More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3026 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3026  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  100 
 
 
295 aa  597  1e-170  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.65346  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1647  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  67.35 
 
 
291 aa  408  1e-113  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1594  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  67.01 
 
 
291 aa  405  1.0000000000000001e-112  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1270  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  65.64 
 
 
291 aa  397  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3555  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  63.89 
 
 
293 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.346556  normal  0.959624 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3848  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  62.5 
 
 
293 aa  364  1e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0925  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  61.02 
 
 
293 aa  349  3e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0748  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  59.11 
 
 
290 aa  347  2e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1135  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  61.46 
 
 
289 aa  344  8e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0814  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  60 
 
 
293 aa  343  2e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0121184  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3486  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  60.14 
 
 
290 aa  343  2e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5237  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  59.45 
 
 
293 aa  341  8e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2526  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  58.39 
 
 
297 aa  333  2e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.451286 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4885  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  58.68 
 
 
291 aa  331  8e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.763811  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1631  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  57.73 
 
 
300 aa  328  5.0000000000000004e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4004  glutamyl-tRNA Synthetase  56.6 
 
 
300 aa  317  1e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3840  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  55.97 
 
 
315 aa  310  2.9999999999999997e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3286  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  53.61 
 
 
296 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0410237 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1152  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  53.12 
 
 
296 aa  295  8e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0433  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  52.67 
 
 
300 aa  290  2e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.245472 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1847  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  55.37 
 
 
294 aa  287  1e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978391  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0957  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  54.86 
 
 
304 aa  280  2e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.800313  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2391  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  54.67 
 
 
280 aa  276  3e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00564055 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4877  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  54.98 
 
 
279 aa  275  5e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.284735  normal  0.0736778 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3110  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  52.43 
 
 
284 aa  264  1e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.599577 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3734  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  50.88 
 
 
293 aa  264  1e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1025  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  52.8 
 
 
297 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.255521 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3652  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  48.08 
 
 
288 aa  251  9.000000000000001e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3205  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  47.77 
 
 
279 aa  237  2e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.572919  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1393  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  46.39 
 
 
282 aa  231  8.000000000000001e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2353  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  47.35 
 
 
278 aa  228  8e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.930617  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1474  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  46.21 
 
 
287 aa  226  5.0000000000000005e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.104503  normal  0.08026 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1491  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  42.11 
 
 
281 aa  223  4e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.88267  normal  0.107951 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1285  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  47.28 
 
 
277 aa  219  6e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.442309 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2628  glutamyl-/ glutaminyl-tRNA synthetase  46.74 
 
 
277 aa  217  2e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1164  glutamate--tRNA ligase  47.26 
 
 
276 aa  217  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.647916  normal  0.361604 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2500  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  43.77 
 
 
294 aa  214  1.9999999999999998e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.296852 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4079  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  45.86 
 
 
281 aa  210  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.688664 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1325  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  44.79 
 
 
281 aa  209  4e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3242  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  45.29 
 
 
302 aa  201  9e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.533395  normal  0.726961 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0551  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  44.36 
 
 
281 aa  191  1e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3084  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  45.21 
 
 
287 aa  175  8e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.852004  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06791  glutamyl-tRNA synthetase  36.61 
 
 
476 aa  166  4e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0306  Glutamate--tRNA ligase  38.49 
 
 
323 aa  163  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09840  glutamyl-tRNA synthetase  35.49 
 
 
492 aa  161  1e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.224887 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08460  glutamyl-tRNA synthetase  35.15 
 
 
498 aa  158  9e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.842364  normal  0.487414 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0670  glutamyl-tRNA synthetase  33.79 
 
 
464 aa  157  2e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.418683  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1332  Glutamate--tRNA ligase  35.52 
 
 
311 aa  156  4e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000257577  decreased coverage  0.00027046 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0867  Glutamate--tRNA ligase  37.16 
 
 
327 aa  155  9e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1302  glutamyl-tRNA synthetase  33.79 
 
 
535 aa  154  1e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07310  glutamyl- or glutaminyl-tRNA synthetase  35.86 
 
 
318 aa  154  2e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0641  glutamyl-tRNA synthetase  35.93 
 
 
477 aa  154  2e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0111  glutamyl-tRNA synthetase  33.1 
 
 
462 aa  154  2e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1769  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  34.01 
 
 
331 aa  152  7e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1951  glutamyl-tRNA synthetase  34.62 
 
