More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_2196 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0242  glutamyl-tRNA synthetase  67.03 
 
 		 459 aa  642    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0111  glutamyl-tRNA synthetase  65.87 
 
 		 462 aa  640    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2196  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 463 aa  951    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000179412  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1293  glutamyl-tRNA synthetase  66.16 
 
 		 463 aa  633  1e-180  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0548  glutamyl-tRNA synthetase  65.94 
 
 		 459 aa  629  1e-179  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.102119  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1305  glutamyl-tRNA synthetase  65.65 
 
 		 463 aa  627  1e-179  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1562  glutamyl-tRNA synthetase  65.07 
 
 		 460 aa  629  1e-179  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000571227  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0434  glutamyl-tRNA synthetase  65.43 
 
 		 463 aa  625  1e-178  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1480  glutamyl-tRNA synthetase  65.65 
 
 		 463 aa  627  1e-178  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.499307  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0145  glutamyl-tRNA synthetase  61.96 
 
 		 462 aa  603  1.0000000000000001e-171  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.092829  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1234  glutamyl-tRNA synthetase  49.46 
 
 		 468 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.966582  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  49.46 
 
 		 467 aa  449  1e-125  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1579  glutamyl-tRNA synthetase  50.11 
 
 		 470 aa  451  1e-125  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.496089  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1650  glutamyl-tRNA synthetase  48.26 
 
 		 466 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.93151e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1736  glutamyl-tRNA synthetase  48.49 
 
 		 465 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.872954  normal  0.596825 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0683  glutamyl-tRNA synthetase  49.57 
 
 		 467 aa  444  1e-123  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1302  glutamyl-tRNA synthetase  49.03 
 
 		 471 aa  442  1e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1274  glutamyl-tRNA synthetase  47.76 
 
 		 472 aa  442  1e-123  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  47.52 
 
 		 466 aa  438  9.999999999999999e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  47.95 
 
 		 467 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0814  glutamyl-tRNA synthetase  49.02 
 
 		 468 aa  441  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.407873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  47.3 
 
 		 467 aa  432  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000050225  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0264  glutamyl-tRNA synthetase  46.65 
 
 		 469 aa  426  1e-118  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.530461  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1216  glutamyl-tRNA synthetase  46.54 
 
 		 470 aa  427  1e-118  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000500466  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3484  glutamyl-tRNA synthetase  46.24 
 
 		 469 aa  426  1e-118  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0422  glutamyl-tRNA synthetase  46.78 
 
 		 466 aa  422  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869081  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0584  glutamyl-tRNA synthetase  46.78 
 
 		 466 aa  422  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.779579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1590  glutamyl-tRNA synthetase  46.88 
 
 		 467 aa  420  1e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000281277 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1952  glutamyl-tRNA synthetase  46.65 
 
 		 472 aa  415  9.999999999999999e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.247366  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1456  glutamyl-tRNA synthetase  45.82 
 
 		 469 aa  412  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000100274  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0584  glutamyl-tRNA synthetase  46.96 
 
 		 466 aa  412  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0242919  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1728  glutamyl-tRNA synthetase  46.25 
 
 		 469 aa  413  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000433955  normal  0.283148 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1409  glutamyl-tRNA synthetase  44.97 
 
 		 463 aa  414  1e-114  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1886  glutamyl-tRNA synthetase  46.34 
 
 		 470 aa  409  1e-113  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1875  glutamyl-tRNA synthetase  46.34 
 
 		 470 aa  410  1e-113  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0075  glutamyl-tRNA synthetase  45.92 
 
 		 464 aa  409  1e-113  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1449  glutamyl-tRNA synthetase  45.84 
 
 		 469 aa  409  1e-113  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000565413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2906  glutamyl-tRNA synthetase  45.61 
 
 		 469 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000836575  normal  0.409064 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1604  glutamyl-tRNA synthetase  43.7 
 
 		 465 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161822  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2919  glutamyl-tRNA synthetase  46.04 
 
 		 469 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000159151  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2802  glutamyl-tRNA synthetase  45.51 
 
 		 469 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000260001  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2947  glutamyl-tRNA synthetase  45.51 
 
 		 469 aa  402  1e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000528448  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1892  glutamyl-tRNA synthetase  45.69 
 
 		 473 aa  404  1e-111  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2822  glutamyl-tRNA synthetase  45.51 
 
 		 469 aa  402  1e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000059188  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1554  glutamyl-tRNA synthetase  45.51 
 
 		 469 aa  402  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000003282  normal  0.0351282 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1430  glutamyl-tRNA synthetase  45.59 
 
 		 469 aa  402  1e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000061517  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0298  glutamyl-tRNA synthetase  45.69 
 
 		 469 aa  404  1e-111  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0696  glutamyl-tRNA synthetase  46.9 
 
 		 463 aa  403  1e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.69774  normal  0.269454 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1418  glutamyl-tRNA synthetase  45.59 
 
 		 469 aa  402  1e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000145575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1626  glutamyl-tRNA synthetase  44.87 
 
 		 470 aa  400  9.999999999999999e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0744892  normal  0.201462 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1734  glutamyl-tRNA synthetase  45.13 
 
