More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3027 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3027  glutamate--tRNA ligase  100 
 
 
278 aa  574  1.0000000000000001e-163  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.968888  normal  0.390374 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2388  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  55.4 
 
 
294 aa  307  1.0000000000000001e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.126082  normal  0.583593 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0306  Glutamate--tRNA ligase  47.9 
 
 
323 aa  239  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0317  Glutamate--tRNA ligase  48.56 
 
 
323 aa  235  7e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0295  glutamate--tRNA ligase  47.55 
 
 
323 aa  234  8e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.436066  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0319  glutamate--tRNA ligase  51.45 
 
 
337 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.468556  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1396  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  47.16 
 
 
334 aa  231  1e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.535698  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2004  glutamyl-tRNA synthetase  46.69 
 
 
329 aa  228  1e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.266458  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3450  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  44.49 
 
 
330 aa  217  1e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1769  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  48.15 
 
 
331 aa  216  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1325  glutamyl-tRNA synthetase  43.43 
 
 
478 aa  214  9.999999999999999e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1876  glutamyl-tRNA synthetase  45.68 
 
 
482 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000140035  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2222  glutamyl-tRNA synthetase  45.68 
 
 
508 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.493461  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0935  glutamyl-tRNA synthetase  42.7 
 
 
468 aa  210  2e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.355577  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0867  Glutamate--tRNA ligase  47.08 
 
 
327 aa  208  1e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0334  Glutamate--tRNA ligase  39.81 
 
 
373 aa  207  1e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.374336 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2250  glutamyl-tRNA synthetase  40.88 
 
 
472 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.000000000347292  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0108  glutamyl-tRNA synthetase  39.86 
 
 
477 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  39.78 
 
 
482 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3343  Glutamate--tRNA ligase  41.37 
 
 
338 aa  195  6e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.533309  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2538  glutamyl-tRNA synthetase  37.14 
 
 
481 aa  195  7e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1332  Glutamate--tRNA ligase  41.24 
 
 
311 aa  194  2e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000257577  decreased coverage  0.00027046 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  37.91 
 
 
485 aa  191  8e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2357  glutamyl-tRNA synthetase  37.46 
 
 
490 aa  191  1e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0510  glutamyl-tRNA synthetase  38.57 
 
 
466 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1264  glutamyl-tRNA synthetase  40.36 
 
 
471 aa  189  5e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  37.09 
 
 
485 aa  187  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  38.08 
 
 
494 aa  187  2e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49888  predicted protein  38.83 
 
 
546 aa  187  2e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.757825  normal  0.413505 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  38.32 
 
 
488 aa  187  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000204549  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0670  glutamyl-tRNA synthetase  37.64 
 
 
464 aa  186  4e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.418683  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08460  glutamyl-tRNA synthetase  39.57 
 
 
498 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.842364  normal  0.487414 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0531  glutamyl-tRNA synthetase  38.06 
 
 
465 aa  183  3e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0244203  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  38.49 
 
 
495 aa  183  3e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1667  glutamyl-tRNA synthetase  38.06 
 
 
465 aa  182  4.0000000000000006e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.194864  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0184  glutamyl-tRNA synthetase  37.72 
 
 
480 aa  182  5.0000000000000004e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.527143 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1302  glutamyl-tRNA synthetase  39.86 
 
 
535 aa  182  8.000000000000001e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1866  glutamyl-tRNA synthetase  38.1 
 
 
495 aa  181  9.000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0953769  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09840  glutamyl-tRNA synthetase  37.37 
 
 
492 aa  181  1e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.224887 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2196  glutamyl-tRNA synthetase  37.83 
 
 
463 aa  180  2e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000179412  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0188  glutamate--tRNA(Gln) ligase / glutamyl-tRNA synthetase  37.63 
 
 
881 aa  180  2e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  37.91 
 
 
488 aa  179  4e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  36.1 
 
 
490 aa  179  4e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0051  glutamyl-tRNA synthetase / glutamate--tRNA(Gln) ligase  39.43 
 
 
518 aa  179  4e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0641  glutamyl-tRNA synthetase  38.99 
 
 
477 aa  179  4.999999999999999e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  37.37 
 
 
485 aa  178  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0504  glutamyl-tRNA synthetase  36.96 
 
 
504 aa  174  9.999999999999999e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0630842  normal  0.758869 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  36.36 
 
 
501 aa  174  9.999999999999999e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2393  glutamyl-tRNA synthetase  38.21 
 
 
481 aa  174  1.9999999999999998e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0156972  hitchhiker  0.00526056 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1590  glutamyl-tRNA synthetase  37.23 
 
 
467 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  unclonable  0.000000281277 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1285  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  38.73 
 
 
277 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.442309 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0605  glutamate--tRNA ligase  38.49 
 
