More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2391 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2391  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  100 
 
 
280 aa  552  1e-156  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00564055 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1152  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  63.29 
 
 
296 aa  328  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0957  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  63.64 
 
 
304 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.800313  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1847  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  61.62 
 
 
294 aa  310  2e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978391  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1025  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  63.64 
 
 
297 aa  296  3e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.255521 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4877  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  64.66 
 
 
279 aa  296  3e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.284735  normal  0.0736778 
 
 
-
 
NC_004310  BR1647  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  55.17 
 
 
291 aa  293  2e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1270  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  55.52 
 
 
291 aa  293  2e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3286  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  56.99 
 
 
296 aa  291  7e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0410237 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1594  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  54.83 
 
 
291 aa  290  2e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0433  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  53.41 
 
 
300 aa  278  7e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.245472 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3026  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  54.67 
 
 
295 aa  276  2e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.65346  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0814  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  54.51 
 
 
293 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0121184  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3110  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  57.25 
 
 
284 aa  266  2.9999999999999995e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.599577 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1135  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  52.76 
 
 
289 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0925  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  53.82 
 
 
293 aa  265  7e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5237  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  52.96 
 
 
293 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4885  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  54.17 
 
 
291 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.763811  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3555  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  48.94 
 
 
293 aa  262  6e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.346556  normal  0.959624 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0748  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  52.28 
 
 
290 aa  261  6e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2526  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  52.48 
 
 
297 aa  261  8.999999999999999e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.451286 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3840  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  53.1 
 
 
315 aa  256  2e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3734  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  52.88 
 
 
293 aa  257  2e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3652  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  51.07 
 
 
288 aa  255  6e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3848  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  49.47 
 
 
293 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3486  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  52.96 
 
 
290 aa  253  3e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1631  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  48.97 
 
 
300 aa  248  5e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4004  glutamyl-tRNA Synthetase  49.47 
 
 
300 aa  246  3e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1325  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  52.17 
 
 
281 aa  235  6e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2353  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  47.33 
 
 
278 aa  232  6e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.930617  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3242  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  51.65 
 
 
302 aa  230  2e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.533395  normal  0.726961 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1285  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  50.71 
 
 
277 aa  224  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.442309 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1491  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  45.62 
 
 
281 aa  223  3e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.88267  normal  0.107951 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2628  glutamyl-/ glutaminyl-tRNA synthetase  49.65 
 
 
277 aa  219  3e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0551  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  49.82 
 
 
281 aa  217  2e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1393  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  46.34 
 
 
282 aa  217  2e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3084  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  51.57 
 
 
287 aa  214  9.999999999999999e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.852004  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3205  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  46.83 
 
 
279 aa  214  9.999999999999999e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.572919  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2500  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  46.33 
 
 
294 aa  213  1.9999999999999998e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.296852 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1164  glutamate--tRNA ligase  47.69 
 
 
276 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.647916  normal  0.361604 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1474  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  48.23 
 
 
287 aa  202  4e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.104503  normal  0.08026 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4079  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  46.88 
 
 
281 aa  201  8e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.688664 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  37.94 
 
 
466 aa  170  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1302  glutamyl-tRNA synthetase  37.72 
 
 
535 aa  170  2e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0306  Glutamate--tRNA ligase  43.86 
 
 
323 aa  168  9e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1586  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  41.61 
 
 
313 aa  166  4e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.384476  normal  0.0681988 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1736  glutamyl-tRNA synthetase  36.52 
 
 
465 aa  165  9e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.872954  normal  0.596825 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1951  glutamyl-tRNA synthetase  38.77 
 
 
486 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0884384  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  37.59 
 
 
467 aa  163  3e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3027  glutamate--tRNA ligase  37.59 
 
 
278 aa  163  3e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.968888  normal  0.390374 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2250  glutamyl-tRNA synthetase  38.78 
 
 
472 aa  163  4.0000000000000004e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.000000000347292  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2648  glutamyl-tRNA synthetase  37.94 
 
 
464 aa  162  6e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2004  glutamyl-tRNA synthetase  41.87 
 
 
329 aa  161  9e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.266458  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08460  glutamyl-tRNA synthetase  36.65 
 