 
486 aa  151  1e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0884384  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1293  glutamyl-tRNA synthetase  32.42 
 
 
463 aa  150  2e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  34.95 
 
 
467 aa  151  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49888  predicted protein  34.47 
 
 
546 aa  150  2e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.757825  normal  0.413505 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1480  glutamyl-tRNA synthetase  34.98 
 
 
463 aa  150  3e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.499307  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0295  glutamate--tRNA ligase  39.18 
 
 
323 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.436066  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1305  glutamyl-tRNA synthetase  34.98 
 
 
463 aa  150  3e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0434  glutamyl-tRNA synthetase  34.98 
 
 
463 aa  150  3e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0242  glutamyl-tRNA synthetase  33.91 
 
 
459 aa  149  4e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0319  glutamate--tRNA ligase  40.89 
 
 
337 aa  149  5e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.468556  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0317  Glutamate--tRNA ligase  36.77 
 
 
323 aa  149  5e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  34.51 
 
 
467 aa  149  6e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000050225  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1396  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  36.18 
 
 
334 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.535698  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2004  glutamyl-tRNA synthetase  33.11 
 
 
329 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.266458  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1562  glutamyl-tRNA synthetase  33.8 
 
 
460 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000571227  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4861  glutamyl-tRNA synthetase  34.8 
 
 
481 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000702508  unclonable  0.000000180865 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  34.95 
 
 
467 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  35.56 
 
 
466 aa  147  3e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1329  tRNA synthetase class I domain-containing protein  36.86 
 
 
314 aa  147  3e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2906  glutamyl-tRNA synthetase  33.22 
 
 
469 aa  147  3e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000836575  normal  0.409064 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04741  glutamyl-tRNA synthetase  33.92 
 
 
492 aa  147  3e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.633658  normal  0.679149 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4726  Glutamate--tRNA ligase  38.28 
 
 
316 aa  146  4.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0696299  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1586  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  36.33 
 
 
313 aa  146  4.0000000000000006e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.384476  normal  0.0681988 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2919  glutamyl-tRNA synthetase  32.63 
 
 
469 aa  145  5e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000159151  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0504  glutamyl-tRNA synthetase  33 
 
 
504 aa  145  6e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0630842  normal  0.758869 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0188  glutamate--tRNA(Gln) ligase / glutamyl-tRNA synthetase  34.55 
 
 
881 aa  145  6e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1667  glutamyl-tRNA synthetase  35.07 
 
 
465 aa  145  6e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.194864  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0531  glutamyl-tRNA synthetase  35.07 
 
 
465 aa  145  7.0000000000000006e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0244203  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4602  glutamyl-tRNA synthetase  35.27 
 
 
447 aa  145  9e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12827  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1806  glutamyl-tRNA synthetase  33.45 
 
 
476 aa  145  9e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1449  glutamyl-tRNA synthetase  33.22 
 
 
469 aa  145  9e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000565413  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1590  glutamyl-tRNA synthetase  33.22 
 
 
467 aa  145  9e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  unclonable  0.000000281277 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2250  glutamyl-tRNA synthetase  34.59 
 
 
472 aa  145  1e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.000000000347292  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2900  glutamate--tRNA ligase  39.72 
 
 
302 aa  145  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0201877  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01271  glutamyl-tRNA synthetase  34.28 
 
 
475 aa  145  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2714  glutamyl-tRNA synthetase  33.7 
 
 
469 aa  144  1e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000169422  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0334  Glutamate--tRNA ligase  33.83 
 
 
373 aa  144  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.374336 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3061  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  37.79 
 
 
291 aa  144  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.293014  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05291  glutamyl-tRNA synthetase  34.29 
 
 
492 aa  143  3e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0717874 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1409  glutamyl-tRNA synthetase  34.84 
 
 
463 aa  143  3e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3196  glutamyl-tRNA synthetase  34.45 
 
 
482 aa  143  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0947  Glutamate--tRNA ligase  39.46 
 
 
313 aa  143  4e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.507725  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0145  glutamyl-tRNA synthetase  33.45 
 
 
462 aa  142  6e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.092829  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004184  glutamyl-tRNA synthetase  33.92 
 
 
475 aa  142  6e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.926878  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1719  glutamyl-tRNA synthetase  34.35 
 
 
477 aa  142  8e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3060  glutamyl-tRNA synthetase  34.33 
 
 
481 aa  142  9e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000448328  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>