 
316 aa  173  1.9999999999999998e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1274  glutamyl-tRNA synthetase  36.63 
 
 
472 aa  173  2.9999999999999996e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1586  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  42.38 
 
 
313 aa  173  2.9999999999999996e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.384476  normal  0.0681988 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4861  glutamyl-tRNA synthetase  36.23 
 
 
481 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000702508  unclonable  0.000000180865 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1916  glutamyl-tRNA synthetase  40.65 
 
 
475 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0777  glutamyl-tRNA synthetase  36.43 
 
 
467 aa  172  3.9999999999999995e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.980364  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0082  glutamyl-tRNA synthetase  35.77 
 
 
485 aa  172  5e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000052897  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1875  glutamyl-tRNA synthetase  36.73 
 
 
470 aa  171  9e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3060  glutamyl-tRNA synthetase  37.32 
 
 
481 aa  171  1e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000448328  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1023  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  43.28 
 
 
303 aa  171  1e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.202098  hitchhiker  0.00000345941 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0814  glutamyl-tRNA synthetase  35.79 
 
 
468 aa  171  1e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.407873  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07310  glutamyl- or glutaminyl-tRNA synthetase  40.51 
 
 
318 aa  171  2e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1984  glutamyl-tRNA synthetase  36.9 
 
 
469 aa  170  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434285  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0456  glutamyl-tRNA synthetase  34.93 
 
 
480 aa  171  2e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1474  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  37.85 
 
 
287 aa  171  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.104503  normal  0.08026 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0087  glutamyl-tRNA synthetase  34.8 
 
 
485 aa  170  3e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000536948  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0087  glutamyl-tRNA synthetase  34.8 
 
 
485 aa  170  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000457939  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0084  glutamyl-tRNA synthetase  34.8 
 
 
485 aa  170  3e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000172568  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0083  glutamyl-tRNA synthetase  34.8 
 
 
485 aa  170  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000937191  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4302  glutamyl-tRNA synthetase  35.59 
 
 
481 aa  170  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0298  glutamyl-tRNA synthetase  37.36 
 
 
469 aa  170  3e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1719  glutamyl-tRNA synthetase  37.91 
 
 
477 aa  170  3e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0086  glutamyl-tRNA synthetase  34.8 
 
 
485 aa  170  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000396162  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0098  glutamyl-tRNA synthetase  34.8 
 
 
491 aa  169  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.11563e-60 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1951  glutamyl-tRNA synthetase  39.64 
 
 
486 aa  170  3e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0884384  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0118  glutamyl-tRNA synthetase  34.8 
 
 
485 aa  170  3e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000768632  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2361  glutamyl-tRNA synthetase  35 
 
 
483 aa  169  4e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000183639  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2500  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  36.15 
 
 
294 aa  169  4e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.296852 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1892  glutamyl-tRNA synthetase  37.36 
 
 
473 aa  169  4e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1365  glutamyl-tRNA synthetase  36.53 
 
 
469 aa  169  5e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000124879  normal  0.0325353 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  37.41 
 
 
469 aa  169  5e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0108  glutamyl-tRNA synthetase  34.43 
 
 
491 aa  169  6e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000769227  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1430  glutamyl-tRNA synthetase  36.53 
 
 
469 aa  169  6e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000061517  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1418  glutamyl-tRNA synthetase  36.53 
 
 
469 aa  169  6e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000145575  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5218  glutamyl-tRNA synthetase  34.43 
 
 
491 aa  169  7e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000214653  unclonable  2.62835e-25 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  35.53 
 
 
480 aa  168  7e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  37.41 
 
 
469 aa  168  8e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2499  glutamyl-tRNA synthetase  36.16 
 
 
469 aa  168  8e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000172182  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1886  glutamyl-tRNA synthetase  36 
 
 
470 aa  168  8e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  37.28 
 
 
477 aa  168  8e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2081  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  39.69 
 
 
294 aa  168  9e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178855  normal  0.145424 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2628  glutamyl-/ glutaminyl-tRNA synthetase  37.68 
 
 
277 aa  168  1e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1377  glutamyl-tRNA synthetase  35.42 
 
 
469 aa  167  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000079335  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0982  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  42.64 
 
 
297 aa  168  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04741  glutamyl-tRNA synthetase  36.07 
 
 
492 aa  168  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.633658  normal  0.679149 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1806  glutamyl-tRNA synthetase  37.14 
 
 
476 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2495  glutamyl-tRNA synthetase  35.4 
 
 
469 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000536822  hitchhiker  0.00468963 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2822  glutamyl-tRNA synthetase  36.16 
 
 
469 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000059188  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0082  glutamyl-tRNA synthetase  34.07 
 
 
485 aa  167  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000167432  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>