More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2500 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_2500  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  100 
 
 
294 aa  597  1e-170  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.296852 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1474  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  59.52 
 
 
287 aa  318  5e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.104503  normal  0.08026 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1393  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  55.89 
 
 
282 aa  318  7.999999999999999e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1285  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  58.84 
 
 
277 aa  316  4e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.442309 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2628  glutamyl-/ glutaminyl-tRNA synthetase  58.16 
 
 
277 aa  311  1e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1164  glutamate--tRNA ligase  57.68 
 
 
276 aa  309  4e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.647916  normal  0.361604 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4079  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  54.27 
 
 
281 aa  291  8e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.688664 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3734  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  47.42 
 
 
293 aa  237  2e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3555  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  46.44 
 
 
293 aa  233  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.346556  normal  0.959624 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2526  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  47.12 
 
 
297 aa  232  5e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.451286 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0925  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  45.92 
 
 
293 aa  232  6e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1270  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  44.75 
 
 
291 aa  229  3e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5237  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  45.76 
 
 
293 aa  229  4e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0814  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  44.56 
 
 
293 aa  228  8e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0121184  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1135  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  45.58 
 
 
289 aa  228  9e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0748  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  45.42 
 
 
290 aa  227  2e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3848  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  44.75 
 
 
293 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1647  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  44.44 
 
 
291 aa  225  7e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1631  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  45.24 
 
 
300 aa  225  8e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1594  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  44.44 
 
 
291 aa  225  8e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3652  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  44.86 
 
 
288 aa  222  6e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3840  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  45.7 
 
 
315 aa  220  3e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4885  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  46.44 
 
 
291 aa  220  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.763811  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3486  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  45.27 
 
 
290 aa  219  3e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1152  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  44.37 
 
 
296 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3110  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  46.62 
 
 
284 aa  214  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.599577 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2391  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  46.33 
 
 
280 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00564055 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1491  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  43.1 
 
 
281 aa  213  1.9999999999999998e-54  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.88267  normal  0.107951 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3026  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  43.77 
 
 
295 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.65346  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3205  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  44.44 
 
 
279 aa  213  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.572919  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3286  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  43.55 
 
 
296 aa  211  7.999999999999999e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0410237 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0551  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  45.89 
 
 
281 aa  211  1e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1325  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  45.55 
 
 
281 aa  207  1e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0433  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  41.24 
 
 
300 aa  206  3e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.245472 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4004  glutamyl-tRNA Synthetase  44.11 
 
 
300 aa  205  7e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2353  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  43.77 
 
 
278 aa  205  8e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.930617  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0957  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  44.11 
 
 
304 aa  204  2e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.800313  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1847  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  43.58 
 
 
294 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978391  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3084  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  47.52 
 
 
287 aa  194  2e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.852004  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1025  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  44.71 
 
 
297 aa  191  1e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.255521 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4877  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  44.56 
 
 
279 aa  187  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.284735  normal  0.0736778 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3242  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  42.81 
 
 
302 aa  185  7e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.533395  normal  0.726961 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1031  glutamate--tRNA ligase  42.34 
 
 
283 aa  181  1e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2226  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  39.16 
 
 
311 aa  171  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000178146  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1882  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  39.11 
 
 
295 aa  169  4e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3027  glutamate--tRNA ligase  36.15 
 
 
278 aa  169  4e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.968888  normal  0.390374 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1769  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  36.33 
 
 
331 aa  168  9e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1332  Glutamate--tRNA ligase  35.42 
 
 
311 aa  168  9e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000257577  decreased coverage  0.00027046 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1329  tRNA synthetase class I domain-containing protein  39.07 
 
 
314 aa  168  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1586  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  38.06 
 
 
313 aa  167  2e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.384476  normal  0.0681988 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0306  Glutamate--tRNA ligase  40.07 
 
 
323 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0317  Glutamate--tRNA ligase  37.71 
 
 
323 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1188  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  36.56 
 
 
310 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0787184 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3073  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  36.56 
 
 
310 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0797  glutamate--tRNA ligase  37.17 
 
 
303 aa  165  6.9999999999999995e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000376322  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07310  glutamyl- or glutaminyl-tRNA synthetase  38.95 
 
