More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1806 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_06791  glutamyl-tRNA synthetase  63.24 
 
 
476 aa  650    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1806  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 
476 aa  974    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0641  glutamyl-tRNA synthetase  62.32 
 
 
477 aa  637    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05291  glutamyl-tRNA synthetase  97.9 
 
 
492 aa  957    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0717874 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04741  glutamyl-tRNA synthetase  61.13 
 
 
492 aa  624  1e-177  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.633658  normal  0.679149 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1719  glutamyl-tRNA synthetase  60.84 
 
 
477 aa  620  1e-176  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4861  glutamyl-tRNA synthetase  57.71 
 
 
481 aa  568  1e-161  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000702508  unclonable  0.000000180865 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2393  glutamyl-tRNA synthetase  57.2 
 
 
481 aa  571  1e-161  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0156972  hitchhiker  0.00526056 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3196  glutamyl-tRNA synthetase  56.67 
 
 
482 aa  562  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4302  glutamyl-tRNA synthetase  56.22 
 
 
481 aa  562  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3060  glutamyl-tRNA synthetase  56.04 
 
 
481 aa  553  1e-156  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000448328  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05281  glutamyl-tRNA synthetase  55.25 
 
 
476 aa  552  1e-156  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04981  glutamyl-tRNA synthetase  54.83 
 
 
476 aa  552  1e-156  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.475242  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0473  glutamyl-tRNA synthetase  55.04 
 
 
479 aa  550  1e-155  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.138189  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05371  glutamyl-tRNA synthetase  53.38 
 
 
493 aa  539  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0188  glutamate--tRNA(Gln) ligase / glutamyl-tRNA synthetase  52.92 
 
 
881 aa  531  1e-149  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2309  glutamyl-tRNA synthetase  52.59 
 
 
483 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2361  glutamyl-tRNA synthetase  52.71 
 
 
483 aa  513  1e-144  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000183639  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  41.26 
 
 
485 aa  361  2e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  39.41 
 
 
482 aa  336  5e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  38.76 
 
 
479 aa  330  2e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1216  glutamyl-tRNA synthetase  38.48 
 
 
470 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000500466  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  40.09 
 
 
467 aa  326  5e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  39.29 
 
 
491 aa  326  6e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2357  glutamyl-tRNA synthetase  38.19 
 
 
490 aa  324  3e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  37.76 
 
 
477 aa  323  4e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0814  glutamyl-tRNA synthetase  38.4 
 
 
468 aa  323  5e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.407873  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1736  glutamyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 
465 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.872954  normal  0.596825 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  38.66 
 
 
485 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0670  glutamyl-tRNA synthetase  41.94 
 
 
464 aa  321  1.9999999999999998e-86  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.418683  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  38.21 
 
 
494 aa  320  3e-86  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 
485 aa  320  5e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  39.05 
 
 
466 aa  318  1e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  38.54 
 
 
486 aa  318  1e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  39.19 
 
 
467 aa  317  3e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000050225  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1590  glutamyl-tRNA synthetase  37.77 
 
 
467 aa  317  4e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  unclonable  0.000000281277 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0168  glutamyl-tRNA synthetase  38.38 
 
 
484 aa  316  5e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  37.76 
 
 
488 aa  316  5e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000204549  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0083  glutamyl-tRNA synthetase  38.8 
 
 
488 aa  316  5e-85  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.452446  hitchhiker  0.000158184 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1579  glutamyl-tRNA synthetase  37.37 
 
 
470 aa  315  9e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.496089  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  38.43 
 
 
495 aa  314  1.9999999999999998e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  37.37 
 
 
467 aa  313  4.999999999999999e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  38.98 
 
 
469 aa  311  1e-83  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  38.98 
 
 
469 aa  311  2e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0184  glutamyl-tRNA synthetase  36.08 
 
 
480 aa  309  5e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.527143 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1302  glutamyl-tRNA synthetase  37.03 
 
 
471 aa  309  5.9999999999999995e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2346  glutamyl-tRNA synthetase  37.11 
 
 
483 aa  309  5.9999999999999995e-83  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0066812  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0584  glutamyl-tRNA synthetase  37.72 
 
 
466 aa  309  6.999999999999999e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0242919  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  38.96 
 
 
488 aa  308  1.0000000000000001e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  37.24 
 
 
490 aa  308  2.0000000000000002e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1806  glutamyl-tRNA synthetase  37.72 
 
 
509 aa  307  3e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1274  glutamyl-tRNA synthetase  37.47 
 
 
472 aa  306  4.0000000000000004e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3084  glutamyl-tRNA synthetase  37.89 
 
 
471 aa  306  6e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00745356  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3484  glutamyl-tRNA synthetase  40.24 
 
 
469 aa  306  6e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1191  glutamyl-tRNA synthetase  37.89 
 
