More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0295 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_0295  glutamate--tRNA ligase  100 
 
 		 323 aa  620  1e-177  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.436066  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0306  Glutamate--tRNA ligase  93.81 
 
 		 323 aa  588  1e-167  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0317  Glutamate--tRNA ligase  95.05 
 
 		 323 aa  563  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0319  glutamate--tRNA ligase  79.6 
 
 		 337 aa  412  1e-114  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.468556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  47.04 
 
 		 494 aa  281  8.000000000000001e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0334  Glutamate--tRNA ligase  47.51 
 
 		 373 aa  280  3e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.374336 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3450  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  49.22 
 
 		 330 aa  279  4e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0867  Glutamate--tRNA ligase  52.56 
 
 		 327 aa  279  5e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09840  glutamyl-tRNA synthetase  45.2 
 
 		 492 aa  276  3e-73  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.224887 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1396  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  50 
 
 		 334 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.535698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08460  glutamyl-tRNA synthetase  45.45 
 
 		 498 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.842364  normal  0.487414 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2004  glutamyl-tRNA synthetase  48.14 
 
 		 329 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.266458  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1332  Glutamate--tRNA ligase  47.65 
 
 		 311 aa  272  5.000000000000001e-72  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000257577  decreased coverage  0.00027046 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1302  glutamyl-tRNA synthetase  46.39 
 
 		 535 aa  272  7e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  43.65 
 
 		 482 aa  271  8.000000000000001e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4726  Glutamate--tRNA ligase  53.65 
 
 		 316 aa  268  8e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0696299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1325  glutamyl-tRNA synthetase  41.69 
 
 		 478 aa  268  1e-70  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  43.75 
 
 		 495 aa  266  4e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  43.75 
 
 		 485 aa  265  5.999999999999999e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0051  glutamyl-tRNA synthetase / glutamate--tRNA(Gln) ligase  46.25 
 
 		 518 aa  264  2e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0504  glutamyl-tRNA synthetase  43.89 
 
 		 504 aa  263  4e-69  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0630842  normal  0.758869 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1769  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  49.53 
 
 		 331 aa  263  4e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0935  glutamyl-tRNA synthetase  49.69 
 
 		 468 aa  260  2e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.355577  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3343  Glutamate--tRNA ligase  46.99 
 
 		 338 aa  261  2e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.533309  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  38.39 
 
 		 485 aa  255  6e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  41.82 
 
 		 488 aa  255  9e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000204549  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 485 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1866  glutamyl-tRNA synthetase  43.79 
 
 		 495 aa  254  1.0000000000000001e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0953769  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49888  predicted protein  43.26 
 
 		 546 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.757825  normal  0.413505 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2357  glutamyl-tRNA synthetase  40.88 
 
 		 490 aa  251  1e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2250  glutamyl-tRNA synthetase  45 
 
 		 472 aa  250  2e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.000000000347292  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2538  glutamyl-tRNA synthetase  40.06 
 
 		 481 aa  250  2e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1176  glutamyl-tRNA synthetase  42.45 
 
 		 487 aa  250  2e-65  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0108  glutamyl-tRNA synthetase  46.13 
 
 		 477 aa  249  3e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  41.23 
 
 		 490 aa  249  4e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1365  glutamyl-tRNA synthetase  43.17 
 
 		 484 aa  249  5e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  41.3 
 
 		 501 aa  249  5e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1586  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  49.5 
 
 		 313 aa  249  5e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.384476  normal  0.0681988 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1146  glutamyl-tRNA synthetase  42.72 
 
 		 484 aa  248  8e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  42.15 
 
 		 469 aa  246  3e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0570  Glutamate--tRNA ligase  49.85 
 
 		 319 aa  246  3e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0678  glutamyl-tRNA synthetase  41.36 
 
 		 469 aa  246  4e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0260841  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  40.37 
 
 		 488 aa  245  8e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  41.85 
 
 		 469 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07310  glutamyl- or glutaminyl-tRNA synthetase  47.56 
 
 		 318 aa  242  6e-63  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  39.25 
 
 		 477 aa  242  7e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1264  glutamyl-tRNA synthetase  44.65 
 
 		 471 aa  241  1e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0670  glutamyl-tRNA synthetase  38.12 
 
 		 464 aa  241  1e-62  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.418683  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  40.31 
 
 		 490 aa  239  2.9999999999999997e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0065  glutamyl-tRNA synthetase  39.51 
 
 		 473 aa  239  4e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0249226  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0077  glutamyl-tRNA synthetase  41.64 
 
