 
288 aa  251  1e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3734  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  50.17 
 
 
293 aa  250  2e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2353  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  46.88 
 
 
278 aa  239  4e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.930617  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3205  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  48.77 
 
 
279 aa  238  9e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.572919  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3110  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  51.39 
 
 
284 aa  233  3e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.599577 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1491  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  44.1 
 
 
281 aa  227  2e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.88267  normal  0.107951 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1325  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  52.36 
 
 
281 aa  226  3e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1393  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  44.22 
 
 
282 aa  225  9e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2500  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  46.18 
 
 
294 aa  224  2e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.296852 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3242  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  49.29 
 
 
302 aa  222  6e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.533395  normal  0.726961 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1164  glutamate--tRNA ligase  48.61 
 
 
276 aa  220  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.647916  normal  0.361604 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1285  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  48.25 
 
 
277 aa  218  7e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.442309 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2628  glutamyl-/ glutaminyl-tRNA synthetase  46.55 
 
 
277 aa  212  7e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1474  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  47.14 
 
 
287 aa  206  5e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.104503  normal  0.08026 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4079  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  44.71 
 
 
281 aa  197  3e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.688664 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3084  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  46.3 
 
 
287 aa  192  4e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.852004  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0551  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  43.97 
 
 
281 aa  176  4e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4602  glutamyl-tRNA synthetase  41.38 
 
 
447 aa  163  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12827  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1332  Glutamate--tRNA ligase  35.79 
 
 
311 aa  160  2e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000257577  decreased coverage  0.00027046 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1031  glutamate--tRNA ligase  41.61 
 
 
283 aa  160  4e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06791  glutamyl-tRNA synthetase  36.33 
 
 
476 aa  157  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4722  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  38.83 
 
 
458 aa  157  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.118395 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2622  glutamyl-tRNA synthetase  40.56 
 
 
447 aa  155  7e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.179612 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1329  tRNA synthetase class I domain-containing protein  40.36 
 
 
314 aa  155  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1535  glutamyl-tRNA synthetase  36.71 
 
 
456 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2934  glutamate--tRNA ligase  39.1 
 
 
327 aa  152  8e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0900886  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0306  Glutamate--tRNA ligase  38.93 
 
 
323 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0641  glutamyl-tRNA synthetase  37.04 
 
 
477 aa  150  3e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1396  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  35.78 
 
 
334 aa  149  7e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.535698  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0982  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  39.93 
 
 
297 aa  149  8e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5295  glutamyl-tRNA synthetase  38.95 
 
 
449 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.676196 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4726  Glutamate--tRNA ligase  38.46 
 
 
316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0696299  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04741  glutamyl-tRNA synthetase  34.01 
 
 
492 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.633658  normal  0.679149 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0317  Glutamate--tRNA ligase  38.72 
 
 
323 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05371  glutamyl-tRNA synthetase  34.72 
 
 
493 aa  147  3e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0962  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  39.35 
 
 
298 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.294785  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0900  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  37.21 
 
 
301 aa  145  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2900  glutamate--tRNA ligase  40.07 
 
 
302 aa  144  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0201877  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4753  glutamyl-tRNA synthetase  38.25 
 
 
449 aa  145  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0295087  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3764  Glutamate--tRNA ligase  38.41 
 
 
297 aa  144  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1915  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  39.19 
 
 
297 aa  144  3e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00194048  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1353  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  39.19 
 
 
297 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0672559  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1195  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  39.19 
 
 
297 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0519068  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0827  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  39.19 
 
 
297 aa  144  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.292279  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2275  glutamyl-tRNA synthetase  34.49 
 
 
441 aa  144  3e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.845682  normal  0.24806 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0690  glutamate--tRNA ligase  40.34 
 
 
300 aa  144  3e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.858834 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1041  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  39.19 
 
 
297 aa  144  3e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.512398  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04981  glutamyl-tRNA synthetase  32.64 
 
 
476 aa  143  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.475242  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1203  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  39.19 
 
 
297 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.603954  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0324  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  39.19 
 
 
297 aa  144  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.171328  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2098  glutamyl-tRNA synthetase  34.72 
 
 
457 aa  143  4e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00800716  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1780  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  37.73 
 
 
314 aa  143  4e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.234416 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2081  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  38.49 
 
 
294 aa  143  5e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178855  normal  0.145424 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2581  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  36.09 
 
 
310 aa  142  5e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.457948 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3126  Glutamate--tRNA ligase  38.93 
 
 
307 aa  142  7e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.216069  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0884  glutamyl-tRNA synthetase  35.19 
 
 
441 aa  142  9e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0428129  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1016  glutamyl-tRNA synthetase  34.38 
 
 
457 aa  141  9.999999999999999e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0983  glutamyl-tRNA synthetase  34.38 
 
 
459 aa  142  9.999999999999999e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05281  glutamyl-tRNA synthetase  32.64 
 
 
476 aa  141  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0473  glutamyl-tRNA synthetase  32.64 
 
 
479 aa  141  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.138189  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1951  glutamyl-tRNA synthetase  35.57 
 
 
486 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0884384  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3196  glutamyl-tRNA synthetase  35.42 
 
 
482 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3674  glutamyl-tRNA synthetase  36.43 
 
 
450 aa  141  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.351322  normal  0.059122 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2250  glutamyl-tRNA synthetase  35.05 
 
 
472 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.000000000347292  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0947  Glutamate--tRNA ligase  37.41 
 
 
313 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.507725  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1586  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  35.93 
 
 
313 aa  141  1.9999999999999998e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.384476  normal  0.0681988 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07310  glutamyl- or glutaminyl-tRNA synthetase  34.12 
 
 
318 aa  140  3e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3294  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  38.18 
 
 
296 aa  140  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0867  Glutamate--tRNA ligase  36.3 
 
 
327 aa  140  3.9999999999999997e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1719  glutamyl-tRNA synthetase  35.33 
 
 
477 aa  139  6e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1703  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  37.55 
 
 
298 aa  139  6e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2315  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  37.55 
 
 
298 aa  139  6e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1865  glutamyl-tRNA synthetase  32.44 
 
 
478 aa  139  7e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0276078  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2709  glutamyl-tRNA synthetase  37.41 
 
 
301 aa  139  8.999999999999999e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.63084  normal  0.578011 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1984  glutamyl-tRNA synthetase  33.55 
 
 
469 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434285  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>