More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3764 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3764  Glutamate--tRNA ligase  100 
 
 
297 aa  594  1e-169  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3985  glutamate--tRNA ligase  81.23 
 
 
298 aa  461  1e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0570  Glutamate--tRNA ligase  65.99 
 
 
319 aa  359  2e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0414  Glutamate--tRNA ligase  61.17 
 
 
309 aa  339  2.9999999999999998e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1233  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  59.79 
 
 
296 aa  335  5e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.447568  normal  0.0288811 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02060  glutamyl- or glutaminyl-tRNA synthetase  61.99 
 
 
311 aa  332  4e-90  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5322  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  60.34 
 
 
293 aa  329  3e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4941  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  60 
 
 
293 aa  329  3e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5029  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  60 
 
 
293 aa  329  3e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5575  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  60 
 
 
310 aa  327  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.861555  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4042  Glutamate--tRNA ligase  63.89 
 
 
285 aa  323  2e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02670  glutamyl- or glutaminyl-tRNA synthetase  54.74 
 
 
328 aa  295  8e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.374446  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4726  Glutamate--tRNA ligase  60.24 
 
 
316 aa  278  6e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0696299  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0306  Glutamate--tRNA ligase  49.44 
 
 
323 aa  230  3e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1332  Glutamate--tRNA ligase  44.84 
 
 
311 aa  219  6e-56  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000257577  decreased coverage  0.00027046 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0295  glutamate--tRNA ligase  48.69 
 
 
323 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.436066  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0317  Glutamate--tRNA ligase  49.44 
 
 
323 aa  217  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1023  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  48.19 
 
 
303 aa  213  2.9999999999999995e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.202098  hitchhiker  0.00000345941 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0947  Glutamate--tRNA ligase  48.81 
 
 
313 aa  211  2e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.507725  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07310  glutamyl- or glutaminyl-tRNA synthetase  46.64 
 
 
318 aa  207  1e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1769  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  45.14 
 
 
331 aa  208  1e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0319  glutamate--tRNA ligase  48.06 
 
 
337 aa  206  3e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.468556  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1586  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  44.41 
 
 
313 aa  204  2e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.384476  normal  0.0681988 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13470  glutamyl- or glutaminyl-tRNA synthetase  46.31 
 
 
317 aa  201  1.9999999999999998e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.301512  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0334  Glutamate--tRNA ligase  40.25 
 
 
373 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.374336 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1780  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  45.42 
 
 
314 aa  196  3e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.234416 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2698  glutamyl- and glutaminyl- tRNA synthetase  47.39 
 
 
311 aa  196  5.000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000386478  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0504  glutamyl-tRNA synthetase  40.15 
 
 
504 aa  195  7e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0630842  normal  0.758869 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4805  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  46.22 
 
 
298 aa  195  7e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0167775  hitchhiker  0.00700115 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3586  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  46.64 
 
 
294 aa  194  1e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1188  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  45.42 
 
 
310 aa  194  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0787184 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3073  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  43.66 
 
 
310 aa  193  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1329  tRNA synthetase class I domain-containing protein  43.28 
 
 
314 aa  193  3e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42650  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  44.04 
 
 
298 aa  192  4e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.404894  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0834  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  45.8 
 
 
295 aa  192  5e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00133315 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2226  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  41.39 
 
 
311 aa  192  5e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000178146  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2709  glutamyl-tRNA synthetase  45.75 
 
 
301 aa  192  6e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.63084  normal  0.578011 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3450  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  43.56 
 
 
330 aa  192  7e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0967  glutamyl-tRNA synthetase-related protein  44.54 
 
 
295 aa  191  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1031  glutamate--tRNA ligase  47.79 
 
 
283 aa  191  1e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2004  glutamyl-tRNA synthetase  42.91 
 
 
329 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.266458  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08460  glutamyl-tRNA synthetase  41.11 
 
 
498 aa  189  4e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.842364  normal  0.487414 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3371  glutamate--tRNA ligase  44.35 
 
 
309 aa  189  4e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3484  glutamyl-tRNA synthetase  39.46 
 
 
469 aa  189  4e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  38.67 
 
 
467 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1882  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  44.8 
 
 
295 aa  188  8e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  40.7 
 
 
466 aa  187  1e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  37.46 
 
 
467 aa  187  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000050225  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1396  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  42.01 
 