 
318 aa  165  6.9999999999999995e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2900  glutamate--tRNA ligase  41.73 
 
 
302 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0201877  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1109  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  38.24 
 
 
299 aa  163  3e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02306  glutamyl-tRNA synthetase  34.86 
 
 
471 aa  160  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000163468  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1259  glutamyl-tRNA synthetase  34.86 
 
 
471 aa  160  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000107097  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1272  glutamyl-tRNA synthetase  34.86 
 
 
471 aa  160  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000352174  hitchhiker  0.00569831 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2552  glutamyl-tRNA synthetase  34.86 
 
 
471 aa  161  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000112104  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02267  hypothetical protein  34.86 
 
 
471 aa  160  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000211719  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2537  glutamyl-tRNA synthetase  34.86 
 
 
471 aa  160  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.81823e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2779  glutamyl-tRNA synthetase  34.86 
 
 
471 aa  160  2e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000172763  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2689  glutamyl-tRNA synthetase  34.86 
 
 
471 aa  160  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000585345  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3632  glutamyl-tRNA synthetase  34.86 
 
 
471 aa  160  3e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000908657  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1780  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  36.23 
 
 
314 aa  159  4e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.234416 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1191  glutamyl-tRNA synthetase  34.51 
 
 
471 aa  159  4e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0302622  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2779  glutamyl-tRNA synthetase  34.51 
 
 
471 aa  159  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00021769  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0319  glutamate--tRNA ligase  39.39 
 
 
337 aa  158  8e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.468556  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0295  glutamate--tRNA ligase  38.67 
 
 
323 aa  159  8e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.436066  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2558  glutamyl-tRNA synthetase  34.15 
 
 
471 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000165684  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2673  glutamyl-tRNA synthetase  34.15 
 
 
471 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0521229  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1905  glutamate--tRNA ligase  38.13 
 
 
309 aa  158  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0217385  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2649  glutamyl-tRNA synthetase  34.15 
 
 
471 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000633167  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2607  glutamyl-tRNA synthetase  34.15 
 
 
471 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00191122  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1055  glutamyl-tRNA synthetase  34.15 
 
 
471 aa  157  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.291926  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3084  glutamyl-tRNA synthetase  33.8 
 
 
471 aa  157  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00745356  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2931  glutamyl-tRNA synthetase  34.51 
 
 
471 aa  157  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.000000400457  normal  0.117314 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1251  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  36.76 
 
 
296 aa  157  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.540986  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0996  glutamyl-tRNA synthetase  35.44 
 
 
464 aa  156  3e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.990972 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2698  glutamyl- and glutaminyl- tRNA synthetase  37.27 
 
 
311 aa  157  3e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000386478  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3294  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  36.86 
 
 
296 aa  156  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0518  glutamyl-tRNA synthetase domain-containing protein  38.46 
 
 
302 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13470  glutamyl- or glutaminyl-tRNA synthetase  35.84 
 
 
317 aa  155  6e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.301512  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4720  glutamate--tRNA ligase  36.69 
 
 
292 aa  155  7e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.943988  normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3371  glutamate--tRNA ligase  36.76 
 
 
309 aa  155  7e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2934  glutamate--tRNA ligase  37.28 
 
 
327 aa  155  8e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0900886  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4726  Glutamate--tRNA ligase  39.31 
 
 
316 aa  155  9e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0696299  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3769  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  36.81 
 
 
301 aa  154  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0219396 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2709  glutamyl-tRNA synthetase  38.32 
 
 
301 aa  154  2e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.63084  normal  0.578011 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0570  Glutamate--tRNA ligase  37.59 
 
 
319 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3764  Glutamate--tRNA ligase  36.01 
 
 
297 aa  153  4e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0334  Glutamate--tRNA ligase  33.53 
 
 
373 aa  153  4e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.374336 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1396  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  37.09 
 
 
334 aa  153  4e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.535698  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0670  glutamyl-tRNA synthetase  32.98 
 
 
464 aa  152  4e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.418683  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2581  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  37.93 
 
 
310 aa  152  8e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.457948 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0962  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  37.59 
 
 
298 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.294785  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3985  glutamate--tRNA ligase  37.17 
 
 
298 aa  151  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>