More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3450 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_3450  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  100 
 
 
330 aa  662    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1396  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  55.56 
 
 
334 aa  355  5e-97  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.535698  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2004  glutamyl-tRNA synthetase  55.21 
 
 
329 aa  338  7e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.266458  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0334  Glutamate--tRNA ligase  52.23 
 
 
373 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.374336 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1769  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  58.03 
 
 
331 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0306  Glutamate--tRNA ligase  49.22 
 
 
323 aa  282  5.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0317  Glutamate--tRNA ligase  48.71 
 
 
323 aa  273  3e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0295  glutamate--tRNA ligase  49.22 
 
 
323 aa  271  9e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.436066  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0319  glutamate--tRNA ligase  52.01 
 
 
337 aa  265  5.999999999999999e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.468556  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0867  Glutamate--tRNA ligase  47.96 
 
 
327 aa  263  3e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13470  glutamyl- or glutaminyl-tRNA synthetase  44.92 
 
 
317 aa  246  4.9999999999999997e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.301512  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07310  glutamyl- or glutaminyl-tRNA synthetase  43.89 
 
 
318 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1586  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  43.79 
 
 
313 aa  234  2.0000000000000002e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.384476  normal  0.0681988 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3343  Glutamate--tRNA ligase  41.49 
 
 
338 aa  231  1e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.533309  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1332  Glutamate--tRNA ligase  38.82 
 
 
311 aa  229  5e-59  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000257577  decreased coverage  0.00027046 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0935  glutamyl-tRNA synthetase  41.94 
 
 
468 aa  229  6e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.355577  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4726  Glutamate--tRNA ligase  45.02 
 
 
316 aa  223  4e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0696299  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08460  glutamyl-tRNA synthetase  40.32 
 
 
498 aa  220  3e-56  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.842364  normal  0.487414 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1325  glutamyl-tRNA synthetase  37.79 
 
 
478 aa  218  7.999999999999999e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3027  glutamate--tRNA ligase  44.49 
 
 
278 aa  217  2e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.968888  normal  0.390374 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0570  Glutamate--tRNA ligase  43.91 
 
 
319 aa  218  2e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0504  glutamyl-tRNA synthetase  37.38 
 
 
504 aa  214  9.999999999999999e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0630842  normal  0.758869 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  40.72 
 
 
494 aa  214  9.999999999999999e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0051  glutamyl-tRNA synthetase / glutamate--tRNA(Gln) ligase  38.46 
 
 
518 aa  214  1.9999999999999998e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  37.38 
 
 
485 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1876  glutamyl-tRNA synthetase  42.67 
 
 
482 aa  212  4.9999999999999996e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000140035  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2222  glutamyl-tRNA synthetase  42.67 
 
 
508 aa  212  7.999999999999999e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.493461  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1604  glutamyl-tRNA synthetase  39.81 
 
 
465 aa  210  3e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161822  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09840  glutamyl-tRNA synthetase  38.06 
 
 
492 aa  209  4e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.224887 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0108  glutamyl-tRNA synthetase  40.32 
 
 
477 aa  208  1e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1264  glutamyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 
471 aa  208  1e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  39.03 
 
 
488 aa  208  1e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  37.66 
 
 
482 aa  207  2e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2538  glutamyl-tRNA synthetase  34.52 
 
 
481 aa  207  2e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2357  glutamyl-tRNA synthetase  37.14 
 
 
490 aa  206  6e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  35.06 
 
 
485 aa  205  8e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  37.66 
 
 
490 aa  205  1e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  37.46 
 
 
477 aa  204  2e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1023  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  45.85 
 
 
303 aa  203  3e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.202098  hitchhiker  0.00000345941 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  38.51 
 
 
485 aa  202  9e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49888  predicted protein  37.99 
 
 
546 aa  201  9.999999999999999e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.757825  normal  0.413505 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  38.46 
 
 
466 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2388  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  45.36 
 
 
294 aa  201  1.9999999999999998e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.126082  normal  0.583593 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0184  glutamyl-tRNA synthetase  39.1 
 
 
480 aa  200  1.9999999999999998e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.527143 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  38.06 
 
 
490 aa  200  3e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  34.41 
 
 
479 aa  200  3e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2250  glutamyl-tRNA synthetase  36.74 
 
 
472 aa  200  3.9999999999999996e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.000000000347292  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1916  glutamyl-tRNA synthetase  40.46 
 
 
475 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  37.25 
 
 
467 aa  199  7e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  34.62 
 
 
495 aa  198  9e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1736  glutamyl-tRNA synthetase  37.42 
 