 
334 aa  187  1e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.535698  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3734  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  44.29 
 
 
293 aa  186  3e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1109  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  45.83 
 
 
299 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2081  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  46.22 
 
 
294 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178855  normal  0.145424 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5440  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  44.81 
 
 
293 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1325  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  42.39 
 
 
281 aa  183  3e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0456  glutamyl-tRNA synthetase  32.24 
 
 
466 aa  183  3e-45  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62510  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  43.11 
 
 
293 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.632499  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0740  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  43.7 
 
 
295 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000657167 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4692  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  44.12 
 
 
295 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000687127 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  40.31 
 
 
467 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0867  Glutamate--tRNA ligase  42.26 
 
 
327 aa  182  6e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2581  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  45.76 
 
 
310 aa  182  6e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.457948 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0797  glutamate--tRNA ligase  40.2 
 
 
303 aa  182  8.000000000000001e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000376322  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4694  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  44.12 
 
 
300 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.958357  hitchhiker  0.000909372 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4558  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  44.12 
 
 
300 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000548174 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1133  glutamyl-tRNA synthetase  40.14 
 
 
466 aa  181  1e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.484042  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3110  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  44.04 
 
 
284 aa  181  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.599577 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4720  glutamate--tRNA ligase  45.85 
 
 
292 aa  181  1e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.943988  normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  36.61 
 
 
479 aa  181  1e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3769  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  47.79 
 
 
301 aa  180  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0219396 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0264  glutamyl-tRNA synthetase  39.15 
 
 
469 aa  180  2e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.530461  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2014  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  45.38 
 
 
311 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0584  glutamyl-tRNA synthetase  38.83 
 
 
466 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0242919  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1736  glutamyl-tRNA synthetase  39.84 
 
 
465 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.872954  normal  0.596825 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3294  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  45.88 
 
 
296 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1163  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  41.79 
 
 
322 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0216761  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3339  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  43.03 
 
 
321 aa  179  4e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000626145  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3115  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  39.72 
 
 
352 aa  179  4e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000632224  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2900  glutamate--tRNA ligase  44.92 
 
 
302 aa  179  4e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0201877  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1302  glutamyl-tRNA synthetase  39.62 
 
 
535 aa  179  4.999999999999999e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0670  glutamyl-tRNA synthetase  37.25 
 
 
464 aa  179  4.999999999999999e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.418683  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1396  glutamyl-tRNA synthetase  40.41 
 
 
479 aa  179  4.999999999999999e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00644149 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1626  glutamyl-tRNA synthetase  38.79 
 
 
470 aa  179  5.999999999999999e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0744892  normal  0.201462 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3061  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  42.18 
 
 
291 aa  178  7e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.293014  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0155  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  40.3 
 
 
308 aa  178  8e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000330797  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1302  glutamyl-tRNA synthetase  37.21 
 
 
471 aa  178  8e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2714  glutamyl-tRNA synthetase  39.36 
 
 
469 aa  178  8e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000169422  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1650  glutamyl-tRNA synthetase  40.24 
 
 
466 aa  178  9e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.93151e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3092  glutamyl-tRNA synthetase  39.04 
 
 
471 aa  177  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.45014 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2533  glutamyl-tRNA synthetase  40.82 
 
 
473 aa  177  1e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000038789  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0422  glutamyl-tRNA synthetase  39.02 
 
 
466 aa  178  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869081  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0584  glutamyl-tRNA synthetase  39.02 
 
 
466 aa  178  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.779579  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1274  glutamyl-tRNA synthetase  40.65 
 
 
472 aa  177  2e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2648  glutamyl-tRNA synthetase  40.16 
 
 
464 aa  177  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3469  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  42.63 
 
 
394 aa  177  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000116518  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0153  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  40.6 
 
 
308 aa  177  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000216792  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1449  glutamyl-tRNA synthetase  40 
 
 
469 aa  177  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000565413  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1562  glutamyl-tRNA synthetase  35.62 
 
 
460 aa  177  2e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000571227  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0690  glutamate--tRNA ligase  43.23 
 
 
300 aa  177  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.858834 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1006  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  42.63 
 
 
384 aa  176  3e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000329322  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0135  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  40.6 
 
 
308 aa  176  3e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000952983  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>