More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_0324 on replicon NC_009080
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009080  BMA10247_0324  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  100 
 
 
297 aa  589  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.171328  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1915  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  100 
 
 
297 aa  589  1e-167  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00194048  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1203  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  100 
 
 
297 aa  589  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.603954  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1353  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  100 
 
 
297 aa  589  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0672559  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1195  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  100 
 
 
297 aa  589  1e-167  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0519068  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1041  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  100 
 
 
297 aa  589  1e-167  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.512398  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0827  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  100 
 
 
297 aa  589  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.292279  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0982  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  95.61 
 
 
297 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0962  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  83.22 
 
 
298 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.294785  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1703  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  83.28 
 
 
298 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2315  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  83.28 
 
 
298 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2338  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  82.25 
 
 
298 aa  448  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0246272 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3294  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  78.28 
 
 
296 aa  450  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2081  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  77.32 
 
 
294 aa  449  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178855  normal  0.145424 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2234  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  82.53 
 
 
294 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5657  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  82.43 
 
 
297 aa  442  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1251  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  77.59 
 
 
296 aa  442  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.540986  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2354  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  82.43 
 
 
297 aa  436  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0532352  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0900  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  72.76 
 
 
301 aa  380  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2581  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  67.47 
 
 
310 aa  374  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.457948 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2408  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  63.76 
 
 
314 aa  371  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2014  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  64.16 
 
 
311 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2210  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  65.41 
 
 
315 aa  369  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.895513  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2934  glutamate--tRNA ligase  59.59 
 
 
327 aa  312  3.9999999999999997e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0900886  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2904  glutamate--tRNA ligase  54.72 
 
 
338 aa  306  3e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.437681  normal  0.870267 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4049  glutamate--tRNA ligase  60.64 
 
 
312 aa  304  1.0000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.963278  normal  0.0953958 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1905  glutamate--tRNA ligase  55.13 
 
 
309 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0217385  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2900  glutamate--tRNA ligase  58.9 
 
 
302 aa  291  9e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0201877  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0690  glutamate--tRNA ligase  57.14 
 
 
300 aa  291  9e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.858834 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4720  glutamate--tRNA ligase  57.14 
 
 
292 aa  290  2e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.943988  normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3126  Glutamate--tRNA ligase  59.03 
 
 
307 aa  289  4e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.216069  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1782  Glutamate--tRNA ligase  52.7 
 
 
323 aa  285  5e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1982  glutamate--tRNA ligase  55.71 
 
 
323 aa  284  1.0000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.193008  normal  0.926165 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1031  glutamate--tRNA ligase  60.84 
 
 
283 aa  281  1e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1109  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  62.6 
 
 
299 aa  278  6e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3769  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  60.98 
 
 
301 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0219396 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0797  glutamate--tRNA ligase  51.19 
 
 
303 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000376322  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0605  glutamate--tRNA ligase  49.17 
 
 
316 aa  267  1e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3032  glutamate--tRNA ligase  54.71 
 
 
335 aa  266  4e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.490403  normal  0.333291 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2698  glutamyl- and glutaminyl- tRNA synthetase  51.22 
 
 
311 aa  260  2e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000386478  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3639  Glutamate--tRNA ligase  61.36 
 
 
318 aa  256  3e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.917927  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2709  glutamyl-tRNA synthetase  57.38 
 
 
301 aa  251  1e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.63084  normal  0.578011 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00405  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  55.34 
 
 
299 aa  244  9e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1329  tRNA synthetase class I domain-containing protein  56.56 
 
 
314 aa  242  6e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2749  Glutamate--tRNA ligase  52.82 
 
 
306 aa  242  7e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.242915  normal  0.441865 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2226  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  50.18 
 
 
311 aa  238  1e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000178146  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3586  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  50.5 
 
 
294 aa  237  1e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1780  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  52.87 
 
 
314 aa  237  2e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.234416 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3371  glutamate--tRNA ligase  52.1 
 
 
309 aa  232  5e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4558  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  51.25 
 
 
300 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000548174 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1188  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  52.46 
 
 
310 aa  230  2e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0787184 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0740  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  46.26 
 