 
465 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.872954  normal  0.596825 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1302  glutamyl-tRNA synthetase  35.87 
 
 
535 aa  198  1.0000000000000001e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  35.6 
 
 
488 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000204549  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2802  glutamyl-tRNA synthetase  35.69 
 
 
469 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000260001  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1554  glutamyl-tRNA synthetase  35.69 
 
 
469 aa  197  3e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000003282  normal  0.0351282 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  35.92 
 
 
467 aa  196  3e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000050225  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2822  glutamyl-tRNA synthetase  35.69 
 
 
469 aa  197  3e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000059188  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2947  glutamyl-tRNA synthetase  35.69 
 
 
469 aa  197  3e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000528448  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2361  glutamyl-tRNA synthetase  36.62 
 
 
483 aa  197  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000183639  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  35.92 
 
 
467 aa  196  3e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3484  glutamyl-tRNA synthetase  35.96 
 
 
469 aa  197  3e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2499  glutamyl-tRNA synthetase  35.37 
 
 
469 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000172182  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1626  glutamyl-tRNA synthetase  34.75 
 
 
470 aa  195  7e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0744892  normal  0.201462 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2533  glutamyl-tRNA synthetase  36.33 
 
 
473 aa  195  7e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000038789  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1365  glutamyl-tRNA synthetase  36.07 
 
 
469 aa  195  9e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000124879  normal  0.0325353 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1430  glutamyl-tRNA synthetase  36.07 
 
 
469 aa  195  9e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000061517  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  34.09 
 
 
480 aa  195  9e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1418  glutamyl-tRNA synthetase  36.07 
 
 
469 aa  195  9e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000145575  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2856  glutamyl-tRNA synthetase  38.06 
 
 
496 aa  195  1e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1811  glutamate--tRNA(Gln) ligase / glutamyl-tRNA synthetase  43.77 
 
 
477 aa  195  1e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.497016  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  38.11 
 
 
501 aa  195  1e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2309  glutamyl-tRNA synthetase  36.31 
 
 
483 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2533  glutamyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 
467 aa  194  2e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000148885  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2714  glutamyl-tRNA synthetase  35.05 
 
 
469 aa  194  2e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000169422  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3985  glutamate--tRNA ligase  45.6 
 
 
298 aa  194  2e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1146  glutamyl-tRNA synthetase  36.84 
 
 
484 aa  193  3e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0188  glutamate--tRNA(Gln) ligase / glutamyl-tRNA synthetase  35.14 
 
 
881 aa  193  3e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0584  glutamyl-tRNA synthetase  38.26 
 
 
466 aa  193  4e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.779579  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0422  glutamyl-tRNA synthetase  38.26 
 
 
466 aa  193  4e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869081  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  37.86 
 
 
469 aa  193  4e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  35.28 
 
 
491 aa  192  5e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04820  glutamyl-tRNA synthetase  37.63 
 
 
467 aa  192  5e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1234  glutamyl-tRNA synthetase  35.9 
 
 
468 aa  192  6e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.966582  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0456  glutamyl-tRNA synthetase  33 
 
 
466 aa  192  6e-48  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1667  glutamyl-tRNA synthetase  34.29 
 
 
465 aa  192  6e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.194864  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  37.86 
 
 
469 aa  192  6e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1176  glutamyl-tRNA synthetase  36.51 
 
 
487 aa  192  8e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3764  Glutamate--tRNA ligase  43.56 
 
 
297 aa  192  8e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1866  glutamyl-tRNA synthetase  39.13 
 
 
495 aa  192  9e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0953769  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1806  glutamyl-tRNA synthetase  33.44 
 
 
509 aa  192  9e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0531  glutamyl-tRNA synthetase  34.29 
 
 
465 aa  192  9e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0244203  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2779  glutamyl-tRNA synthetase  35.24 
 
 
471 aa  192  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00021769  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1365  glutamyl-tRNA synthetase  36.6 
 
 
484 aa  191  1e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1875  glutamyl-tRNA synthetase  36.07 
 
 
470 aa  191  1e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4302  glutamyl-tRNA synthetase  36.39 
 
 
481 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_52655  glutamyl-trna synthase  37.38 
 
 
588 aa  191  1e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.233509  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0814  glutamyl-tRNA synthetase  38.05 
 
 
468 aa  191  1e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.407873  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2673  glutamyl-tRNA synthetase  34.92 
 
 
471 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0521229  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0414  Glutamate--tRNA ligase  39.14 
 
 
309 aa  191  2e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2207  glutamyl-tRNA synthetase  36.07 
 
 
469 aa  191  2e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000288711  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>