 
498 aa  161  1e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.842364  normal  0.487414 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3450  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  40.07 
 
 
330 aa  160  2e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  35.82 
 
 
467 aa  160  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07310  glutamyl- or glutaminyl-tRNA synthetase  38.99 
 
 
318 aa  160  2e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0641  glutamyl-tRNA synthetase  38.43 
 
 
477 aa  159  4e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0317  Glutamate--tRNA ligase  43.86 
 
 
323 aa  159  5e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  35.11 
 
 
467 aa  159  6e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000050225  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0334  Glutamate--tRNA ligase  37.58 
 
 
373 aa  157  1e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.374336 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1396  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  40.29 
 
 
334 aa  158  1e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.535698  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1769  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  40.21 
 
 
331 aa  157  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06791  glutamyl-tRNA synthetase  36.65 
 
 
476 aa  156  3e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0295  glutamate--tRNA ligase  42.46 
 
 
323 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.436066  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2900  glutamate--tRNA ligase  44.29 
 
 
302 aa  156  4e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0201877  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1031  glutamate--tRNA ligase  41.97 
 
 
283 aa  156  4e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0319  glutamate--tRNA ligase  43.36 
 
 
337 aa  156  4e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.468556  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0690  glutamate--tRNA ligase  43.46 
 
 
300 aa  155  5.0000000000000005e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.858834 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1332  Glutamate--tRNA ligase  35.97 
 
 
311 aa  155  6e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000257577  decreased coverage  0.00027046 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2904  glutamate--tRNA ligase  42.07 
 
 
338 aa  154  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.437681  normal  0.870267 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0184  glutamyl-tRNA synthetase  36.2 
 
 
480 aa  155  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.527143 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13470  glutamyl- or glutaminyl-tRNA synthetase  38.01 
 
 
317 aa  154  1e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.301512  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1650  glutamyl-tRNA synthetase  34.4 
 
 
466 aa  154  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.93151e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1882  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  41 
 
 
295 aa  153  2.9999999999999998e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0996  glutamyl-tRNA synthetase  34.98 
 
 
464 aa  152  4e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.990972 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0670  glutamyl-tRNA synthetase  34.19 
 
 
464 aa  153  4e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.418683  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1234  glutamyl-tRNA synthetase  35.23 
 
 
468 aa  152  5e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.966582  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0192  glutamyl-tRNA synthetase  36.4 
 
 
463 aa  152  5e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0584  glutamyl-tRNA synthetase  35.11 
 
 
466 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0242919  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4726  Glutamate--tRNA ligase  42.21 
 
 
316 aa  152  7e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0696299  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0696  glutamyl-tRNA synthetase  35.34 
 
 
463 aa  152  8e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.69774  normal  0.269454 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0935  glutamyl-tRNA synthetase  39.04 
 
 
468 aa  151  1e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.355577  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0087  tRNA synthetase class I (E and Q), catalytic domain protein  37.2 
 
 
374 aa  151  1e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000462423 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1703  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  40.84 
 
 
298 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2315  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  40.84 
 
 
298 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3484  glutamyl-tRNA synthetase  34.4 
 
 
469 aa  151  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2934  glutamate--tRNA ligase  40.07 
 
 
327 aa  150  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0900886  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2338  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  40.84 
 
 
298 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0246272 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04741  glutamyl-tRNA synthetase  35.11 
 
 
492 aa  150  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.633658  normal  0.679149 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0962  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  41.22 
 
 
298 aa  149  4e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.294785  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1984  glutamyl-tRNA synthetase  38.03 
 
 
469 aa  149  5e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434285  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0075  glutamyl-tRNA synthetase  34.52 
 
 
464 aa  149  6e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09840  glutamyl-tRNA synthetase  34.55 
 
 
492 aa  148  9e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.224887 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1409  glutamyl-tRNA synthetase  36.49 
 
 
463 aa  148  9e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2709  glutamyl-tRNA synthetase  40.61 
 
 
301 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.63084  normal  0.578011 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1905  glutamate--tRNA ligase  37.85 
 
 
309 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0217385  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  32.23 
 
 
479 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1220  glutamyl-tRNA synthetase  38.11 
 
 
469 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000000664891  normal  0.415477 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2234  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  40.84 
 
 
294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>