 
295 aa  229  3e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000657167 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1882  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  52.24 
 
 
295 aa  229  4e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62510  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  50.77 
 
 
293 aa  228  6e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.632499  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4694  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  50.83 
 
 
300 aa  228  8e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.958357  hitchhiker  0.000909372 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5440  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  50.58 
 
 
293 aa  228  8e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4692  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  50.83 
 
 
295 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000687127 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3073  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  50 
 
 
310 aa  226  3e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42650  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  50.38 
 
 
298 aa  226  4e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.404894  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0922  glutamate--tRNA ligase  48.68 
 
 
300 aa  225  7e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0518  glutamyl-tRNA synthetase domain-containing protein  47.49 
 
 
302 aa  223  3e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0676  glutamate--tRNA ligase  52.67 
 
 
310 aa  223  3e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0583  glutamate--tRNA ligase  45.04 
 
 
308 aa  223  3e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4805  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  51.22 
 
 
298 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0167775  hitchhiker  0.00700115 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0834  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  46.76 
 
 
295 aa  218  7e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00133315 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0967  glutamyl-tRNA synthetase-related protein  46.94 
 
 
295 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3061  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  51.39 
 
 
291 aa  217  2e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.293014  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0947  Glutamate--tRNA ligase  48.21 
 
 
313 aa  216  5e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.507725  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0306  Glutamate--tRNA ligase  50.77 
 
 
323 aa  215  7e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3373  glutamate--tRNA ligase  48.88 
 
 
298 aa  214  9.999999999999999e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0303473 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3115  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  44.56 
 
 
352 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000632224  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002564  glutamyl-Q-tRNA synthetase  44.2 
 
 
287 aa  213  2.9999999999999995e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000502231  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1163  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  44.06 
 
 
322 aa  210  3e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0216761  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4307  tRNA synthetase class I family protein  42.3 
 
 
315 aa  209  5e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07310  glutamyl- or glutaminyl-tRNA synthetase  46.48 
 
 
318 aa  209  6e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0848  glutamate--tRNA ligase  44.4 
 
 
304 aa  207  1e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000166391  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3171  glutamate--tRNA ligase  44.37 
 
 
287 aa  208  1e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000837027  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4012  glutamate--tRNA ligase  41.46 
 
 
299 aa  207  2e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000166236  normal  0.954035 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0779  glutamyl-tRNA synthetase domain-containing protein  43.96 
 
 
290 aa  205  7e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00289158  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0873  glutamyl-tRNA synthetase domain-containing protein  45.45 
 
 
299 aa  204  1e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3491  glutamate--tRNA ligase  44.03 
 
 
304 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000545607  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3986  glutamate--tRNA ligase  46.56 
 
 
303 aa  204  2e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000239485  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3339  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  46.01 
 
 
321 aa  204  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000626145  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0317  Glutamate--tRNA ligase  50 
 
 
323 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0135  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  43.9 
 
 
308 aa  204  2e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000952983  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0871  Glutamate--tRNA ligase  44.03 
 
 
304 aa  203  3e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000393825  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0155  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  43.21 
 
 
308 aa  203  3e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000330797  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0673  glutamate--tRNA ligase  47.21 
 
 
305 aa  203  3e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.930403  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3458  Glutamate--tRNA ligase  45.83 
 
 
308 aa  202  4e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000233336  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0147  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  45.83 
 
 
308 aa  202  4e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000535998  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0883  glutamate--tRNA ligase  43.4 
 
 
304 aa  202  5e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000349981  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0697  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  44.7 
 
 
292 aa  202  5e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000088618  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0729  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  44.32 
 
 
299 aa  202  5e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000294668  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0148  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  45.83 
 
 
308 aa  202  5e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000129858  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0153  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  45.45 
 
 
308 aa  202  6e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000216792  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3799  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  46.59 
 
 
299 aa  202  6e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000213424  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00143  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  45.45 
 
 
308 aa  202  7e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000965107  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00142  hypothetical protein  45.45 
 
 
308 aa  202  7e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000073692  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3515  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  45.45 
 
 
308 aa  202  7e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000809743  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3405  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  43.94 
 
 
299 aa  202  7e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000337292  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>