 
471 aa  306  7e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0302622  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0075  glutamyl-tRNA synthetase  36.13 
 
 
464 aa  305  9.000000000000001e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1366  glutamyl-tRNA synthetase  36.84 
 
 
468 aa  305  9.000000000000001e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000255518  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0564  glutamyl-tRNA synthetase  38.8 
 
 
484 aa  305  1.0000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1234  glutamyl-tRNA synthetase  37.68 
 
 
468 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.966582  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0550  glutamyl-tRNA synthetase  38.8 
 
 
484 aa  305  1.0000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1626  glutamyl-tRNA synthetase  36.99 
 
 
470 aa  305  1.0000000000000001e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0744892  normal  0.201462 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4369  glutamyl-tRNA synthetase  38.16 
 
 
471 aa  305  1.0000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2648  glutamyl-tRNA synthetase  37.53 
 
 
464 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004184  glutamyl-tRNA synthetase  36.93 
 
 
475 aa  304  2.0000000000000002e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.926878  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1793  glutamyl-tRNA synthetase  38.74 
 
 
484 aa  304  2.0000000000000002e-81  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0101164  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1650  glutamyl-tRNA synthetase  37.71 
 
 
466 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.93151e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0374  glutamyl-tRNA synthetase  37.63 
 
 
490 aa  303  4.0000000000000003e-81  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4681  glutamyl-tRNA synthetase  37.68 
 
 
474 aa  302  7.000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0456  glutamyl-tRNA synthetase  36.82 
 
 
466 aa  302  7.000000000000001e-81  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2931  glutamyl-tRNA synthetase  38.01 
 
 
471 aa  302  9e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.000000400457  normal  0.117314 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2350  glutamyl-tRNA synthetase  37.15 
 
 
474 aa  302  1e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5223  glutamyl-tRNA synthetase  37.92 
 
 
474 aa  301  2e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.142944  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3180  glutamyl-tRNA synthetase  38.08 
 
 
490 aa  301  2e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.409628  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01271  glutamyl-tRNA synthetase  36.72 
 
 
475 aa  301  2e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3417  glutamyl-tRNA synthetase  36.7 
 
 
469 aa  300  3e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000634908  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1886  glutamyl-tRNA synthetase  37.31 
 
 
470 aa  300  3e-80  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1875  glutamyl-tRNA synthetase  37.18 
 
 
470 aa  300  3e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0996  glutamyl-tRNA synthetase  36.5 
 
 
464 aa  300  3e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.990972 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1377  glutamyl-tRNA synthetase  39.9 
 
 
469 aa  300  3e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000079335  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0422  glutamyl-tRNA synthetase  36.59 
 
 
466 aa  300  4e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869081  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0584  glutamyl-tRNA synthetase  36.59 
 
 
466 aa  300  4e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.779579  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5146  glutamyl-tRNA synthetase  37.13 
 
 
474 aa  300  4e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.883623  normal  0.0418942 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5365  glutamyl-tRNA synthetase  36.13 
 
 
512 aa  300  5e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000051324  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  38.53 
 
 
490 aa  300  5e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1410  glutamyl-tRNA synthetase  39.11 
 
 
473 aa  299  7e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.999682  normal  0.435226 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0683  glutamyl-tRNA synthetase  37.45 
 
 
467 aa  299  7e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  37 
 
 
480 aa  299  7e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2673  glutamyl-tRNA synthetase  36.93 
 
 
471 aa  299  8e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0521229  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2558  glutamyl-tRNA synthetase  36.93 
 
 
471 aa  299  8e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000165684  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2649  glutamyl-tRNA synthetase  36.93 
 
 
471 aa  299  8e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000633167  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2607  glutamyl-tRNA synthetase  36.93 
 
 
471 aa  299  8e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00191122  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1325  glutamyl-tRNA synthetase  35.68 
 
 
471 aa  299  8e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.99689e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1437  glutamyl-tRNA synthetase  35.68 
 
 
471 aa  299  8e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000838412  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08460  glutamyl-tRNA synthetase  36.8 
 
 
498 aa  299  8e-80  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.842364  normal  0.487414 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2552  glutamyl-tRNA synthetase  37.2 
 
 
471 aa  299  9e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000112104  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2919  glutamyl-tRNA synthetase  39.14 
 
 
469 aa  299  9e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000159151  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3632  glutamyl-tRNA synthetase  37.2 
 
 
471 aa  298  1e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000908657  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2798  glutamyl-tRNA synthetase  37.22 
 
 
472 aa  298  1e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0783891  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02267  hypothetical protein  37.2 
 
 
471 aa  298  2e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000211719  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1892  glutamyl-tRNA synthetase  35.9 
 
 
473 aa  298  2e-79  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>