More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2081 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_2081  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  100 
 
 
294 aa  596  1e-169  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178855  normal  0.145424 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3294  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  80.28 
 
 
296 aa  472  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1251  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  79.86 
 
 
296 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.540986  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0962  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  77.47 
 
 
298 aa  433  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.294785  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2338  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  74.39 
 
 
298 aa  421  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0246272 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1703  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  74.39 
 
 
298 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2315  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  74.39 
 
 
298 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2234  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  75.68 
 
 
294 aa  420  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5657  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  77.22 
 
 
297 aa  410  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2354  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  76.63 
 
 
297 aa  408  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0532352  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0982  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  76.29 
 
 
297 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1915  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  80.74 
 
 
297 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00194048  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1203  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  80.74 
 
 
297 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.603954  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1353  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  80.74 
 
 
297 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0672559  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0827  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  80.74 
 
 
297 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.292279  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1195  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  80.74 
 
 
297 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0519068  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0324  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  80.74 
 
 
297 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.171328  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1041  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  80.74 
 
 
297 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.512398  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0900  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  68.17 
 
 
301 aa  391  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2581  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  68.97 
 
 
310 aa  392  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.457948 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2014  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  65.19 
 
 
311 aa  381  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2408  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  64.85 
 
 
314 aa  383  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2210  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  65.41 
 
 
315 aa  377  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.895513  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2934  glutamate--tRNA ligase  61.64 
 
 
327 aa  337  1.9999999999999998e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0900886  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4720  glutamate--tRNA ligase  60 
 
 
292 aa  315  7e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.943988  normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2904  glutamate--tRNA ligase  53.89 
 
 
338 aa  312  4.999999999999999e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.437681  normal  0.870267 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4049  glutamate--tRNA ligase  60.14 
 
 
312 aa  308  8e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.963278  normal  0.0953958 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1905  glutamate--tRNA ligase  56.6 
 
 
309 aa  306  3e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0217385  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2900  glutamate--tRNA ligase  58.62 
 
 
302 aa  304  9.000000000000001e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0201877  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3126  Glutamate--tRNA ligase  55.67 
 
 
307 aa  302  4.0000000000000003e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.216069  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1782  Glutamate--tRNA ligase  54.22 
 
 
323 aa  296  2e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1982  glutamate--tRNA ligase  54.87 
 
 
323 aa  296  3e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.193008  normal  0.926165 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3769  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  60.66 
 
 
301 aa  293  3e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0219396 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1109  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  63.97 
 
 
299 aa  292  5e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0690  glutamate--tRNA ligase  55.71 
 
 
300 aa  291  6e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.858834 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1031  glutamate--tRNA ligase  60.08 
 
 
283 aa  285  9e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0797  glutamate--tRNA ligase  52.1 
 
 
303 aa  280  2e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000376322  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0605  glutamate--tRNA ligase  51 
 
 
316 aa  280  2e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3032  glutamate--tRNA ligase  55.43 
 
 
335 aa  279  4e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.490403  normal  0.333291 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3639  Glutamate--tRNA ligase  55.52 
 
 
318 aa  264  1e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.917927  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2709  glutamyl-tRNA synthetase  54.23 
 
 
301 aa  263  3e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.63084  normal  0.578011 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2698  glutamyl- and glutaminyl- tRNA synthetase  53.64 
 
 
311 aa  261  6.999999999999999e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000386478  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00405  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  53.82 
 
 
299 aa  246  2e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0740  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  51.79 
 
 
295 aa  245  6e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000657167 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2226  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  53.25 
 
 
311 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000178146  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5440  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  51.14 
 
 
293 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1882  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  53.91 
 
 
295 aa  242  3.9999999999999997e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1329  tRNA synthetase class I domain-containing protein  53.01 
 
 
314 aa  241  7.999999999999999e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1780  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  49.64 
 
 
314 aa  240  2e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.234416 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4558  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  51.39 
 
 
300 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000548174 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62510  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  48.48 
 
 
293 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.632499  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4694  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  51 
 
 
300 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.958357  hitchhiker  0.000909372 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3371  glutamate--tRNA ligase  52.52 
 
