More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0551 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_0551  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  100 
 
 
281 aa  565  1e-160  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3110  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  53.79 
 
 
284 aa  259  4e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.599577 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3652  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  49.82 
 
 
288 aa  239  4e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3734  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  50.75 
 
 
293 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3084  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  51.25 
 
 
287 aa  232  4.0000000000000004e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.852004  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1491  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  48.29 
 
 
281 aa  228  7e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.88267  normal  0.107951 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1847  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  52.54 
 
 
294 aa  224  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978391  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0748  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  48.72 
 
 
290 aa  223  3e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2391  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  50.36 
 
 
280 aa  223  4e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00564055 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2500  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  45.89 
 
 
294 aa  218  6e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.296852 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0925  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  48.72 
 
 
293 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1285  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  49.64 
 
 
277 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.442309 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1393  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  47.01 
 
 
282 aa  212  4.9999999999999996e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1270  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  47.46 
 
 
291 aa  212  7e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0814  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  47.04 
 
 
293 aa  211  7.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0121184  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2526  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  46.74 
 
 
297 aa  209  3e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.451286 
 
 
-
 
NC_004310  BR1647  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  45.67 
 
 
291 aa  208  9e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2628  glutamyl-/ glutaminyl-tRNA synthetase  48.56 
 
 
277 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3848  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  45.82 
 
 
293 aa  206  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1164  glutamate--tRNA ligase  47.46 
 
 
276 aa  206  4e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.647916  normal  0.361604 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1594  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  45.33 
 
 
291 aa  204  1e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1135  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  45.86 
 
 
289 aa  204  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4877  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  50.76 
 
 
279 aa  202  5e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.284735  normal  0.0736778 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4079  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  45.96 
 
 
281 aa  202  6e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.688664 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1325  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  50.77 
 
 
281 aa  202  7e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1631  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  45.13 
 
 
300 aa  201  9.999999999999999e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5237  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  44.25 
 
 
293 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3486  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  45.77 
 
 
290 aa  199  3e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4885  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  45.79 
 
 
291 aa  199  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.763811  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3555  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  43.64 
 
 
293 aa  198  7.999999999999999e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.346556  normal  0.959624 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0957  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  47.2 
 
 
304 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.800313  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0433  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  43.21 
 
 
300 aa  197  1.0000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.245472 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3026  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  44.36 
 
 
295 aa  196  3e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.65346  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3242  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  47.62 
 
 
302 aa  194  1e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.533395  normal  0.726961 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3286  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  44.24 
 
 
296 aa  194  2e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0410237 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1152  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  44.41 
 
 
296 aa  192  4e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1474  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  44.8 
 
 
287 aa  191  9e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.104503  normal  0.08026 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4004  glutamyl-tRNA Synthetase  43.26 
 
 
300 aa  189  2.9999999999999997e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3205  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  44.61 
 
 
279 aa  187  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.572919  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3840  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  43.97 
 
 
315 aa  186  4e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2353  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  40.45 
 
 
278 aa  173  3.9999999999999995e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.930617  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1031  glutamate--tRNA ligase  44.8 
 
 
283 aa  170  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1025  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  44.76 
 
 
297 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.255521 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0797  glutamate--tRNA ligase  40.42 
 
 
303 aa  166  4e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000376322  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0676  glutamate--tRNA ligase  42.47 
 
 
310 aa  165  8e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0306  Glutamate--tRNA ligase  40.86 
 
 
323 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07310  glutamyl- or glutaminyl-tRNA synthetase  41.04 
 
 
318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2226  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  39.84 
 
 
311 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000178146  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1023  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  41.11 
 
 
303 aa  161  1e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.202098  hitchhiker  0.00000345941 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2698  glutamyl- and glutaminyl- tRNA synthetase  39.02 
 
 
311 aa  160  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000386478  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0317  Glutamate--tRNA ligase  40.07 
 
 
323 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1109  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  40.7 
 
 
299 aa  160  3e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3061  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  42.04 
 
 
291 aa  160  3e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.293014  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1188  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  38.7 
 
 
310 aa  159  4e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0787184 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1780  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  39.7 
 
 
314 aa  157  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.234416 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1329  tRNA synthetase class I domain-containing protein  40.15 
 
 
314 aa  157  3e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3073  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  37.74 
 
 
310 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0947  Glutamate--tRNA ligase  38.04 
 
 
313 aa  154  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.507725  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2900  glutamate--tRNA ligase  41.6 
 
 
302 aa  155  1e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0201877  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0962  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  43.09 
 
 
298 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.294785  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0295  glutamate--tRNA ligase  40.29 
 
 
323 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.436066  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2014  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  40.81 
 
 
311 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1882  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  41.06 
 
 
295 aa  154  2e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2081  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  42.04 
 
 
294 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178855  normal  0.145424 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1332  Glutamate--tRNA ligase  37.6 
 
 
311 aa  153  2.9999999999999998e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000257577  decreased coverage  0.00027046 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3294  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  42.11 
 
 
296 aa  152  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1586  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  39.68 
 
 
313 aa  152  7e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.384476  normal  0.0681988 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2709  glutamyl-tRNA synthetase  39.44 
 
 
301 aa  151  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.63084  normal  0.578011 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1251  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  40.82 
 
 
296 aa  151  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.540986  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1703  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  41.87 
 
 
298 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2338  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  41.46 
 
 
298 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0246272 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2315  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  41.87 
 
 
298 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2408  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  42 
 
 
314 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3027  glutamate--tRNA ligase  37.83 
 
 
278 aa  150  3e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.968888  normal  0.390374 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5657  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  41.06 
 
 
297 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0927  glutamyl-tRNA synthetase-related protein  41.13 
 
 
296 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1046  Glutamate--tRNA ligase  41.13 
 
 
296 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244442 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3373  glutamate--tRNA ligase  38.87 
 
 
298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0303473 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4726  Glutamate--tRNA ligase  42.19 
 
 
316 aa  146  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0696299  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2234  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  42.17 
 
 
294 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1915  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  41.25 
 
 
297 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00194048  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1353  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  41.25 
 
 
297 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0672559  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0324  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  41.25 
 
 
297 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.171328  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0827  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  41.25 
 
 
297 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.292279  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1203  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  41.25 
 
 
297 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.603954  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1195  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  41.25 
 
 
297 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0519068  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1041  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  41.25 
 
 
297 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.512398  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2648  glutamyl-tRNA synthetase  38.82 
 
 
464 aa  145  9e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0690  glutamate--tRNA ligase  38.41 
 
 
300 aa  144  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.858834 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2210  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  41.2 
 
 
315 aa  144  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.895513  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3126  Glutamate--tRNA ligase  41.41 
 
 
307 aa  145  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.216069  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3769  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  39.38 
 
 
301 aa  143  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0219396 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1396  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  38.2 
 
 
334 aa  143  3e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.535698  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4720  glutamate--tRNA ligase  38.78 
 
 
292 aa  142  4e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.943988  normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1409  glutamyl-tRNA synthetase  36.86 
 
 
463 aa  142  5e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0982  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  41.67 
 
 
297 aa  142  6e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0605  glutamate--tRNA ligase  36.95 
 
 
316 aa  142  8e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2934  glutamate--tRNA ligase  38.27 
 
 
327 aa  141  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0900886  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2581  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  42.04 
 
 
310 aa  141  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.457948 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2388  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  37.45 
 
 
294 aa  141  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.126082  normal  0.583593 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>