 		 492 aa  238  9e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  37.27 
 
 		 486 aa  236  3e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1302  glutamyl-tRNA synthetase  43.44 
 
 		 471 aa  236  3e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13470  glutamyl- or glutaminyl-tRNA synthetase  45.21 
 
 		 317 aa  237  3e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.301512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3027  glutamate--tRNA ligase  47.55 
 
 		 278 aa  236  4e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.968888  normal  0.390374 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2388  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  50.18 
 
 		 294 aa  236  4e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.126082  normal  0.583593 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1876  glutamyl-tRNA synthetase  46.52 
 
 		 482 aa  236  5.0000000000000005e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000140035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2222  glutamyl-tRNA synthetase  46.52 
 
 		 508 aa  236  6e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.493461  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  41.43 
 
 		 466 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2533  glutamyl-tRNA synthetase  42.01 
 
 		 467 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000148885  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1667  glutamyl-tRNA synthetase  40.06 
 
 		 465 aa  234  1.0000000000000001e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.194864  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0531  glutamyl-tRNA synthetase  40.06 
 
 		 465 aa  233  2.0000000000000002e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0244203  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1830  glutamyl-tRNA synthetase  37 
 
 		 488 aa  234  2.0000000000000002e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.462923  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0683  glutamyl-tRNA synthetase  41.85 
 
 		 467 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  36.92 
 
 		 480 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1274  glutamyl-tRNA synthetase  42.06 
 
 		 472 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1579  glutamyl-tRNA synthetase  40.25 
 
 		 470 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.496089  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  41.43 
 
 		 467 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0584  glutamyl-tRNA synthetase  41.74 
 
 		 466 aa  233  3e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.779579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2856  glutamyl-tRNA synthetase  42.41 
 
 		 496 aa  233  3e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0422  glutamyl-tRNA synthetase  41.74 
 
 		 466 aa  233  3e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869081  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  41.12 
 
 		 467 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000050225  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2733  glutamyl-tRNA synthetase  42.24 
 
 		 494 aa  232  8.000000000000001e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0694392  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0298  glutamyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 469 aa  231  1e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0814  glutamyl-tRNA synthetase  40.87 
 
 		 468 aa  231  1e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.407873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_52655  glutamyl-trna synthase  42.07 
 
 		 588 aa  231  1e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.233509  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  37.89 
 
 		 491 aa  231  1e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3985  glutamate--tRNA ligase  52.12 
 
 		 298 aa  231  1e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1892  glutamyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 473 aa  231  1e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3484  glutamyl-tRNA synthetase  39.56 
 
 		 469 aa  231  1e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1916  glutamyl-tRNA synthetase  48.11 
 
 		 475 aa  231  1e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  37.27 
 
 		 479 aa  230  2e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0082  glutamyl-tRNA synthetase  38.51 
 
 		 485 aa  231  2e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000052897  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0184  glutamyl-tRNA synthetase  43.27 
 
 		 480 aa  230  2e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.527143 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1329  tRNA synthetase class I domain-containing protein  53.91 
 
 		 314 aa  230  3e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0087  glutamyl-tRNA synthetase  38.82 
 
 		 485 aa  230  3e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000536948  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0118  glutamyl-tRNA synthetase  38.82 
 
 		 485 aa  230  3e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000768632  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0087  glutamyl-tRNA synthetase  38.82 
 
 		 485 aa  230  3e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000457939  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0084  glutamyl-tRNA synthetase  38.82 
 
 		 485 aa  230  3e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000172568  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0083  glutamyl-tRNA synthetase  38.82 
 
 		 485 aa  230  3e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000937191  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0086  glutamyl-tRNA synthetase  38.82 
 
 		 485 aa  230  3e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000396162  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0098  glutamyl-tRNA synthetase  38.82 
 
 		 491 aa  229  4e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.11563e-60 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0108  glutamyl-tRNA synthetase  38.82 
 
 		 491 aa  228  7e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000769227  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1409  glutamyl-tRNA synthetase  42.9 
 
 		 463 aa  228  1e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  40.13 
 
 		 467 aa  228  1e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3764  Glutamate--tRNA ligase  48.69 
 
 		 297 aa  227  2e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1234  glutamyl-tRNA synthetase  39.69 
 
 		 468 aa  226  4e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.966582  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0584  glutamyl-tRNA synthetase  39.62 
 
 		 466 aa  226  4e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0242919  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1626  glutamyl-tRNA synthetase  38.01 
 
 		 470 aa  226  6e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0744892  normal  0.201462 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0414  Glutamate--tRNA ligase  44.65 
 
 		 309 aa  224  1e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>