 		 472 aa  401  9.999999999999999e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.70962  normal  0.372059 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2628  glutamyl-tRNA synthetase  43.71 
 
 		 504 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.00000000191371  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2487  glutamyl-tRNA synthetase  43.71 
 
 		 504 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000251622  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2541  glutamyl-tRNA synthetase  43.71 
 
 		 504 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.20953  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1365  glutamyl-tRNA synthetase  45.38 
 
 		 469 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000124879  normal  0.0325353 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3180  glutamyl-tRNA synthetase  45.59 
 
 		 490 aa  398  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.409628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3210  glutamyl-tRNA synthetase  43.5 
 
 		 469 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000000343347  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1806  glutamyl-tRNA synthetase  45.09 
 
 		 509 aa  396  1e-109  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1600  glutamyl-tRNA synthetase  43.5 
 
 		 469 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000105625  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0996  glutamyl-tRNA synthetase  43.91 
 
 		 464 aa  397  1e-109  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.990972 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1321  glutamyl-tRNA synthetase  45 
 
 		 464 aa  395  1e-109  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000000246268  normal  0.0216762 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5365  glutamyl-tRNA synthetase  43.28 
 
 		 512 aa  397  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000051324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2499  glutamyl-tRNA synthetase  44.95 
 
 		 469 aa  396  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000172182  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2648  glutamyl-tRNA synthetase  44.66 
 
 		 464 aa  397  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1984  glutamyl-tRNA synthetase  43.5 
 
 		 469 aa  396  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434285  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004184  glutamyl-tRNA synthetase  45.63 
 
 		 475 aa  396  1e-109  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.926878  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1114  glutamyl-tRNA synthetase  44.83 
 
 		 465 aa  395  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00321012  normal  0.762365 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2103  glutamyl-tRNA synthetase  43.5 
 
 		 469 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000014771  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2714  glutamyl-tRNA synthetase  44.64 
 
 		 469 aa  395  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000169422  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1376  glutamyl-tRNA synthetase  43.5 
 
 		 469 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00012912  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0944  glutamyl-tRNA synthetase  43.66 
 
 		 472 aa  397  1e-109  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163057  hitchhiker  0.00772012 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2207  glutamyl-tRNA synthetase  46.06 
 
 		 469 aa  397  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000288711  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3216  glutamyl-tRNA synthetase  44.61 
 
 		 470 aa  392  1e-108  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0589016  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1377  glutamyl-tRNA synthetase  43.31 
 
 		 469 aa  393  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000079335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1437  glutamyl-tRNA synthetase  44.02 
 
 		 471 aa  394  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000838412  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1105  glutamyl-tRNA synthetase  45.13 
 
 		 473 aa  394  1e-108  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2798  glutamyl-tRNA synthetase  43.56 
 
 		 472 aa  392  1e-108  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0783891  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2739  glutamyl-tRNA synthetase  44.02 
 
 		 471 aa  395  1e-108  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000464093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1642  glutamyl-tRNA synthetase  44.14 
 
 		 469 aa  393  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000000000802053  normal  0.126608 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1325  glutamyl-tRNA synthetase  44.02 
 
 		 471 aa  394  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.99689e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6021  glutamyl-tRNA synthetase  43.71 
 
 		 469 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.00000000513528  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0950  glutamyl-tRNA synthetase  41.72 
 
 		 468 aa  394  1e-108  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2088  glutamyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 469 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00000151116  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1366  glutamyl-tRNA synthetase  43.47 
 
 		 468 aa  393  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000255518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2350  glutamyl-tRNA synthetase  45.73 
 
 		 474 aa  392  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02306  glutamyl-tRNA synthetase  45.26 
 
 		 471 aa  389  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000163468  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1259  glutamyl-tRNA synthetase  45.26 
 
 		 471 aa  389  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000107097  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1179  glutamyl-tRNA synthetase  44.61 
 
 		 500 aa  389  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000996044  normal  0.265022 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2552  glutamyl-tRNA synthetase  45.26 
 
 		 471 aa  391  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000112104  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02267  hypothetical protein  45.26 
 
 		 471 aa  389  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000211719  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2075  glutamyl-tRNA synthetase  43.71 
 
 		 469 aa  391  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467012  normal  0.81702 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01271  glutamyl-tRNA synthetase  45.42 
 
 		 475 aa  392  1e-107  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2537  glutamyl-tRNA synthetase  45.26 
 
 		 471 aa  389  1e-107  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.81823e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3632  glutamyl-tRNA synthetase  45.04 
 
 		 471 aa  389  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000908657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2779  glutamyl-tRNA synthetase  45.26 
 
 		 471 aa  390  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000172763  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1191  glutamyl-tRNA synthetase  44.61 
 
 		 471 aa  390  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0302622  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0456  glutamyl-tRNA synthetase  43.84 
 
 		 480 aa  389  1e-107  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0894  glutamyl-tRNA synthetase  42.37 
 
 		 468 aa  390  1e-107  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.101678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2056  glutamyl-tRNA synthetase  43.71 
 
 		 469 aa  391  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000244557  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2689  glutamyl-tRNA synthetase  45.26 
 
 		 471 aa  389  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000585345  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>