 
309 aa  237  1e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4692  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  52.5 
 
 
295 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000687127 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2749  Glutamate--tRNA ligase  51.57 
 
 
306 aa  236  2e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.242915  normal  0.441865 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42650  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  50.38 
 
 
298 aa  232  6e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.404894  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0922  glutamate--tRNA ligase  48.68 
 
 
300 aa  230  2e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3586  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  51.39 
 
 
294 aa  229  3e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4805  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  51.41 
 
 
298 aa  229  5e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0167775  hitchhiker  0.00700115 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1188  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  50.82 
 
 
310 aa  228  6e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0787184 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3073  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  50.82 
 
 
310 aa  226  3e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0834  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  50.61 
 
 
295 aa  224  9e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00133315 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3115  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  45.64 
 
 
352 aa  224  1e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000632224  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0583  glutamate--tRNA ligase  43.36 
 
 
308 aa  224  1e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002564  glutamyl-Q-tRNA synthetase  45.67 
 
 
287 aa  224  2e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000502231  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4012  glutamate--tRNA ligase  42.96 
 
 
299 aa  223  4e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000166236  normal  0.954035 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3373  glutamate--tRNA ligase  46.58 
 
 
298 aa  222  4.9999999999999996e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0303473 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0676  glutamate--tRNA ligase  50.76 
 
 
310 aa  222  6e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0967  glutamyl-tRNA synthetase-related protein  49.4 
 
 
295 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0518  glutamyl-tRNA synthetase domain-containing protein  46.94 
 
 
302 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0673  glutamate--tRNA ligase  45.52 
 
 
305 aa  221  1.9999999999999999e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.930403  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0947  Glutamate--tRNA ligase  51.23 
 
 
313 aa  220  3e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.507725  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07310  glutamyl- or glutaminyl-tRNA synthetase  46.27 
 
 
318 aa  218  1e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1163  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  44.25 
 
 
322 aa  217  2e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0216761  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3061  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  50 
 
 
291 aa  215  8e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.293014  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3171  glutamate--tRNA ligase  45.42 
 
 
287 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000837027  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0306  Glutamate--tRNA ligase  48.08 
 
 
323 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2820  Glutamate--tRNA ligase  44.06 
 
 
302 aa  211  1e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00525716  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1046  Glutamate--tRNA ligase  46.36 
 
 
296 aa  210  2e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244442 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0126  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  43.6 
 
 
296 aa  210  2e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000036555  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0927  glutamyl-tRNA synthetase-related protein  46.36 
 
 
296 aa  210  2e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1332  Glutamate--tRNA ligase  44.67 
 
 
311 aa  209  6e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000257577  decreased coverage  0.00027046 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0848  glutamate--tRNA ligase  40.54 
 
 
304 aa  209  7e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000166391  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0135  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  45.02 
 
 
308 aa  208  9e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000952983  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3986  glutamate--tRNA ligase  45.72 
 
 
303 aa  208  1e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000239485  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3339  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  45.72 
 
 
321 aa  207  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000626145  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0684  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  42.56 
 
 
296 aa  205  7e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000131697  normal  0.627164 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00143  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  45.86 
 
 
308 aa  204  1e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000965107  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0155  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  43.45 
 
 
308 aa  204  1e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000330797  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0851  Glutamate--tRNA ligase  47.58 
 
 
313 aa  204  1e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.31695  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3799  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  44.06 
 
 
299 aa  204  1e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000213424  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3515  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  45.86 
 
 
308 aa  204  1e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000809743  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00142  hypothetical protein  45.86 
 
 
308 aa  204  1e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000073692  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3469  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  45.35 
 
 
394 aa  204  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000116518  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0871  Glutamate--tRNA ligase  43.38 
 
 
304 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000393825  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3458  Glutamate--tRNA ligase  45.86 
 
 
308 aa  204  2e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000233336  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3491  glutamate--tRNA ligase  43.28 
 
 
304 aa  203  2e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000545607  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0883  glutamate--tRNA ligase  42.64 
 
 
304 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000349981  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0147  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  45.86 
 
 
308 aa  204  2e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000535998  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0153  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  45.49 
 
 
308 aa  203  3e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000216792  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>